Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F60 I1 R1
|
26 |
145.4 |
4915572 |
98.9% |
4861500 |
138.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,205,114 |
C→A |
G273V (GGC→GTC) |
purD ← |
phosphoribosylamine‑‑glycine ligase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,205,114 | 0 | C | A | 99.1%
| 363.8
/ NA
| 106 | G273V (GGC→GTC) | purD | phosphoribosylamine‑‑glycine ligase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/1); new base A (50/55); total (50/56) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 110 total aligned reads displayed.
TTGCTTTCACAGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGT > NC_000913/4204979‑4205253
|
ttGCTTTCACAGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACcgc < 2:2375737/140‑1 (MQ=255)
cTTTCACAGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTa > 2:892527/1‑140 (MQ=255)
cTTTCACAGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTa > 1:1834077/1‑140 (MQ=255)
cTTTCACAGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTa > 2:1482365/1‑140 (MQ=255)
cacaGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAgaga > 1:505392/1‑140 (MQ=255)
caGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGaaa > 1:2028391/1‑140 (MQ=255)
aGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGaaaa < 2:2028391/140‑1 (MQ=255)
aGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGaaaa < 1:654890/140‑1 (MQ=255)
ggCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAAc < 1:1132758/140‑1 (MQ=255)
ggCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAAc < 2:2200948/140‑1 (MQ=255)
ggCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAAc < 1:1451830/140‑1 (MQ=255)
gccgccAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAAc < 1:188719/139‑1 (MQ=255)
gccgccAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAAc > 2:188719/1‑139 (MQ=255)
ccgccAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCg > 1:1031166/1‑140 (MQ=255)
gccAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGgt < 1:1941956/140‑1 (MQ=255)
ccAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGgtg > 2:2182420/1‑140 (MQ=255)
cAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGgtgt < 2:1548959/140‑1 (MQ=255)
agCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGtt > 2:1196600/1‑140 (MQ=255)
cTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGc > 2:2085867/1‑140 (MQ=255)
tCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGcc < 2:2026210/140‑1 (MQ=255)
aaCCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCtt > 1:1049271/1‑140 (MQ=255)
aCCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTc < 1:998009/140‑1 (MQ=255)
cGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCgccgcc < 1:1314624/140‑1 (MQ=255)
cGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCgccgcc < 1:2182420/140‑1 (MQ=255)
ggACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCa < 1:747712/140‑1 (MQ=255)
ggACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCa < 1:141138/140‑1 (MQ=255)
gACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCAt > 1:1619025/1‑140 (MQ=255)
aCTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATg < 1:1074911/140‑1 (MQ=255)
cTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGACCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGCCGATCATCAGGACCGAGTAGAGAAATCCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGc < 2:1260229/140‑1 (MQ=255)
ttCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGcc > 1:1186242/1‑140 (MQ=255)
cATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCtt > 1:881952/1‑140 (MQ=255)
aTGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATGGCGAAAGCGGCAGTTAAATTCAATATCCTTCGGATTGCCCTTTTTGTCGATCATAAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTGGCCTTCCGCCGCCATGCCttt < 2:359694/140‑1 (MQ=255)
aTGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCttt < 2:1350081/140‑1 (MQ=255)
aTGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCttt > 1:1679443/1‑140 (MQ=255)
aTGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCttt > 1:481227/1‑140 (MQ=255)
aTGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCttt > 2:1989701/1‑140 (MQ=255)
tGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTc > 1:1976633/1‑140 (MQ=255)
gcagcaTAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACg > 2:286811/1‑140 (MQ=255)
cagcaTAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACgg > 2:391793/1‑140 (MQ=255)
cagcaTAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACgg > 1:615652/1‑140 (MQ=255)
gcaTAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGtt > 2:1393955/1‑140 (MQ=255)
aTAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTgg < 1:1482365/140‑1 (MQ=255)
aTAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTgg < 1:1965170/140‑1 (MQ=255)
aTAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTACCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTgg > 1:2026883/1‑140 (MQ=255)
tAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGc < 2:1186242/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGc < 1:391793/140‑1 (MQ=255)
tAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGc < 1:1886297/140‑1 (MQ=255)
aaTCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGcc < 1:1592691/140‑1 (MQ=255)
gCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGata < 1:2184795/140‑1 (MQ=255)
gCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGata < 2:1679443/140‑1 (MQ=255)
cTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGataa < 1:286811/140‑1 (MQ=255)
tGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGataat < 2:489657/140‑1 (MQ=255)
tGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGataat > 2:399688/1‑140 (MQ=255)
tGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGataat > 1:489657/1‑140 (MQ=255)
ggTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATAc < 2:306912/140‑1 (MQ=255)
ggTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATAc < 2:1031166/140‑1 (MQ=255)
taTCGCCAAAGCGGCTGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGCCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGATGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATg < 1:1836734/139‑1 (MQ=255)
gCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGataat > 2:796591/1‑126 (MQ=255)
gCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGataat < 1:796591/126‑1 (MQ=255)
gCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTgc < 1:892527/140‑1 (MQ=255)
ccAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTgcg < 2:1492044/140‑1 (MQ=255)
aaGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCtg < 1:2085867/140‑1 (MQ=255)
gCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCa > 2:559175/1‑125 (MQ=255)
gCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCa < 1:559175/125‑1 (MQ=255)
gCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGaa < 2:1834077/140‑1 (MQ=255)
gCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGaa < 1:694640/140‑1 (MQ=255)
ttAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTc < 1:318798/140‑1 (MQ=255)
aaaTTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCAt < 1:1393955/140‑1 (MQ=255)
cAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGtt > 1:1362200/1‑140 (MQ=255)
tAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTtact > 1:216392/1‑140 (MQ=255)
tAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTtact > 1:1939295/1‑140 (MQ=255)
tAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGCGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTtact > 1:655030/1‑140 (MQ=255)
aCCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTtactac < 2:216392/140‑1 (MQ=255)
ttCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCgg > 1:859179/1‑140 (MQ=255)
tCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCa > 2:1375873/1‑125 (MQ=255)
tCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCa < 1:1375873/125‑1 (MQ=255)
tCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGgc > 1:2327382/1‑140 (MQ=255)
tCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGgc < 1:1989701/140‑1 (MQ=255)
tCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGgc > 2:1994110/1‑140 (MQ=255)
cGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGgcg < 2:881952/140‑1 (MQ=255)
ggATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCg < 1:1436169/136‑1 (MQ=255)
ggATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCg > 2:1436169/1‑136 (MQ=255)
ggATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGgcgc < 2:2336785/140‑1 (MQ=255)
aTTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCgg < 2:655030/140‑1 (MQ=255)
gCCCTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCggggg < 1:2151656/140‑1 (MQ=255)
cccTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGa > 2:332422/1‑140 (MQ=255)
cccTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGa > 1:1277349/1‑140 (MQ=255)
cccTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGa > 2:64736/1‑140 (MQ=255)
cTGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGt < 1:1196600/140‑1 (MQ=255)
tGTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTa < 1:2418302/140‑1 (MQ=255)
gTTTGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTaa < 2:505392/140‑1 (MQ=255)
tttGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAg > 2:1611590/1‑140 (MQ=255)
tttGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGGGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAg > 1:1843179/1‑140 (MQ=255)
tGTCGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTCCCATGGTGCGCTGATGACCGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAgcg < 2:2318608/140‑1 (MQ=255)
cGATCATCAGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGccc > 1:1032273/1‑140 (MQ=255)
atcaGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATccc > 2:659917/1‑140 (MQ=255)
atcaGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATccc > 2:1476440/1‑140 (MQ=255)
atcaGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATccc > 1:1157979/1‑140 (MQ=255)
caGGACCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCG‑ACATCccgcc < 2:794822/140‑1 (MQ=255)
cccGGGTAGAAAAAACCGGTGTCGTTTTTGCCTTCCCCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATCCGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTGCTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGgt < 2:1049271/140‑1 (MQ=255)
|
TTGCTTTCACAGGCCGCCAGGCAGAGCTCAACCAGATCGGACTTCATGCGCAGCATAATCGGCTGGGTTTCCGGATCGCCAAAGCGGCAGTTAAATTCAATAACCTTCGGATTGCCCTGTTTGTCGATCATCAGGCCCGCGTAGAGAAAACCGGTGTAGGTGTTGCCTTCCGCCGCCATGCCTTTCACGGTTGGCCAGATAATACGTTCCATGGTGCGCTGATGAACGTCATCGGTTACTACCGGCGCGGGGGAGTAAGCGCCCATCCCGCCGGT > NC_000913/4204979‑4205253
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
