Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A42 F60 I1 R1
|
20 |
78.9 |
2679734 |
98.6% |
2642217 |
138.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,419,842 |
A→C |
intergenic (‑217/‑138) |
ulaG ← / → ulaA |
L‑ascorbate‑6‑phosphate lactonase/L‑ascorbate specific PTS enzyme IIC component |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,419,842 | 0 | A | C | 100.0%
| 422.5
/ NA
| 109 | intergenic (‑217/‑138) | ulaG/ulaA | L‑ascorbate‑6‑phosphate lactonase/L‑ascorbate specific PTS enzyme IIC component |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (52/57); total (52/57) |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
CAATGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGT > NC_000913/4419708‑4419978
|
cAATGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCAt < 1:13945/140‑1 (MQ=255)
cAATGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCAt < 2:1086305/140‑1 (MQ=255)
aTGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCAtgt < 1:769172/140‑1 (MQ=255)
aTGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCAtgt < 2:632843/140‑1 (MQ=255)
tGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCAtgtg > 1:7660/1‑140 (MQ=255)
ttttttGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAatta > 2:1110644/1‑140 (MQ=255)
gACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCg > 2:570971/1‑140 (MQ=255)
cTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCggg > 2:578095/1‑140 (MQ=255)
cTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCggg > 1:451754/1‑140 (MQ=255)
ttttGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTc > 2:397171/1‑140 (MQ=255)
tttGCCAGTGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTcg > 2:1000270/1‑140 (MQ=255)
tttGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTcg > 2:381785/1‑140 (MQ=255)
gAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACAtt < 1:1142365/140‑1 (MQ=255)
gAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACAtt < 2:350182/140‑1 (MQ=255)
gttgttgttGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTaa < 1:924779/140‑1 (MQ=255)
ttgttgttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAAt < 2:188514/140‑1 (MQ=255)
tgttgttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATc < 2:898389/140‑1 (MQ=255)
gttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCataa > 1:1331174/1‑140 (MQ=255)
ttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCataaa < 2:622951/140‑1 (MQ=255)
ttgATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCataaa < 1:1034475/140‑1 (MQ=255)
aTTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCataaataa > 2:153484/1‑140 (MQ=255)
aTTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCataaataa > 2:141280/1‑140 (MQ=255)
ttttGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAaataat < 2:1068961/140‑1 (MQ=255)
tttGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATc > 2:586107/1‑140 (MQ=255)
tGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCtt < 1:1110832/140‑1 (MQ=255)
tGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCtt < 1:544287/140‑1 (MQ=255)
gAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCttg < 1:369349/140‑1 (MQ=255)
gAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCttg < 1:578095/140‑1 (MQ=255)
tGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTtgtg > 2:75268/1‑140 (MQ=255)
gAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGAt < 1:105595/140‑1 (MQ=255)
gATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACt > 2:746430/1‑140 (MQ=255)
tttAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACttt > 2:1149666/1‑140 (MQ=255)
ttAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACtttt < 1:1325237/140‑1 (MQ=255)
aaTGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGa > 2:414902/1‑140 (MQ=255)
aaTGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGa < 2:7660/140‑1 (MQ=255)
tgtgTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGAt > 1:452295/1‑124 (MQ=255)
tgtgTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGAt < 2:452295/124‑1 (MQ=255)
tgtgTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTag < 1:15399/140‑1 (MQ=255)
gtgtAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTaga > 1:211636/1‑140 (MQ=255)
gtAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAgagt < 1:153484/140‑1 (MQ=255)
tAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACtttt < 2:1228932/127‑1 (MQ=255)
tAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACtttt > 1:1228932/1‑127 (MQ=255)
aaTTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAgagtga < 2:112382/140‑1 (MQ=255)
ttCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAgagtgagt > 2:386736/1‑140 (MQ=255)
ttCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAgagtgagt < 1:85340/140‑1 (MQ=255)
ttCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAgagtgagt > 2:838882/1‑140 (MQ=255)
cAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGc < 2:1180362/140‑1 (MQ=255)
aTTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGTGTGcac < 2:1312710/140‑1 (MQ=255)
aTTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGcac < 1:838882/140‑1 (MQ=255)
aTTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGcac < 1:141280/140‑1 (MQ=255)
ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTag < 2:674500/128‑1 (MQ=255)
ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTag > 1:674500/1‑128 (MQ=255)
ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGcaca > 1:1000343/1‑140 (MQ=255)
ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGcaca > 2:1052453/1‑140 (MQ=255)
ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGcaca > 1:707323/1‑140 (MQ=255)
ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGcaca > 1:69315/1‑140 (MQ=255)
ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGcaca > 1:907307/1‑140 (MQ=255)
ttAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGcaca > 1:891782/1‑140 (MQ=255)
tAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCacaa < 1:586107/140‑1 (MQ=255)
tAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCacaa < 1:414902/140‑1 (MQ=255)
tAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCacaa < 1:386736/140‑1 (MQ=255)
cTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACAt < 1:381785/140‑1 (MQ=255)
aaTTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGgt < 1:828515/140‑1 (MQ=255)
tttAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGgtgt > 2:535790/1‑140 (MQ=255)
tttAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGgtgt > 1:424463/1‑140 (MQ=255)
aaTGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTgg > 2:369976/1‑140 (MQ=255)
gATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATa < 2:891782/140‑1 (MQ=255)
gATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATa < 2:907307/140‑1 (MQ=255)
aTAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATAc < 2:451754/140‑1 (MQ=255)
aaTTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGAAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATAccc > 1:881189/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCgg > 2:1079584/1‑140 (MQ=255)
ttGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCgg > 2:111779/1‑140 (MQ=255)
gTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGtt < 1:783297/140‑1 (MQ=255)
tCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTAcc > 1:1128904/1‑140 (MQ=255)
tCGTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTAcc > 1:387426/1‑140 (MQ=255)
gTTGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACctc < 1:78293/140‑1 (MQ=255)
ttGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACctct > 1:149842/1‑140 (MQ=255)
ttGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACctct > 2:1062294/1‑140 (MQ=255)
ttGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACctct < 1:1079584/140‑1 (MQ=255)
ttGTGTGAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACctct > 2:773134/1‑140 (MQ=255)
gtgtgAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCtcttc > 2:915549/1‑140 (MQ=255)
gtgtgAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCtcttc > 1:1285570/1‑140 (MQ=255)
tgtgAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCtcttct > 2:585599/1‑140 (MQ=255)
tgtgAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCtcttct > 2:674781/1‑140 (MQ=255)
gtgAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTcttctt < 2:49264/140‑1 (MQ=255)
gtgAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTcttctt > 1:987936/1‑140 (MQ=255)
tgAATCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTAcc < 1:554463/132‑1 (MQ=255)
tCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGga < 1:1149666/140‑1 (MQ=255)
tCCCACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGga < 1:75268/140‑1 (MQ=255)
cccACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGgag < 1:1062294/140‑1 (MQ=255)
ccACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGgaga < 1:923786/140‑1 (MQ=255)
ccACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGgaga < 1:746430/140‑1 (MQ=255)
cACTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGAt < 2:149842/140‑1 (MQ=255)
aCTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCtcttct < 2:752425/130‑1 (MQ=255)
aCTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCtcttct > 1:752425/1‑130 (MQ=255)
aCTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATc > 2:699136/1‑140 (MQ=255)
aCTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATc > 2:875771/1‑140 (MQ=255)
aCTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATc > 2:1332725/1‑140 (MQ=255)
aCTCTCTCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATc < 2:211636/140‑1 (MQ=255)
tctctcCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGt < 1:111779/140‑1 (MQ=255)
|
CAATGACCATTTTTTGACTTTTTGCCAGGGAAGTTGTTGTTGATTTTGAGTATGGAAAGATTTAATGGAATGTGTAATTCAATTAACTAAATGAATTTAAATGGATAATTGTTTCGTTGTGTGAATCCCACTCTATCCATGTGGAATTATTTGCGGGTCGCGTCACATTTAATCATAAATAATCTTGTTGTGATTACTTTTGAAAATTAGAGTGAGTGCACAACATTCCGGGTGTGTGGAATACCCGGTTACCTCTTCTTCAGGAGATCGT > NC_000913/4419708‑4419978
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
