Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F28 I1 R1
|
162 |
93.0 |
3098984 |
99.0% |
3067994 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,865,053 |
(C)6→5 |
intergenic (+41/‑48) |
ygbM → / → ygbN |
putative 2‑oxo‑tetronate isomerase YgbM/putative transporter YgbN |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,865,048 | 0 | C | . | 99.0%
| 442.1
/ ‑2.3
| 102 | intergenic (+36/‑53) | ygbM/ygbN | putative 2‑oxo‑tetronate isomerase YgbM/putative transporter YgbN |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base . (48/53); total (48/54) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.10e-01 |
Only 100 of 112 total aligned reads displayed.
CGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAACC > NC_000913/2864911‑2865183
|
cGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATccc < 1:672048/140‑1 (MQ=255)
cGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATccc < 1:614706/140‑1 (MQ=255)
cGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGAGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATccc < 2:867724/140‑1 (MQ=255)
gCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATcccc < 2:1517850/140‑1 (MQ=255)
ccTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATccccc > 1:559608/1‑140 (MQ=255)
ttCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATcccccatct < 2:153858/140‑5 (MQ=255)
gATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACg < 2:520226/140‑1 (MQ=255)
gATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACg < 1:532944/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACgg < 1:1018879/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACgg < 2:674807/140‑1 (MQ=255)
aTGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACgg < 2:402949/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGa < 1:1468344/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGa < 1:1381498/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGa < 1:1312043/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGa > 1:680033/1‑140 (MQ=255)
tGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGa < 1:986255/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGa < 2:1332372/140‑1 (MQ=255)
tGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGa < 2:40009/140‑1 (MQ=255)
gTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATggg < 1:1026267/140‑1 (MQ=255)
tGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATgggg > 1:36101/1‑140 (MQ=255)
tGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATgggg > 1:372374/1‑140 (MQ=255)
ggATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATA‑‑‑CCCCCCATCTACGGATGGGGTAgg < 2:18063/140‑1 (MQ=255)
atatCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAgg > 1:959612/1‑140 (MQ=255)
atatCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAgg < 1:777750/140‑1 (MQ=255)
tatCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGt < 1:108246/140‑1 (MQ=255)
tatCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGt > 1:805028/1‑140 (MQ=255)
tatCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGt > 1:64826/1‑140 (MQ=255)
atCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGtt < 2:1358261/140‑1 (MQ=255)
atCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGtt < 2:832848/140‑1 (MQ=255)
cAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTaa > 1:475363/1‑140 (MQ=255)
cAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTaa > 2:210939/1‑140 (MQ=255)
aGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAAc > 2:491171/1‑140 (MQ=255)
gggCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACt > 1:114512/1‑140 (MQ=255)
gggCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACt > 2:666500/1‑140 (MQ=255)
gggCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACt > 1:1501881/1‑140 (MQ=255)
gggCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACt > 1:284717/1‑140 (MQ=255)
gCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACtat > 2:1116829/1‑140 (MQ=255)
cTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGGCGGTTAACtata > 2:156741/1‑140 (MQ=255)
cTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTGGACGCGTGGCGCTAATTCGTGAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACtata > 2:598757/1‑140 (MQ=255)
gTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAg > 2:1508105/1‑140 (MQ=255)
gTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAg > 1:1279229/1‑140 (MQ=255)
gTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAg > 2:1029809/1‑140 (MQ=255)
ttGTGAATATAAGCCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGa < 2:818573/140‑1 (MQ=255)
ttGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGa < 1:812930/140‑1 (MQ=255)
ttGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGa < 1:1123068/140‑1 (MQ=255)
ttGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGa < 1:1211085/140‑1 (MQ=255)
tgtgAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGAc < 2:1494107/140‑1 (MQ=255)
taAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTc > 1:727168/1‑140 (MQ=255)
aaaCCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTcc > 2:1011338/1‑140 (MQ=255)
aaCCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTccc < 2:1302986/140‑1 (MQ=255)
aaCCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTccc < 2:1501881/140‑1 (MQ=255)
ccTCGTTGCTTGACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTGTGACGACTGGCGCTAATTCGTTAAAACCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CGCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCAAt < 2:928721/140‑1 (MQ=255)
cGTGGTCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTc > 1:1400616/1‑140 (MQ=255)
cGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTc < 2:1151122/140‑1 (MQ=255)
gTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACGGGGTTTCCCATGTcc > 1:625921/1‑140 (MQ=255)
gTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTcc > 2:506413/1‑140 (MQ=255)
gTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTcc > 1:170681/1‑140 (MQ=255)
gTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTcc > 1:70220/1‑140 (MQ=255)
tGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCca < 2:779566/140‑1 (MQ=255)
tGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCca < 2:114512/140‑1 (MQ=255)
tGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCca < 1:1293823/140‑1 (MQ=255)
cACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTa < 1:113340/140‑1 (MQ=255)
cACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTa < 2:372374/140‑1 (MQ=255)
cACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTa > 1:1032104/1‑140 (MQ=255)
cACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTa < 2:959612/140‑1 (MQ=255)
cACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTa < 2:1121108/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACa < 2:1438115/140‑1 (MQ=255)
ccGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACa < 2:492422/140‑1 (MQ=255)
aagGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTa < 1:1029809/140‑1 (MQ=255)
ggCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGc < 2:1279229/140‑1 (MQ=255)
ggCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGc > 1:1189797/1‑140 (MQ=255)
cTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCAt > 1:1242822/1‑140 (MQ=255)
tGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTg > 1:809471/1‑140 (MQ=255)
gTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAg < 2:680033/140‑1 (MQ=255)
cGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCg < 1:210939/140‑1 (MQ=255)
cGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCg > 2:379035/1‑140 (MQ=255)
cTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTAC‑GATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAAt < 1:117350/140‑1 (MQ=255)
tGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAAt > 1:939212/1‑140 (MQ=255)
tGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAAt < 2:727168/140‑1 (MQ=255)
cgcTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCAt < 2:948909/140‑1 (MQ=255)
aaTCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGctgctg < 2:1242822/140‑1 (MQ=255)
aaTCCCTAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGctgctg > 2:585236/1‑140 (MQ=255)
tAATTACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGtcatc < 1:1246776/140‑1 (MQ=255)
ttACAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAg < 1:1116829/140‑1 (MQ=255)
aCAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGc < 2:1322782/140‑1 (MQ=255)
aCAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGc < 1:379035/140‑1 (MQ=255)
aCAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGc < 1:506413/140‑1 (MQ=255)
cAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACGGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCa < 2:625921/140‑1 (MQ=255)
cAACGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCa < 2:1189797/140‑1 (MQ=255)
aaCGTACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCTAGGCaa > 2:84643/1‑140 (MQ=255)
tACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGt < 2:1170703/140‑1 (MQ=255)
tACCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGt > 1:434792/1‑140 (MQ=255)
aCCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTa > 1:805766/1‑140 (MQ=255)
aCCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTa > 2:753280/1‑140 (MQ=255)
aCCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTa > 1:35096/1‑140 (MQ=255)
aCCCATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTa > 1:877310/1‑140 (MQ=255)
cccATACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTAc > 1:832440/1‑140 (MQ=255)
aTACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAAc > 1:202859/1‑140 (MQ=255)
aTACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAAc > 2:518548/1‑140 (MQ=255)
tACAT‑CCCCCATCTACGGATGGGGGAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGGCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAAcc > 2:1398547/1‑140 (MQ=255)
|
CGCCTGTTCGATGAGGTGGGATATCAGGGCTGGATCGGTTGTGAATATAAACCTCGTGGCCTCACCGAAGAAGGGCTTGGCTGGTTTGACGCCTGGCGCTAATTCGTTAAATCCCTAATTACAACGTACCCATACATCCCCCCATCTACGGATGGGGTAGGTTAACTATAACTTTCAGACAGGGTTTCCCATGTCCACAATTACATTGTTATGCATTGCGTTAGCTGGCGTAATCATGCTGTTGCTGCTGGTCATCAAGGCAAAGGTACAACC > NC_000913/2864911‑2865183
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
