Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A11 F73 I1 R1
|
26 |
148.5 |
5206078 |
99.3% |
5169635 |
139.1 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,860,232 |
G→T |
intergenic (‑116/‑51) |
yidK ← / → yidL |
putative transporter YidK/putative DNA‑binding transcriptional regulator YidL |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,860,232 | 0 | G | T | 100.0%
| 719.5
/ NA
| 197 | intergenic (‑116/‑51) | yidK/yidL | putative transporter YidK/putative DNA‑binding transcriptional regulator YidL |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (103/94); total (103/94) |
Only 100 of 203 total aligned reads displayed.
AAGATTTGTAACGAATTCATCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTGTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTACAATATTCCCTTATTGATTAACGAAAATGTGATCTCCAG > NC_000913/3860097‑3860368
|
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aTTTGTAACGAATTCATCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTg < 1:2285009/140‑1 (MQ=255)
ttGTAACGAATTCATCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGtt < 1:541088/140‑1 (MQ=255)
tAACGAATTCATCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGt < 1:1615631/136‑1 (MQ=255)
aaTTCATCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAg < 1:857130/140‑1 (MQ=255)
ttCATCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGt > 1:1343816/1‑129 (MQ=255)
ttCATCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGt < 1:2475838/140‑1 (MQ=255)
tCATCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGtt < 2:35135/140‑1 (MQ=255)
aTCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTtgt > 1:1762367/1‑140 (MQ=255)
aTCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTtgt > 2:2002368/1‑140 (MQ=255)
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tAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCa > 2:879917/1‑139 (MQ=255)
gCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATaa < 1:2085282/140‑1 (MQ=255)
atttatGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTtg > 2:1423386/1‑125 (MQ=255)
tatgtttatgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGa > 2:11336/1‑140 (MQ=255)
atgtttatgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTtgt > 1:848352/1‑122 (MQ=255)
atgtttatgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAg < 1:1469317/140‑1 (MQ=255)
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tgtttatgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAAtt < 2:1440977/131‑1 (MQ=255)
tgtttatgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAgg > 2:2434515/1‑140 (MQ=255)
tgtttatgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAgg > 2:1328586/1‑140 (MQ=255)
tgtttatgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAgg > 1:1170272/1‑140 (MQ=255)
gtttatgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAggg < 2:453071/140‑1 (MQ=255)
ttatgtCCCGGACGCATGAATATAGGGCGAGGCAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGat > 2:1943191/1‑140 (MQ=255)
atgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGTCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAg < 1:1678193/134‑1 (MQ=255)
atgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGTCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAg > 2:1678193/1‑134 (MQ=255)
atgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAggg > 2:1742272/1‑136 (MQ=255)
atgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGatat > 2:2035875/1‑140 (MQ=255)
tgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATAtt > 2:2395936/1‑140 (MQ=255)
tgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATAtt > 1:2277309/1‑140 (MQ=255)
tgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATAtt > 2:1838059/1‑140 (MQ=255)
tgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATAtt > 2:2228618/1‑140 (MQ=255)
tgtCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGCTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATAtt > 2:581226/1‑140 (MQ=255)
cccGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTaaa < 1:949181/140‑1 (MQ=255)
cccGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTaaa < 1:2002368/140‑1 (MQ=255)
ccGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAggg < 1:1834539/131‑1 (MQ=255)
cGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAaat > 1:1632038/1‑140 (MQ=255)
cGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAaat > 2:1458278/1‑140 (MQ=255)
gACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAg < 2:2346488/126‑1 (MQ=255)
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aTGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGa > 2:321033/1‑140 (MQ=255)
aTGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGa > 1:1533512/1‑140 (MQ=255)
tataGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAAtt > 1:992595/1‑140 (MQ=255)
aGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATGCAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCa < 1:605933/140‑1 (MQ=255)
aGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCa < 2:1490280/140‑1 (MQ=255)
ggAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCaaa > 2:949653/1‑140 (MQ=255)
ggAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCaaa > 1:560613/1‑140 (MQ=255)
ggAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCa > 1:1740478/1‑138 (MQ=255)
agagGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGa > 1:2409183/1‑128 (MQ=255)
agagGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGt > 1:436007/1‑140 (MQ=255)
agagGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGt > 2:2473088/1‑140 (MQ=255)
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gagGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGtt > 2:1291795/1‑140 (MQ=255)
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gagGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGtt < 2:1801710/140‑1 (MQ=255)
gagGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGtt > 1:1409558/1‑140 (MQ=255)
agGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCa < 1:467101/134‑1 (MQ=255)
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agGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTc > 2:851444/1‑140 (MQ=255)
agGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTc > 2:722491/1‑140 (MQ=255)
agGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTc > 1:684375/1‑140 (MQ=255)
ggTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCa > 2:661057/1‑140 (MQ=255)
ggTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCa > 1:861034/1‑140 (MQ=255)
gTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAg > 2:1054166/1‑140 (MQ=255)
gTAAAAAGCGTCCGGTCAAGCAGTCAGATTCTTAAAATGCAAAAGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAg > 2:1001821/1‑140 (MQ=255)
aaaaTGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCa < 2:1574858/130‑1 (MQ=255)
aaaaTGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCa > 1:1574858/1‑130 (MQ=255)
aTGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTa < 2:560613/140‑1 (MQ=255)
gCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTaaa < 2:1628716/140‑1 (MQ=255)
gCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTaaa < 2:801399/140‑1 (MQ=255)
tCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCa < 2:1576066/122‑1 (MQ=255)
tCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCa > 1:1576066/1‑122 (MQ=255)
tCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTaaaaaa > 1:708001/1‑140 (MQ=255)
gTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAg > 2:781311/1‑126 (MQ=255)
gTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAg < 1:781311/126‑1 (MQ=255)
tCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGaaa < 1:821074/140‑1 (MQ=255)
aGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACt < 1:1121385/140‑1 (MQ=255)
aGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACt < 1:1291795/140‑1 (MQ=255)
aGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACt < 2:436007/140‑1 (MQ=255)
aGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACt < 1:1789586/140‑1 (MQ=255)
aGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACt < 2:2267968/140‑1 (MQ=255)
cAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCg < 2:835205/140‑1 (MQ=255)
aGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGt < 1:118818/140‑1 (MQ=255)
aGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGt < 1:1054166/140‑1 (MQ=255)
gTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTa < 2:485707/140‑1 (MQ=255)
gTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTa < 1:2228618/140‑1 (MQ=255)
gTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTa < 2:680951/140‑1 (MQ=255)
ttAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCTGATGTAAAAAACGAAACt > 2:1306994/1‑126 (MQ=255)
ttAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACt < 1:1306994/126‑1 (MQ=255)
aaTACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTACAATATTCCCTTa < 2:595178/140‑1 (MQ=255)
tACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTACAATATTCCCTTAtt > 1:1594556/1‑140 (MQ=255)
aaCGTCGTATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTACAATATTCCCTTATTGAtt > 1:1255111/1‑140 (MQ=255)
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tATCCCTGAACGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTACAATATTCCCTTATTGATTAACGaaa > 1:1880735/1‑140 (MQ=255)
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aaCGGATTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTACAATATTCCCTTATTGATTAACGAAAATGTGAtc > 2:1344206/1‑140 (MQ=255)
aTTTTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTACAATATTCCCTTATTGATTAACGAAAATGTGATCTCCAg < 2:1547734/140‑1 (MQ=255)
|
AAGATTTGTAACGAATTCATCTCATAGCCCTTATTTATGTTTATGTCCCGGACGCATGAATATAGGGAGAGGTAAAATGCGTCGGGTCAGGCAGTCAGATTCTTAAAATACAAACGTCGTATCCCTGAACGGATTGTTTTCTGTTAAGTTCAGGTTGTGAGCATAATTCGCCGGAGGGATATTAAAATGAATGGAAAATTGCAAAGTTCAGATGTAAAAAACGAAACTCCGTACAATATTCCCTTATTGATTAACGAAAATGTGATCTCCAG > NC_000913/3860097‑3860368
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
