Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F28 I1 R1
|
108 |
95.2 |
3177646 |
99.2% |
3152224 |
139.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,840,018 |
A→G |
intergenic (‑25/‑197) |
nlpA ← / → yicS |
lipoprotein‑28/uncharacterized protein YicS |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,840,018 | 0 | A | G | 100.0%
| 340.6
/ NA
| 89 | intergenic (‑25/‑197) | nlpA/yicS | lipoprotein‑28/uncharacterized protein YicS |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base G (50/39); total (50/39) |
CGCCAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTACCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCGTACAGCATGATGAG > NC_000913/3839882‑3840153
|
cGCCAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCt < 2:69977/140‑1 (MQ=255)
cGCCAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCt < 1:95814/140‑1 (MQ=255)
cGCCAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCt > 1:1323035/1‑140 (MQ=255)
ccAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGa < 2:1045523/140‑1 (MQ=255)
cAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGAc > 2:619433/1‑140 (MQ=255)
cAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGAc > 1:586314/1‑140 (MQ=255)
cAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGAc > 1:616303/1‑140 (MQ=255)
cAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGAc > 2:102414/1‑140 (MQ=255)
aaCTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACt > 2:896413/1‑140 (MQ=255)
aaCTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACt > 2:1470974/1‑140 (MQ=255)
cTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACtat < 1:339242/140‑1 (MQ=255)
tgtgTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGt < 1:15949/140‑1 (MQ=255)
ttttGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAgg > 1:293267/1‑140 (MQ=255)
ttttGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAgg > 2:1044244/1‑140 (MQ=255)
ttGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTc > 1:1567935/1‑140 (MQ=255)
ctgctACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTTCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGt < 2:1089442/140‑1 (MQ=255)
ctgctACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGt > 1:573339/1‑140 (MQ=255)
ctgctACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGt > 1:1235809/1‑140 (MQ=255)
ctgctACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGt > 1:576618/1‑140 (MQ=255)
ctACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTa > 2:1398781/1‑140 (MQ=255)
gTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacga > 1:1569809/1‑140 (MQ=255)
gTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacga > 2:310709/1‑140 (MQ=255)
gTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacga > 1:1060931/1‑140 (MQ=255)
gTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacga > 2:395463/1‑140 (MQ=255)
gTCCCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCCGTCCGCAGATGATGCGACGACAGCTTCATTTTTTGATCCTTTTATTACCGATCCCCTGACTATAGCGGCAACGCCGCTGCGGCTTAAAaaacga > 2:458516/1‑140 (MQ=255)
tCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacgaa < 2:1430137/140‑1 (MQ=255)
cGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCt > 1:39251/1‑122 (MQ=255)
cGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCt < 2:39251/122‑1 (MQ=255)
cGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacgaaa < 2:1093739/140‑1 (MQ=255)
cGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacgaaa < 1:516556/140‑1 (MQ=255)
cGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacgaaa < 1:1118901/140‑1 (MQ=255)
cGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacgaaa < 1:271636/140‑1 (MQ=255)
cGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacgaaa < 1:1362997/140‑1 (MQ=255)
cGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacgaaa < 2:1370709/140‑1 (MQ=255)
cAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacgaaacg < 1:619433/140‑1 (MQ=255)
cAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAaaacgaaacg < 1:102414/140‑1 (MQ=255)
aaCCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGc > 2:89666/1‑140 (MQ=255)
aaCCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGc > 1:88787/1‑140 (MQ=255)
ccTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTa < 2:1494892/140‑1 (MQ=255)
ccTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTa < 2:40654/140‑1 (MQ=255)
ccTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTa < 1:862826/140‑1 (MQ=255)
gCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCg > 1:972039/1‑140 (MQ=255)
cagcatAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGAt < 1:1382580/140‑1 (MQ=255)
cagcagAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGAt < 1:1044244/140‑1 (MQ=255)
aaTTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAAt > 1:36598/1‑140 (MQ=255)
gCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGCTGGGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGAAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGCATAAAAAgg > 2:1567662/1‑140 (MQ=255)
gCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAgg > 1:1399415/1‑140 (MQ=255)
taatGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAg > 1:367071/1‑140 (MQ=255)
atGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTg < 1:1470974/140‑1 (MQ=255)
atGCGGACCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTg < 2:293267/140‑1 (MQ=255)
tGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTgg < 1:1192462/140‑1 (MQ=255)
cGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGaa > 2:1491672/1‑140 (MQ=255)
ccccTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAatat > 1:534551/1‑140 (MQ=255)
ccccTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAatat > 1:1108672/1‑140 (MQ=255)
ccccTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAatat > 1:866357/1‑140 (MQ=255)
cccTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAAtata < 2:616303/140‑1 (MQ=255)
tGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTGTTTTATCCTTCTATTAATGATTGCCTGACTATAAAGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAg < 2:857838/140‑1 (MQ=255)
cGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTg < 2:576618/140‑1 (MQ=255)
gatgatGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCAc < 2:522881/140‑1 (MQ=255)
gatgatGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCAc < 2:63870/140‑1 (MQ=255)
gatgatGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCAc < 2:436697/140‑1 (MQ=255)
gatgatGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCAc < 1:296504/140‑1 (MQ=255)
gatgatGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCAc < 1:1583279/140‑1 (MQ=255)
atgTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCActtct > 2:1265722/1‑140 (MQ=255)
atgTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCActtct > 2:136227/1‑140 (MQ=255)
atgTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCActtct > 2:442287/1‑140 (MQ=255)
atgTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCActtct > 1:1178169/1‑140 (MQ=255)
atgTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCActtct > 1:1191608/1‑140 (MQ=255)
gtgtTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTa < 2:41545/140‑1 (MQ=255)
tgttgtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTAc > 1:770226/1‑140 (MQ=255)
gttgtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACt > 1:115697/1‑140 (MQ=255)
ttgtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTg > 2:1343745/1‑140 (MQ=255)
ttgtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTg > 1:191928/1‑140 (MQ=255)
ttgtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTg > 1:87642/1‑140 (MQ=255)
ttgtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTg > 1:1305733/1‑140 (MQ=255)
ttgtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTg > 1:1323042/1‑140 (MQ=255)
tgtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGa > 1:1564730/1‑140 (MQ=255)
tgtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGa > 1:1169183/1‑140 (MQ=255)
gtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGAc > 1:1380771/1‑140 (MQ=255)
gtCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGAc > 1:317352/1‑140 (MQ=255)
gtCAGTTTCATTTATTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGAAAGGTCGCAGCGGTATAAAAAACCAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAGAGTGGAATATAAAGACTGGCACTTCTTACTGAc > 2:153781/1‑140 (MQ=255)
tCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGAcc > 2:384271/1‑140 (MQ=255)
aGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCAc > 1:1471351/1‑140 (MQ=255)
gTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACg > 2:102728/1‑140 (MQ=255)
gTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACg > 2:1399261/1‑140 (MQ=255)
ttCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCa > 2:496169/1‑140 (MQ=255)
aTTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAgc < 2:1399415/140‑1 (MQ=255)
aTCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCTCTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCg < 2:1060931/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCGt < 2:573339/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCGt < 2:1567935/140‑1 (MQ=255)
tCCTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCGt < 1:896413/140‑1 (MQ=255)
cTTTTATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCGTAc < 2:1191608/140‑1 (MQ=255)
tttATTAATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCGTACAg < 2:972039/140‑1 (MQ=255)
ttattaATGATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCGTACAGc < 2:367071/140‑1 (MQ=255)
gATTGCCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCGTACAGCATGATgag < 1:102728/140‑1 (MQ=255)
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CGCCAACTTTAATGTGTTTTGCATCGCTGCTACTCTGGTCGCAACCTGCCAGCAGAATTCCGGCCAGCAATAATGCGGCCCCTGTCCGTAGATGATGTGTTGTCAGTTTCATTTTTTTATCCTTTTATTAATGATTACCTGACTATAGCGGTAAGGTCGCTGCGGTTTAAAAAACGAAACGCTATCGATAAGAATAAAAAGGAATAAAAGTGGAATATAAAGTCTGGCACTTCTTACTGACCACGCAAGCGCGTTTCGTACAGCATGATGAG > NC_000913/3839882‑3840153
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
