Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F28 I1 R1
|
140 |
59.4 |
2004938 |
99.3% |
1990903 |
138.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
999,709 |
(C)6→7 |
coding (494/2601 nt) |
elfC → |
putative fimbrial usher protein ElfC |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 999,703 | 1 | . | C | 100.0%
| 219.3
/ NA
| 62 | V163A (GTC→GCC) | elfC | putative fimbrial usher protein ElfC |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (0/0); new base C (26/36); total (26/36) |
TTTAAACAACTGGACAAACAAGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGT‑CCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTCTGAATTTAAACAGTGGCGTT > NC_000913/999564‑999836
|
tttAAACAACTGGACAAACAAGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGCGGTTATGt > 1:894011/1‑140 (MQ=255)
ttAAACAACTGGACAAACAAGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGT‑c > 1:281902/1‑140 (MQ=255)
ttAAACAACTGGACAAACAAGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGT‑c < 2:771336/140‑1 (MQ=255)
tGGACAAACAAGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTTCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGT‑ccccccctga < 2:641071/140‑5 (MQ=255)
tGGACAAACAAGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGT‑ccccccctga < 2:281902/140‑5 (MQ=255)
ggACAAACAAGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCGGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGT‑ccccccctgaa > 2:616305/1‑135 (MQ=255)
acaaacaaGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACg < 2:2211/140‑1 (MQ=255)
caaacaaGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGt < 2:733013/140‑1 (MQ=255)
aaacaaGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGtt < 1:11071/140‑1 (MQ=255)
aGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGGTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATTCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGAt > 2:423663/1‑140 (MQ=255)
gCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATg < 1:703254/140‑1 (MQ=255)
cGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGa > 1:351128/1‑140 (MQ=255)
cGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGa > 1:784720/1‑140 (MQ=255)
gCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATc > 2:270290/1‑140 (MQ=255)
cATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCaa > 2:676662/1‑140 (MQ=255)
cATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCaa < 2:784720/140‑1 (MQ=255)
ttGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAAcg < 2:372497/140‑1 (MQ=255)
tGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAAcgc > 2:78299/1‑140 (MQ=255)
ggCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATc > 2:726848/1‑134 (MQ=255)
ggCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATc < 1:726848/134‑1 (MQ=255)
ggCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAAcgcg < 1:682479/140‑1 (MQ=255)
gCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACgcgc < 2:725696/140‑1 (MQ=255)
gCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACgcgc < 1:616305/140‑1 (MQ=255)
gCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACgcgc > 1:235074/1‑140 (MQ=255)
cGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCt < 1:310193/140‑1 (MQ=255)
attattCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTAc < 2:662900/140‑1 (MQ=255)
attattCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTAc < 2:289687/140‑1 (MQ=255)
ttattCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATCAAGGGATCAACGCGCTATTACt < 1:756769/140‑1 (MQ=255)
ttCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTggg > 2:315063/1‑140 (MQ=255)
ccAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGtt < 1:497639/140‑1 (MQ=255)
cAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGttt > 1:485134/1‑140 (MQ=255)
tAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCgg > 2:401797/1‑140 (MQ=255)
cGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGc > 1:691823/1‑140 (MQ=255)
cGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGc < 1:676662/140‑1 (MQ=255)
cGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGc < 1:915203/140‑1 (MQ=255)
tttAATGTGAACAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTa < 1:218074/140‑1 (MQ=255)
ttAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTaa < 1:270290/140‑1 (MQ=255)
aaTGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACa < 2:143534/140‑1 (MQ=255)
aaTGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACa > 2:445338/1‑140 (MQ=255)
aaTGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACa < 2:485134/140‑1 (MQ=255)
aTGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAg > 2:312957/1‑140 (MQ=255)
aaTAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGc > 2:737868/1‑129 (MQ=255)
aaTAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGc < 1:737868/129‑1 (MQ=255)
aaTAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTc > 2:740601/1‑140 (MQ=255)
ccGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCa > 2:865256/1‑133 (MQ=255)
ccGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCa < 1:865256/133‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGAGGGGCTAACAGTATTCATagcagc < 2:296625/140‑1 (MQ=255)
ccGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGAGGGGCTAACAGTATTCATagcagc < 2:399607/140‑1 (MQ=255)
cGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAgcg < 1:401797/140‑1 (MQ=255)
gTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACg > 1:956880/1‑68 (MQ=255)
gTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACg < 2:956880/68‑1 (MQ=255)
gTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTAtt < 2:38207/129‑1 (MQ=255)
gTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTAtt > 1:38207/1‑129 (MQ=255)
gTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAgcgc > 2:967542/1‑140 (MQ=255)
tACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTgg > 2:855502/1‑140 (MQ=255)
cGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGa < 2:351128/140‑1 (MQ=255)
cAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACa > 2:915065/1‑140 (MQ=255)
cATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTAtttt > 1:799003/1‑140 (MQ=255)
aTCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTc < 1:740601/140‑1 (MQ=255)
aTCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGCATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTc < 2:691823/140‑1 (MQ=255)
cAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTCTg < 2:235074/140‑1 (MQ=255)
tAATGCCCGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTCTGAATTTa < 1:78299/140‑1 (MQ=255)
cccGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTc > 2:881479/1‑127 (MQ=255)
cccGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTc < 1:881479/127‑1 (MQ=255)
cccGTGGTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTCTGAATTTAAACAg > 2:514036/1‑140 (MQ=255)
ggTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTCTGAATTTAAACAGTGGCg > 2:782643/1‑140 (MQ=255)
gTTATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTCGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTCTGAATTTAAACAGTGGCGt < 2:894011/140‑1 (MQ=255)
ttATGTCCCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTCTGAATTTAAACAGTGGCGtt < 1:105215/140‑1 (MQ=255)
|
TTTAAACAACTGGACAAACAAGCGTGTGTGCCATTGGCGGAGATTATTCCGGATGCCAGCGTAACGTTTAATGTGAATAAACTCCGTCTGGAAATTTCAGTACCGCAAATCGCCATCAAAAGTAATGCCCGTGGTTATGT‑CCCCCCTGAACGTTGGGATGAAGGGATCAACGCGCTATTACTGGGATATTCGTTTAGCGGGGCTAACAGTATTCATAGCAGCGCAGACAGTGATTCTGGCGACAGCTATTTTCTGAATTTAAACAGTGGCGTT > NC_000913/999564‑999836
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
