Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F48 I1 R1
|
508 |
125.6 |
4303852 |
99.2% |
4269421 |
139.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,907,284 |
C→A |
A220S (GCT→TCT) |
eno ← |
enolase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,907,284 | 0 | C | A | 100.0%
| 343.4
/ NA
| 99 | A220S (GCT→TCT) | eno | enolase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); new base A (61/38); total (61/38) |
GTTGCCTTCGCCAGCCAGAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGCGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTCG > NC_000913/2907147‑2907415
|
gttgCCTTCGCCAGCCAGAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGt > 1:126122/1‑140 (MQ=255)
ttCGCCAGCCAGAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAAc > 2:669312/1‑140 (MQ=255)
tCGCCAGCCAGAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAAcc > 1:2023443/1‑140 (MQ=255)
tCGCCAGCCAGAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAAcc > 2:229134/1‑140 (MQ=255)
gccagccaGAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCa > 1:1128017/1‑140 (MQ=255)
ccagAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTc > 1:1146456/1‑140 (MQ=255)
agAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCgg < 1:1615116/140‑1 (MQ=255)
aaCGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGgcg > 2:1398672/1‑140 (MQ=255)
aCGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGgcgc < 1:26217/140‑1 (MQ=255)
aCGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGgcgc < 1:1398672/140‑1 (MQ=255)
cGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCGGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCa < 1:1322673/140‑1 (MQ=255)
ccATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCAcc > 1:50259/1‑140 (MQ=255)
cATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCt > 1:1160004/1‑140 (MQ=255)
cATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCt < 1:559190/140‑1 (MQ=255)
cATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCt > 2:320279/1‑140 (MQ=255)
aaTCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCt < 2:192556/139‑1 (MQ=255)
aTCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCtt > 1:1497580/1‑140 (MQ=255)
tCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTc > 2:954130/1‑140 (MQ=255)
cTTTGTAGAATTCAGAAGCTTCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGTCGCATAGCCACCTTct > 2:77316/1‑139 (MQ=255)
cTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTc > 2:1636584/1‑122 (MQ=255)
cTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTc < 1:1636584/122‑1 (MQ=255)
cTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTct > 2:47436/1‑139 (MQ=255)
cTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTct > 2:47704/1‑139 (MQ=255)
cTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCg < 2:461874/140‑1 (MQ=255)
cTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCg < 1:1350082/140‑1 (MQ=255)
cTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCg > 1:520848/1‑140 (MQ=255)
tttGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGt > 2:968748/1‑140 (MQ=255)
ttGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCGGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTc > 2:550040/1‑140 (MQ=255)
ttGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTc < 2:1160004/140‑1 (MQ=255)
ttGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTc < 1:320279/140‑1 (MQ=255)
tGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCa > 2:1960805/1‑140 (MQ=255)
gAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCaa < 1:582420/140‑1 (MQ=255)
gAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCaa > 2:66310/1‑140 (MQ=255)
gAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCaa < 1:669312/140‑1 (MQ=255)
ttCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcag > 1:1770595/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcag > 1:981616/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcag > 2:1266934/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcag > 2:1581709/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcag > 2:1634461/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcag > 1:1613900/1‑140 (MQ=255)
ttCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcag > 1:1755907/1‑140 (MQ=255)
cAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagca < 1:968748/140‑1 (MQ=255)
cAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagca < 2:327924/140‑1 (MQ=255)
cAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagca < 2:1155060/140‑1 (MQ=255)
cAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagca < 1:453192/140‑1 (MQ=255)
cAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagca < 2:1605968/140‑1 (MQ=255)
cAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagca < 1:130143/140‑1 (MQ=255)
cAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagca > 2:550974/1‑140 (MQ=255)
cAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagca < 1:1634461/140‑1 (MQ=255)
aaGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagca < 2:126122/139‑1 (MQ=255)
aGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAAcagcag > 1:844941/1‑140 (MQ=255)
tGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAGCCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCa < 1:1433920/140‑1 (MQ=255)
tCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCttt < 2:631569/140‑1 (MQ=255)
aTCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGc > 2:1475507/1‑140 (MQ=255)
cGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCtt > 1:775625/1‑140 (MQ=255)
aaGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGa > 1:1718617/1‑140 (MQ=255)
aaGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCAATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGa > 2:1706958/1‑140 (MQ=255)
gTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAAc < 2:1284288/140‑1 (MQ=255)
aTGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACttt > 2:815875/1‑140 (MQ=255)
gTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTg > 1:683731/1‑140 (MQ=255)
tCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAACTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGc > 1:1469236/1‑140 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGcc < 1:1194988/140‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGcc < 2:1724544/140‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGcc < 1:1524058/140‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGcc < 1:1475507/140‑1 (MQ=255)
cTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGca < 1:550974/140‑2 (MQ=255)
gCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGt > 1:908668/1‑140 (MQ=255)
gCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGt < 1:1699604/140‑1 (MQ=255)
gTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATgg > 1:110296/1‑140 (MQ=255)
ttCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGa > 1:829786/1‑140 (MQ=255)
ttCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGAAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGa > 1:1603377/1‑140 (MQ=255)
aaCCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACt > 1:149220/1‑140 (MQ=255)
agcagcTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAg < 1:1630599/140‑1 (MQ=255)
gcagcTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGa > 2:1931629/1‑140 (MQ=255)
gcagcTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGa > 1:479614/1‑140 (MQ=255)
gcagcTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGa > 2:650212/1‑140 (MQ=255)
gcagcTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGa > 1:327890/1‑140 (MQ=255)
gcagcTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGa > 1:1621587/1‑140 (MQ=255)
gcagcTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGa > 1:915810/1‑140 (MQ=255)
gcagcTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGa > 1:835253/1‑140 (MQ=255)
gcagcTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGCTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGa > 1:485067/1‑140 (MQ=255)
ttAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCAt < 1:1960805/140‑1 (MQ=255)
aGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGa < 1:1661349/140‑1 (MQ=255)
cTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATg < 2:829786/140‑1 (MQ=255)
cTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATg < 2:775625/140‑1 (MQ=255)
ttCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATgg > 2:1294034/1‑140 (MQ=255)
tCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGc < 2:925472/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGc < 2:1718617/140‑1 (MQ=255)
tCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGc > 1:13111/1‑140 (MQ=255)
tCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGc > 1:826719/1‑140 (MQ=255)
cAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGct < 1:650212/140‑1 (MQ=255)
aGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGctt > 1:1710602/1‑140 (MQ=255)
gCGATAACAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGGACGCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGcttc > 1:1536479/1‑140 (MQ=255)
aCAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTcac > 1:697454/1‑140 (MQ=255)
aCAGCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTcac > 1:1226553/1‑140 (MQ=255)
gCCAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGt > 1:1588038/1‑140 (MQ=255)
cAGAGCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGttt > 2:272759/1‑140 (MQ=255)
agCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTcg > 2:1062322/1‑140 (MQ=255)
agCTTCAGAGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTcg > 2:985927/1‑140 (MQ=255)
|
GTTGCCTTCGCCAGCCAGAACGTATTTACCATCTTTGTAGAATTCAGAAGCTGCGCAGTCCATCGCCAAAGTGATGTCTTTGCCCAGTTCATAACCAGCAGCTTTAACAGCTTCAGCGATAACAGCCAGAGCTTCAGCGTTGGAACCCAGGTTCGGCGCATAGCCACCTTCGTCACCAACAGCAGTGTTCATGCCTTTCGCTTTCAGAACTTTTGCCAGGTGATGGAAAACTTCAGAACCCATGCGGATGGCTTCTTTCACAGTTTTCG > NC_000913/2907147‑2907415
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
