Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A14 F73 I1 R1
|
26 |
65.3 |
2245954 |
99.3% |
2230232 |
139.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,753,977 |
G→T |
S41R (AGC→AGA) |
yiaV ← |
putative membrane fusion protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,753,977 | 0 | G | T | 100.0%
| 255.6
/ NA
| 73 | S41R (AGC→AGA) | yiaV | putative membrane fusion protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (31/42); total (31/42) |
TTAATCAGCGTATTTTTCTTATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCGCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTAAATCCATAAGTATTACTCGGC > NC_000913/3753843‑3754113
|
ttAATCAGCGTATTTTTCTTATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGAc < 1:712157/140‑1 (MQ=255)
tAATCAGCGTATTTTTCTTATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACa < 2:403819/140‑1 (MQ=255)
gCGTATTTTTCTTATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACaataaat > 1:468680/1‑140 (MQ=255)
cGTATTTTTCTTATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACaataaata > 1:95351/1‑140 (MQ=255)
cGTATTTTTCTTATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACaataaata > 2:264704/1‑140 (MQ=255)
tATTTTTCTTATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATAtt < 1:253371/140‑1 (MQ=255)
ttCTTATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCAcc < 2:1058297/140‑1 (MQ=255)
ttATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAg > 1:224217/1‑140 (MQ=255)
tCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGc < 2:95351/140‑1 (MQ=255)
tCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGc < 2:1016144/140‑1 (MQ=255)
tCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGc < 1:433380/140‑1 (MQ=255)
tCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGc < 1:308242/140‑1 (MQ=255)
tCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGc < 2:254671/140‑1 (MQ=255)
cGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCg > 2:171077/1‑140 (MQ=255)
cACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCtg > 2:1103396/1‑140 (MQ=255)
ttCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTgg > 2:146038/1‑140 (MQ=255)
cAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGa < 2:186063/140‑1 (MQ=255)
aaTCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGaa < 1:264704/140‑1 (MQ=255)
aaTCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGaa < 1:388650/140‑1 (MQ=255)
aaTCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGaa < 1:167361/140‑1 (MQ=255)
aaTCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGaa < 2:476457/140‑1 (MQ=255)
tCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATg > 2:233089/1‑140 (MQ=255)
caccaGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCat < 1:20118/140‑1 (MQ=255)
accaGTCACCTGTGGGACAACAGGAGTAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGt > 1:975569/1‑135 (MQ=255)
accaGTCACCTGTGGGACAACAGGAGTAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGt < 2:975569/135‑1 (MQ=255)
caGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCattta > 2:757185/1‑140 (MQ=255)
tCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCatttattt > 1:931567/1‑140 (MQ=255)
aCCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTAc > 2:911120/1‑140 (MQ=255)
cTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACgg < 1:1103396/140‑1 (MQ=255)
tgtgGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACggg > 1:408919/1‑140 (MQ=255)
tgGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATCTATTTACGGGaa > 1:1065628/1‑140 (MQ=255)
ggACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAAtt > 2:851613/1‑140 (MQ=255)
aacaGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGa < 1:757185/140‑1 (MQ=255)
aacaGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGa < 1:33169/140‑1 (MQ=255)
aacaGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGa < 2:843250/140‑1 (MQ=255)
acaGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGaa < 2:78852/140‑1 (MQ=255)
acaGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGaa > 1:162505/1‑140 (MQ=255)
acaGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGaa > 2:1035666/1‑140 (MQ=255)
acaGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGaa > 2:919893/1‑140 (MQ=255)
caGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAg < 2:468680/140‑1 (MQ=255)
caGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAg < 1:1035666/140‑1 (MQ=255)
caGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAg < 2:224217/140‑1 (MQ=255)
caGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAg < 1:919893/140‑1 (MQ=255)
aaTAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACa < 1:171077/140‑1 (MQ=255)
aCCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGc > 2:717381/1‑140 (MQ=255)
ccGCTTTTTGCGCTTTAAAGGAATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTAACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTCAAGATCTTAAACATTGcc > 2:1012484/1‑140 (MQ=255)
tttttGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATg > 1:173855/1‑140 (MQ=255)
ttttGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGc < 1:277392/140‑1 (MQ=255)
ttttGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGc < 1:911120/140‑1 (MQ=255)
tGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCaaa > 1:181509/1‑140 (MQ=255)
tAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCcaca < 2:173855/140‑1 (MQ=255)
aaGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATa < 1:851613/140‑1 (MQ=255)
ataCGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCa < 1:717381/140‑1 (MQ=255)
taCGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCcaca < 1:718241/132‑1 (MQ=255)
taCGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCcaca > 2:718241/1‑132 (MQ=255)
taCGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCaa > 2:188993/1‑140 (MQ=255)
gATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAaata > 2:516096/1‑140 (MQ=255)
tGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAaataat < 1:188993/140‑1 (MQ=255)
ggTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATc > 1:280715/1‑140 (MQ=255)
gTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCa > 2:777802/1‑140 (MQ=255)
gTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCa > 2:1110133/1‑140 (MQ=255)
tataGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGt < 2:408919/140‑1 (MQ=255)
taGTTCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATCTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTaa < 2:1065628/140‑1 (MQ=255)
ttCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTaaa > 2:711738/1‑138 (MQ=255)
ttCATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTaaa < 1:711738/138‑1 (MQ=255)
cATTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTAAATCCa < 2:931567/140‑1 (MQ=255)
aTTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTAAATCCAt < 2:592003/140‑1 (MQ=255)
aTTAACAGAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTAAATCCAt < 2:162505/140‑1 (MQ=255)
gAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGt < 2:83696/125‑1 (MQ=255)
gAATTAGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGt > 1:83696/1‑125 (MQ=255)
aGACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTAAATCCATAAGTATTACTCg < 1:516096/140‑1 (MQ=255)
gACCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTAAATCCATAAGTATTACTCgg < 2:837790/140‑1 (MQ=255)
aCCTCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTAAATCCATAAGTATTACTCGGc > 1:768908/1‑140 (MQ=255)
|
TTAATCAGCGTATTTTTCTTATCCGTCACTTCAATCACCACACCAGTCACCTGTGGGACAACAGGAATAGAAATAACCGCTTTTTGCGCTTTAAAGGTATACGGATGGTTATAGTTCATTAACAGAATTAGACCGCTGACAATAAATATTCCACCCAGGGCCGCTGTGGGAATGGTCCATTTATTTACGGGAATTTTGAAGATCTTAAACATTGCCCATGCAAAAGCCACATAGGTCAAAATAATCAGTAAATCCATAAGTATTACTCGGC > NC_000913/3753843‑3754113
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
