Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
162 |
93.0 |
3098984 |
99.0% |
3067994 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,045,291 |
G→A |
P118P (CCG→CCA) |
yeeJ → |
inverse autotransporter adhesin |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,045,291 | 0 | G | A | 100.0%
| 311.7
/ NA
| 90 | P118P (CCG→CCA) | yeeJ | inverse autotransporter adhesin |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base A (49/41); total (49/41) |
TTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCAAGCGGCAAATA > NC_000913/2045155‑2045427
|
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ttGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGca > 1:1242410/1‑140 (MQ=255)
ttGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGca > 2:1394911/1‑140 (MQ=255)
ttGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGca > 1:487124/1‑140 (MQ=255)
tGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGcac > 2:741044/1‑140 (MQ=255)
tGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGcac > 1:687146/1‑140 (MQ=255)
ggAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGcaca > 2:899772/1‑140 (MQ=255)
gAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACaa > 2:1009683/1‑140 (MQ=255)
ttGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAg > 1:1031044/1‑140 (MQ=255)
ttGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAg > 2:7885/1‑140 (MQ=255)
ttGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAg > 2:777974/1‑140 (MQ=255)
ttGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAg > 2:385181/1‑140 (MQ=255)
ttGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAg > 1:766600/1‑140 (MQ=255)
ggAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTg > 1:1361052/1‑140 (MQ=255)
cGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGTACAAGTTAGTG‑aaaaa > 1:1204962/1‑140 (MQ=255)
cccAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑aaaaaaaa > 1:101045/1‑140 (MQ=255)
cAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAAtt < 2:615562/140‑1 (MQ=255)
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tGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCccgc > 1:708637/1‑140 (MQ=255)
tGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCccgc > 1:489838/1‑140 (MQ=255)
tGCAGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTTCGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAATTAACTG‑AAAAAAAATTAACCccgc < 2:1233540/140‑1 (MQ=255)
ccGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCccgccg < 2:840651/140‑1 (MQ=255)
ccGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCccgccg < 2:1343995/140‑1 (MQ=255)
ccGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCccgccg < 2:510788/140‑1 (MQ=255)
cGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCccgccgc < 2:1115922/140‑1 (MQ=255)
aaCGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCccgccgccg < 2:162825/140‑1 (MQ=255)
aaCGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCccgccgccg < 1:797980/140‑1 (MQ=255)
gTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGt < 1:505298/140‑1 (MQ=255)
gTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGt < 1:7885/140‑1 (MQ=255)
tttCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTa < 1:737651/140‑1 (MQ=255)
ttCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTaa < 1:235608/140‑1 (MQ=255)
ttCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTaa < 1:48782/140‑1 (MQ=255)
ttCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTaa > 2:423455/1‑140 (MQ=255)
gTATTTCGGTGGCTGTGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGc < 2:719878/140‑1 (MQ=255)
gTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGc < 1:428317/140‑1 (MQ=255)
cGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGAc > 1:1066583/1‑140 (MQ=255)
cGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGAc > 2:694421/1‑140 (MQ=255)
cGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGCGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGAc > 2:236534/1‑140 (MQ=255)
ggTGGCTGAGTTAGGCAAGCTCCACTAGTTTCGTTCGATTGCTCGAGGTTTTAATAATGTCCACCAGGGCGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACa < 2:1358452/140‑1 (MQ=255)
ggCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAAcc < 2:186774/140‑1 (MQ=255)
tGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCg > 1:838775/1‑140 (MQ=255)
aGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAg < 1:115569/140‑1 (MQ=255)
gTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGc < 1:906663/140‑1 (MQ=255)
cGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTGAAAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAAc < 1:1394911/140‑1 (MQ=255)
gCAAACTCAACCAGTTTTGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAg < 1:301397/140‑1 (MQ=255)
gCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAg < 1:1009683/140‑1 (MQ=255)
gCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAg < 1:899772/140‑1 (MQ=255)
aaCTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCGCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATa < 2:734612/140‑1 (MQ=255)
cTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGc < 1:480138/140‑1 (MQ=255)
cTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGGCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGc < 2:1370182/140‑1 (MQ=255)
aaCCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAg < 2:253272/140‑1 (MQ=255)
ccAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGCTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTa > 1:265371/1‑140 (MQ=255)
gTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACtt < 1:426778/140‑1 (MQ=255)
tttCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTc > 1:571260/1‑140 (MQ=255)
tttCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTc > 2:781797/1‑140 (MQ=255)
tACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGc > 2:512871/1‑140 (MQ=255)
aCGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCa > 1:485469/1‑140 (MQ=255)
tttGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAAt > 2:699941/1‑140 (MQ=255)
tttGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAAt < 1:385181/140‑1 (MQ=255)
ttGCTCGAGGCTTTGATAATGTCCGCCAGGGCGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATc > 2:190908/1‑140 (MQ=255)
tGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCg > 1:805807/1‑140 (MQ=255)
cTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCggg > 1:358913/1‑140 (MQ=255)
cTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCggg > 1:1337510/1‑140 (MQ=255)
tttGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCt < 2:487124/140‑1 (MQ=255)
ttGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTc > 2:382325/1‑140 (MQ=255)
tGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCg < 2:838775/140‑1 (MQ=255)
tAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAGCCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCg < 2:1242410/140‑1 (MQ=255)
tAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCg < 1:1115827/140‑1 (MQ=255)
tAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCg < 2:101045/140‑1 (MQ=255)
tAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCg < 1:967711/140‑1 (MQ=255)
tAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCg < 2:240593/140‑1 (MQ=255)
tAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCg < 2:1361052/140‑1 (MQ=255)
tAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCg < 2:1544230/140‑1 (MQ=255)
tAATGTCCGCCAGGGTGAGGAACTGGATGTCCCAGGACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACATCCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCg < 2:1031044/140‑1 (MQ=255)
aTGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGaa > 2:351611/1‑140 (MQ=255)
aTGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGaa < 1:1541988/140‑1 (MQ=255)
gTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGa > 2:688995/1‑140 (MQ=255)
gTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGa > 1:171942/1‑140 (MQ=255)
gTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGa > 2:344939/1‑140 (MQ=255)
tCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGat < 1:867478/140‑1 (MQ=255)
cGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGatat > 1:655562/1‑140 (MQ=255)
cAGGGTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGaa < 2:766600/140‑1 (MQ=255)
ggTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAg > 1:702570/1‑140 (MQ=255)
ggTGATGAACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAg > 1:364945/1‑140 (MQ=255)
tgatgaACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCg > 2:584257/1‑140 (MQ=255)
gaACTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCa < 1:269088/140‑1 (MQ=255)
aaCTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCaa > 2:11622/1‑140 (MQ=255)
cTGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCAAGc > 1:1176915/1‑140 (MQ=255)
tGGATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCAAGCg > 2:925745/1‑140 (MQ=255)
ggATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCAAGCgg > 1:1183984/1‑140 (MQ=255)
ggATGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCAAGCgg > 1:746132/1‑140 (MQ=255)
tGTCCCAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCAAGCGGCaa > 2:889839/1‑140 (MQ=255)
cccAGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCAAGCGGCAAata < 2:265371/140‑1 (MQ=255)
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TTGGAGCGTTGGAATCGGCCCAAAGCGTTGCCGAACGTTTCGGTATTTCGGTGGCTGAGTTACGCAAACTCAACCAGTTTCGTACGTTTGCTCGAGGTTTTGATAATGTCCGCCAGGGTGATGAACTGGATGTCCCGGCACAAGTTAGTG‑AAAAAAAATTAACCCCGCCGCCGGGTAATAGCAGTGACAACCTCGAGCAACAGATAGCCAGTACTTCACAGCAAATCGGGTCTCTGCTCGCCGAAGATATGAACAGCGAGCAAGCGGCAAATA > NC_000913/2045155‑2045427
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
