Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F28 I1 R1
|
116 |
98.7 |
3298914 |
99.2% |
3272522 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,219,997 |
A→G |
pseudogene (397/2648 nt) |
ycgH → |
putative transporter component, N‑terminal fragment |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,219,997 | 0 | A | G | 98.3%
| 436.3
/ ‑5.7
| 117 | pseudogene (397/2648 nt) | ycgH | putative transporter component, N‑terminal fragment |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base G (81/34); total (82/35) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.11e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 117 total aligned reads displayed.
ATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATAAAACGAACATTGTTAC > NC_000913/1219861‑1220133
|
aTCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCa < 1:1435622/140‑1 (MQ=255)
tCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCAt > 2:947363/1‑140 (MQ=255)
tCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCag < 1:1031319/140‑1 (MQ=255)
cAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCagt > 2:1058461/1‑140 (MQ=255)
aaaCAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCagtcg > 1:563805/1‑140 (MQ=255)
aCAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCagtcgag < 1:369970/140‑1 (MQ=255)
tattatATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGt < 1:1325181/140‑1 (MQ=255)
ataAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCata > 2:1256314/1‑140 (MQ=255)
aaGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGTTAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATAtt > 2:696083/1‑140 (MQ=255)
aaGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATAtt > 2:279214/1‑140 (MQ=255)
aaGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATAtt > 1:1030483/1‑140 (MQ=255)
aaGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATAtt > 1:836725/1‑140 (MQ=255)
aaGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATAtt > 1:83654/1‑140 (MQ=255)
aaGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATAtt > 1:7384/1‑140 (MQ=255)
aaGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATAtt > 2:1492369/1‑140 (MQ=255)
aaGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATAtt > 2:789180/1‑140 (MQ=255)
gcgatagcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCTGGTGGGGCATATTCa > 1:1542944/1‑140 (MQ=255)
gcgatagcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCa > 1:13588/1‑140 (MQ=255)
gcgatagcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCa > 2:1212124/1‑140 (MQ=255)
cgatagcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAg > 2:837467/1‑140 (MQ=255)
atagcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCg > 1:571554/1‑140 (MQ=255)
atagcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCg > 1:481569/1‑140 (MQ=255)
atagcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCg > 2:174136/1‑140 (MQ=255)
atagcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCg > 2:158701/1‑140 (MQ=255)
agcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCggg > 2:129076/1‑140 (MQ=255)
agcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCggg > 2:160903/1‑140 (MQ=255)
agcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCggg > 1:130184/1‑140 (MQ=255)
agcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCggg > 1:624304/1‑140 (MQ=255)
agcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCggg < 1:1240/140‑1 (MQ=255)
agcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCggg > 1:1401972/1‑140 (MQ=255)
agcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCggg > 2:853082/1‑140 (MQ=255)
agcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGT‑GGGCATATTCAGCGGGa > 1:1054301/1‑140 (MQ=255)
agcgataTTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCggg > 1:1189023/1‑140 (MQ=255)
atatTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACtt < 2:852184/140‑1 (MQ=255)
aaGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAg < 1:1266867/140‑1 (MQ=255)
aaGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAg < 1:539/140‑1 (MQ=255)
aGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGc < 1:947363/140‑1 (MQ=255)
gACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGcc > 1:25526/1‑140 (MQ=255)
gACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGcc > 2:1213060/1‑140 (MQ=255)
tctGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGt > 1:556496/1‑140 (MQ=255)
tctGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGt > 1:1124291/1‑140 (MQ=255)
tctGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGt > 2:855196/1‑140 (MQ=255)
ctGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGtt > 1:513759/1‑140 (MQ=255)
ctGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGtt > 1:297302/1‑140 (MQ=255)
tGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGTGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGGTa > 1:803897/1‑140 (MQ=255)
tGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTa > 1:1331519/1‑140 (MQ=255)
tGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTa > 2:722553/1‑140 (MQ=255)
tGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGATa > 2:96232/1‑140 (MQ=255)
gAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAAt > 1:641087/1‑140 (MQ=255)
tATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCt > 2:982274/1‑140 (MQ=255)
tATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCt > 2:488570/1‑140 (MQ=255)
tATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGATAATGATTCt > 2:1180147/1‑140 (MQ=255)
tCTGACAAAGAAAATGGAGGGATGACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGa > 1:1572771/1‑140 (MQ=255)
tCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGa > 2:371733/1‑140 (MQ=255)
tCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGa > 2:744135/1‑140 (MQ=255)
tCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGa > 1:384260/1‑140 (MQ=255)
tCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGa > 1:1541948/1‑140 (MQ=255)
aaGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATg < 1:643111/140‑1 (MQ=255)
aaGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATg < 2:297302/140‑1 (MQ=255)
aaGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATg < 2:856892/140‑1 (MQ=255)
aGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTTATGATTCTGAAAAGATgg > 1:1493801/1‑140 (MQ=255)
aGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATgg > 2:250347/1‑140 (MQ=255)
aaaaTGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTa < 1:158701/140‑1 (MQ=255)
tGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGTCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATa > 2:1141687/1‑140 (MQ=255)
tGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGTTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATa > 1:594282/1‑140 (MQ=255)
tGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATa > 1:834719/1‑140 (MQ=255)
ggAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATaa < 1:33349/140‑1 (MQ=255)
ggAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATaa < 1:18890/140‑1 (MQ=255)
ggATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACAcc < 1:1056410/140‑1 (MQ=255)
ggATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACAcc < 2:571554/140‑1 (MQ=255)
ggATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACAcc > 2:358700/1‑140 (MQ=255)
ggATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACAcc > 2:714930/1‑140 (MQ=255)
agcGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAAc > 2:268499/1‑140 (MQ=255)
agcGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAAc > 1:814752/1‑140 (MQ=255)
agcGCACTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAAc < 2:1189023/140‑1 (MQ=255)
gcgcAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAAcc < 2:1331519/140‑1 (MQ=255)
gcgcAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAAcc > 2:949455/1‑140 (MQ=255)
gcgcAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAAcc > 2:1178204/1‑140 (MQ=255)
cgcAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACca > 1:1262155/1‑140 (MQ=255)
cgcAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACca > 2:1122845/1‑140 (MQ=255)
cgcAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAACCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACca > 2:683196/1‑140 (MQ=255)
gtagtCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGa > 2:400620/1‑140 (MQ=255)
tagtCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGAt > 1:616957/1‑140 (MQ=255)
tagtCAGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGAt < 2:1270988/140‑1 (MQ=255)
cAGTGAATTTGGTGCCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATaaaa < 2:331405/140‑1 (MQ=255)
aGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATAAAAc > 2:1062512/1‑140 (MQ=255)
aGTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATAAAAc > 2:1185581/1‑140 (MQ=255)
gTGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATAAAACg > 1:663895/1‑140 (MQ=255)
tGAATTTGGTGGCGCCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATAAAACGa > 1:237302/1‑140 (MQ=255)
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ATCTTATGGTATTTCTGTTGATAGTCAAAACAAAGTATTATATATAAGCGATAGCGATATTAAGACCTCTGGAAGCGTATCTGACAAAGAAAATGGAGGGATAACAGCCAGCGCAGTAGTCAGTGAATTTGGTGGCACCATCTTTATGAATGGTGATAATTCAGTCGAGTCGGGTGGGGCATATTCAGCGGGACTTTTAAGCCAGGTTAATGATTCTGAAAAGATGGTAAATAACACCCGTCTTGAAACCACAGATAAAACGAACATTGTTAC > NC_000913/1219861‑1220133
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
