Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A16 F48 I1 R1
|
61 |
131.2 |
4447032 |
99.1% |
4407008 |
139.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,138,701 |
G→T |
A112E (GCG→GAG) |
gldA ← |
L‑1,2‑propanediol dehydrogenase/glycerol dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,138,701 | 0 | G | T | 100.0%
| 469.2
/ NA
| 130 | A112E (GCG→GAG) | gldA | L‑1,2‑propanediol dehydrogenase/glycerol dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); new base T (73/57); total (73/57) |
Only 100 of 132 total aligned reads displayed.
CGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAACATTC > NC_000913/4138564‑4138837
|
cgacgaTTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATctct > 1:707930/1‑140 (MQ=255)
tttGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGaa < 1:1041336/140‑1 (MQ=255)
tttGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGaa < 2:965908/140‑1 (MQ=255)
tttGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGaa < 1:2116546/140‑1 (MQ=255)
tttGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGaa < 1:1983415/140‑1 (MQ=255)
tttGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGaa < 1:1125398/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAaca < 2:378649/140‑1 (MQ=255)
tGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAaca < 2:255299/140‑1 (MQ=255)
gtCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCa < 2:567190/140‑1 (MQ=255)
cGACAATGGCCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCTCCCTCATCGGTGTAGATAACAGTCAATGCGCAGCACGGTGCCTCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATg < 1:1461416/140‑1 (MQ=255)
aCCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGc < 2:1576578/140‑1 (MQ=255)
ccATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGcc < 2:1014341/140‑1 (MQ=255)
tatTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGt > 1:2165384/1‑140 (MQ=255)
atTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTg > 1:623478/1‑140 (MQ=255)
atTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTg > 1:1777597/1‑140 (MQ=255)
cGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCtt < 1:1073735/140‑1 (MQ=255)
ggTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTg > 1:1120657/1‑140 (MQ=255)
ttATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGc > 2:1458061/1‑140 (MQ=255)
tATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCa < 2:2165384/140‑1 (MQ=255)
aTTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAg < 1:1272204/140‑1 (MQ=255)
aTTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAg > 1:1201971/1‑140 (MQ=255)
aTTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAg > 1:108352/1‑140 (MQ=255)
tttGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGt > 2:1026488/1‑140 (MQ=255)
ttGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTa > 2:1273943/1‑140 (MQ=255)
aaaCAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGa < 2:13776/139‑1 (MQ=255)
gcagATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGtt > 2:2024451/1‑140 (MQ=255)
aTAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTc < 2:1843431/140‑1 (MQ=255)
tAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTcc < 1:352278/140‑1 (MQ=255)
aGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCg > 1:1946481/1‑140 (MQ=255)
ggTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCa > 2:1543211/1‑140 (MQ=255)
tCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCAcc > 1:1724785/1‑140 (MQ=255)
tCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCAcc > 2:1764459/1‑140 (MQ=255)
cAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCg < 1:157743/140‑1 (MQ=255)
aCCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCga > 1:529375/1‑140 (MQ=255)
cccTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCgag > 1:1054534/1‑140 (MQ=255)
cTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGaa < 1:1026488/140‑1 (MQ=255)
aTCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTg > 2:923602/1‑140 (MQ=255)
cGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTgcg < 2:48381/140‑1 (MQ=255)
cGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTgcg < 2:1054534/140‑1 (MQ=255)
gtgtAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGcc > 1:1525258/1‑140 (MQ=255)
gtAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGTTAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCcac > 2:418331/1‑140 (MQ=255)
gtAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCcac < 1:422747/140‑1 (MQ=255)
gtAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCcac < 1:2024451/140‑1 (MQ=255)
aGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCacac < 1:909235/140‑1 (MQ=255)
aTAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTg > 2:1948010/1‑140 (MQ=255)
aaCAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGTCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTgcg < 1:935946/140‑1 (MQ=255)
aaCAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGTTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATTTGTCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTACGCCACTGATACCGAGAATTGCGCCAAACTgtg > 2:935946/1‑138 (MQ=255)
aaCAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTgcg > 2:1675272/1‑140 (MQ=255)
aaCAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTgcg < 2:1075691/140‑1 (MQ=255)
aaCAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTgcg < 2:1120657/140‑1 (MQ=255)
aaCAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTgcg < 1:923602/140‑1 (MQ=255)
cAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCa > 1:1789451/1‑140 (MQ=255)
cAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCa > 2:1437836/1‑140 (MQ=255)
cAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACAGCGCa > 2:1363105/1‑140 (MQ=255)
aGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAg > 1:823729/1‑140 (MQ=255)
aGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAg > 2:471476/1‑140 (MQ=255)
aGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAg > 1:1598317/1‑140 (MQ=255)
aGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAg > 2:1058871/1‑140 (MQ=255)
aaTGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGtctc > 1:1934224/1‑140 (MQ=255)
aTGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTcc > 1:2074330/1‑140 (MQ=255)
aTGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTcc > 2:564031/1‑140 (MQ=255)
tGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCcg > 1:584581/1‑140 (MQ=255)
agcgcTGCACCGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTTCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCcg < 2:108352/139‑1 (MQ=255)
gcTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGa > 1:1609447/1‑140 (MQ=255)
gcTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGa < 2:1789451/140‑1 (MQ=255)
cTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGAt > 1:474710/1‑140 (MQ=255)
aCGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCa > 2:599114/1‑140 (MQ=255)
aCGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCa > 2:2005438/1‑140 (MQ=255)
aCGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCa < 2:75631/140‑1 (MQ=255)
ggTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACg < 1:741460/140‑1 (MQ=255)
ggTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACg > 2:2118330/1‑140 (MQ=255)
cATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGa < 2:1946481/140‑1 (MQ=255)
cATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGa < 2:386051/140‑1 (MQ=255)
cGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACgg > 1:903900/1‑140 (MQ=255)
cGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACgg > 2:1191077/1‑140 (MQ=255)
cGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTACGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACgg > 2:2079115/1‑140 (MQ=255)
cGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTA‑CGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGt < 1:244882/140‑1 (MQ=255)
gTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTc < 1:1191077/140‑1 (MQ=255)
gagGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATGTAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGAt > 1:951275/1‑140 (MQ=255)
gagGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACg > 1:2216481/1‑134 (MQ=255)
gagGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACg < 2:2216481/134‑1 (MQ=255)
gagGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGt < 2:1665277/136‑1 (MQ=255)
gagGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGt > 1:1665277/1‑136 (MQ=255)
gagGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGAt > 1:2028284/1‑140 (MQ=255)
gagGCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGAt > 1:472354/1‑140 (MQ=255)
ggCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGAtct > 2:1350102/1‑140 (MQ=255)
gCGATAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGAtctc > 2:19876/1‑140 (MQ=255)
tAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCAttt > 2:297449/1‑140 (MQ=255)
tAGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCAttt > 2:844/1‑140 (MQ=255)
aGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCGGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCAtttt > 1:47482/1‑140 (MQ=255)
aGTCGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCAtttt > 2:1995502/1‑140 (MQ=255)
cGGTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCg > 1:435223/1‑140 (MQ=255)
gTGCGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCTAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGaa < 2:343275/140‑1 (MQ=255)
cGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGa > 2:731730/1‑136 (MQ=255)
cGATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGa < 1:731730/136‑1 (MQ=255)
gATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAACAtt < 2:524948/140‑1 (MQ=255)
gATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAACAtt < 2:1777597/140‑1 (MQ=255)
gATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAACAtt < 2:1986806/140‑1 (MQ=255)
gATCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAACAtt < 2:1201971/140‑1 (MQ=255)
aTCTCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAACATTc > 2:347005/1‑140 (MQ=255)
|
CGACGATTTTGGTGTCGACAATGACCATATTCGGGTTATTTGGCAACAGCAGATAGCGGTCAAACTCACCCTCATCGGTGTAGATAACAGACAATGCGCTGCACGGTGCATCGGTAGAGGCGATAGTCGGTGCGATCGCTACCGGAACACCCATGAAATGTGCCAGTGCTTTGGCAGTATCGAGGGTTTTTCCGCCACCGATACCGAGAATTGCGCCACACTGCGCAGTCTCCGCGATGCCACGCAGACGGTCGATCTCATTTTGCGAACATTC > NC_000913/4138564‑4138837
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
