Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A14 F60 I1 R1
|
20 |
85.9 |
2954762 |
98.8% |
2919304 |
138.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,151,492 |
(G)6→5 |
intergenic (+88/‑123) |
fabG → / → acpP |
3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase FabG/acyl carrier protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,151,487 | 0 | G | . | 100.0%
| 310.7
/ NA
| 74 | intergenic (+83/‑128) | fabG/acpP | 3‑oxoacyl‑[acyl‑carrier‑protein] reductase FabG/acyl carrier protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base . (35/39); total (35/39) |
TTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCA > NC_000913/1151353‑1151621
|
ttACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTgggggt < 2:1153174/140‑2 (MQ=255)
aCGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCt < 2:207807/140‑1 (MQ=255)
ttGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGCCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTa < 1:1461250/140‑1 (MQ=255)
gtgAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCg < 1:535216/140‑1 (MQ=255)
aCGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGt < 1:961347/140‑1 (MQ=255)
tGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGc < 1:484477/140‑1 (MQ=255)
ggTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGAtt > 1:487215/1‑140 (MQ=255)
gTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGAttt > 2:780002/1‑140 (MQ=255)
gTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGAttt > 2:1203323/1‑140 (MQ=255)
tCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTa > 2:997322/1‑140 (MQ=255)
tCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTa > 1:1254494/1‑140 (MQ=255)
tGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGt > 1:959796/1‑140 (MQ=255)
gACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGtt > 1:1133010/1‑140 (MQ=255)
gACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGtt > 2:298033/1‑140 (MQ=255)
gACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGtt > 1:929348/1‑140 (MQ=255)
gACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGtt > 1:552077/1‑140 (MQ=255)
aCCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGAtt < 2:1276041/134‑1 (MQ=255)
aCCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGAtt > 1:1276041/1‑134 (MQ=255)
aCCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTg > 2:469361/1‑140 (MQ=255)
aCCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTg > 1:277452/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCa > 2:370176/1‑140 (MQ=255)
cgcgATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCa < 1:780002/140‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCa < 1:195762/140‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCa < 2:552077/140‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCa < 2:1133010/140‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCa < 1:412201/140‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGCTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCa < 2:888475/140‑1 (MQ=255)
caAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAAc < 1:370176/140‑1 (MQ=255)
caAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAAc < 2:959796/140‑1 (MQ=255)
caAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAAc < 1:747081/140‑1 (MQ=255)
caAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAAc < 1:298033/140‑1 (MQ=255)
caAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAAc < 1:975154/140‑1 (MQ=255)
cATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATac < 2:487215/140‑1 (MQ=255)
aTGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATaca < 1:26388/140‑1 (MQ=255)
gcgcgcAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTTAACATTTTATACACTACg > 2:1077304/1‑140 (MQ=255)
cAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAAc < 2:294360/140‑1 (MQ=255)
tGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATcg > 1:159541/1‑140 (MQ=255)
gTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAg > 2:1387480/1‑140 (MQ=255)
gTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAg > 1:555417/1‑140 (MQ=255)
gTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATAAACTACGAAAACCATCGCGAAAg > 1:223981/1‑140 (MQ=255)
ttATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGc < 1:997322/140‑1 (MQ=255)
aGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGtt > 2:72338/1‑140 (MQ=255)
ataatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGa > 2:694198/1‑140 (MQ=255)
ataatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGa > 2:786982/1‑140 (MQ=255)
taatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATcgcg > 1:1256614/1‑125 (MQ=255)
taatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATcgcg < 2:1256614/125‑1 (MQ=255)
aatTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATa < 2:1254494/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAgg < 1:72338/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAgg < 1:694198/140‑1 (MQ=255)
ttAGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAgg < 1:1203323/140‑1 (MQ=255)
aGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGaa > 2:1196346/1‑140 (MQ=255)
aGTGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGaa > 2:1304627/1‑140 (MQ=255)
tGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATa > 2:1296770/1‑134 (MQ=255)
tGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATa < 1:1296770/134‑1 (MQ=255)
tGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATa < 2:1017900/134‑1 (MQ=255)
tGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATa > 1:1017900/1‑134 (MQ=255)
tGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAAt > 1:1214083/1‑140 (MQ=255)
tGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAAt > 2:769402/1‑140 (MQ=255)
tGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAAt > 2:680289/1‑140 (MQ=255)
tGCAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAAt > 2:492279/1‑140 (MQ=255)
cAAAATGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAAttt > 2:898830/1‑140 (MQ=255)
aaTGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAag > 2:645520/1‑140 (MQ=255)
aaTGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAag < 1:492279/140‑1 (MQ=255)
aaTGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAag < 1:1304627/140‑1 (MQ=255)
aaTGATTTGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAag > 2:321814/1‑140 (MQ=255)
tttGCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCAACGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTAt < 2:159541/140‑1 (MQ=255)
gCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAg < 1:1440115/140‑1 (MQ=255)
gCGTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAg < 1:898830/140‑1 (MQ=255)
gTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTTAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCa < 1:1077304/140‑1 (MQ=255)
gTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCa < 1:786982/140‑1 (MQ=255)
gTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCa > 1:267376/1‑140 (MQ=255)
gTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCa < 1:769402/140‑1 (MQ=255)
gTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCa < 1:680289/140‑1 (MQ=255)
gTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCa < 2:277452/140‑1 (MQ=255)
gTTATT‑GGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCa < 1:645520/140‑1 (MQ=255)
|
TTACATCACGGGTGAAACTTTGCATGTGAACGGCGGGATGTACATGGTCTGACCGCGATTTGCACAAAATGCTCATGTTGCGCGCAGTCTGCGTGGTTATGAGTAATAATTAGTGCAAAATGATTTGCGTTATTGGGGGGTAAGGCCTCAAAATAACGTAAAATCGTGGTAAGACCTGCCGGGATTTAGTTGCAAATTTTTCAACATTTTATACACTACGAAAACCATCGCGAAAGCGAGTTTTGATAGGAAATTTAAGAGTATGAGCA > NC_000913/1151353‑1151621
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
