Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F13 I1 R1
|
24 |
670.1 |
22273598 |
98.8% |
22006314 |
140.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,931,861 |
A→G |
G182G (GGA→GGG) |
kup → |
K(+):H(+) symporter Kup |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,931,861 | 0 | A | G | 99.4%
| 2762.9
/ 0.1
| 662 | G182G (GGA→GGG) | kup | K(+):H(+) symporter Kup |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/2); new base G (337/321); total (339/323) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 663 total aligned reads displayed.
AATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGATTACGGGGGTCGAGGCGCT > NC_000913/3931714‑3932007
|
aaTCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCt < 1:9183593/150‑1 (MQ=255)
aaTCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCt < 1:9183766/150‑1 (MQ=255)
gtcgCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTgggg < 1:9183536/150‑1 (MQ=255)
cgCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATTATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGt > 2:9184150/1‑149 (MQ=255)
ccccGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTAc > 1:9184159/1‑150 (MQ=255)
ccccGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTAc < 1:9183721/150‑1 (MQ=255)
ccGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCGCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGt < 2:9183489/150‑1 (MQ=255)
cGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTAc > 2:9184161/1‑147 (MQ=255)
gCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCat > 1:9184176/1‑150 (MQ=255)
cTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGTTTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCat > 2:9184179/1‑149 (MQ=255)
gATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCattatt < 1:9183483/150‑1 (MQ=255)
aTACCTGGATAGTTCCCC‑CTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGc > 1:9184188/1‑150 (MQ=255)
tACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTg > 2:9184195/1‑149 (MQ=255)
tACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGc < 1:9183372/150‑1 (MQ=255)
ccTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCt < 2:9183776/149‑1 (MQ=255)
cTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTaa < 2:9184094/150‑1 (MQ=255)
tGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAc > 1:9184204/1‑150 (MQ=255)
ggATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAAcc > 1:9184211/1‑150 (MQ=255)
aaGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGATTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCg > 2:9184219/2‑149 (MQ=255)
gTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTGACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGaa < 2:9183523/150‑1 (MQ=255)
gTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCgg > 1:9184224/1‑148 (MQ=255)
ccccTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtg > 1:9184232/1‑150 (MQ=255)
tctcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgctg > 2:9184239/1‑149 (MQ=255)
tcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtgctgc < 2:9183410/148‑1 (MQ=255)
tcAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAt > 1:9184244/1‑150 (MQ=255)
acttATCGTTCTCACTTTACTATTTATGATTCACCAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTg < 2:9183620/126‑1 (MQ=255)
aaTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAGGTGCTGCATgc > 2:9184251/1‑150 (MQ=255)
aaTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCAt < 2:9183811/148‑1 (MQ=255)
aTTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATgcg < 1:9183856/150‑1 (MQ=255)
aTCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCt < 2:9183209/149‑1 (MQ=255)
aTCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCt > 1:9184262/1‑149 (MQ=255)
tCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGa < 1:9183806/150‑1 (MQ=255)
cGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACNTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGtg > 2:9184268/1‑136 (MQ=255)
tctcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATc > 2:9184280/1‑149 (MQ=255)
tctcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATc > 1:9184278/1‑149 (MQ=255)
tcACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGTTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCattatt < 2:9183569/116‑1 (MQ=255)
aCTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtg > 1:9184294/1‑150 (MQ=255)
aCTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtg > 2:9184293/1‑150 (MQ=255)
cTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgt < 1:9183267/150‑1 (MQ=255)
cTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgt < 1:9183995/150‑1 (MQ=255)
tttATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAAtgt < 1:9183781/149‑1 (MQ=255)
tattatTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTggg > 1:9184308/1‑150 (MQ=255)
cattattTATGATTCAAAAACATGGTACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTgg < 1:9183956/148‑1 (MQ=255)
attattTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTggg < 1:9183686/149‑1 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGc < 1:9183509/149‑1 (MQ=255)
ttatttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCg > 2:9184312/1‑150 (MQ=255)
tttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGt < 2:9183650/149‑1 (MQ=255)
tttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTg < 1:9183815/150‑1 (MQ=255)
ttatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTg > 1:9184317/1‑149 (MQ=255)
tatGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATTCAATGTGGGCGGTGc > 2:9184329/1‑149 (MQ=255)
tGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCAGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCAtt > 1:9184333/1‑150 (MQ=255)
aTTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCAttt < 1:9183640/149‑1 (MQ=255)
ttCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCGGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATttct > 2:9184340/1‑150 (MQ=255)
cAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATttcttc > 1:9184346/1‑150 (MQ=255)
aaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCt > 1:9184357/1‑150 (MQ=255)
aaaaCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCt > 2:9184358/1‑150 (MQ=255)
aCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTg > 1:9184368/1‑149 (MQ=255)
aCATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTg > 2:9184371/1‑149 (MQ=255)
cATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGaa < 2:9183844/150‑1 (MQ=255)
aTGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGaa > 2:9184383/1‑149 (MQ=255)
tGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGGATTTCTTCCTTGAATa < 1:9183841/150‑1 (MQ=255)
gCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACa < 1:9183616/150‑1 (MQ=255)
cACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACaa < 1:9183149/150‑1 (MQ=255)
aCGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACaa > 1:9184392/1‑149 (MQ=255)
cGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACaaaa > 2:9184393/1‑150 (MQ=255)
ggCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATAc < 2:9183462/145‑1 (MQ=255)
ggCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAAc < 2:9183711/150‑1 (MQ=255)
gCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACg > 1:9184402/1‑150 (MQ=255)
gCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACg < 2:9183914/150‑1 (MQ=255)
ggTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTc > 1:9184413/1‑150 (MQ=255)
cGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCGGCATGCGCTGAAGCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCttt > 2:9184417/1‑150 (MQ=255)
ggTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCtttt < 1:9184108/150‑1 (MQ=255)
ggTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATACTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCaa < 2:9183741/106‑1 (MQ=255)
gTAAGCTGTGTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTa < 2:9183954/150‑1 (MQ=255)
tAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTAt > 1:9184424/1‑150 (MQ=255)
aGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTg < 2:9184019/150‑1 (MQ=255)
aGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTg < 2:9183761/150‑1 (MQ=255)
cTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGc < 2:9183297/68‑1 (MQ=255)
cTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCa < 1:9184050/150‑1 (MQ=255)
gTTTGCGCCGATCATGCTGGCCTGGTTTTTTTTTTTTTTTGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCAt > 2:9184433/1‑149 (MQ=255)
tttGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCAt > 1:9184437/1‑148 (MQ=255)
tttGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCAt < 1:9183667/148‑1 (MQ=255)
ttGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCTGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATttcttc < 2:9183696/116‑1 (MQ=255)
ccGATGATGCTGACGTGGTTTCTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAgg > 2:9184445/1‑146 (MQ=255)
ccGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCa < 1:9183902/150‑1 (MQ=255)
tCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGGTTCTTTTATTGCAt > 2:9184456/1‑138 (MQ=255)
cATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGCATACCAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGcg > 1:9184458/1‑144 (MQ=255)
aTGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAgtggt < 1:9183744/149‑1 (MQ=255)
tGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAgggg > 2:9184469/1‑138 (MQ=255)
gACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTc > 1:9184470/1‑150 (MQ=255)
gggTTTTTGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGtt < 2:9183885/113‑1 (MQ=255)
tttGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGATTACggg > 1:9184481/1‑150 (MQ=255)
tGATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCTCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGACTACgggg > 2:9184486/1‑149 (MQ=255)
gATTCTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGATTACgg > 1:9184491/1‑146 (MQ=255)
tCTGGCAGGGCTTGGGTTACGTAGCATTATTGCTTTCCCGGAAGt < 2:9183672/45‑1 (MQ=255)
cTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGATTACGGGGGTCGAg > 1:9184502/1‑150 (MQ=255)
cTGGCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATNGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGATTACGGGGGTCGAg > 2:9184503/1‑150 (MQ=255)
gCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGATTACGGGGGTCGAgg < 1:9183934/148‑1 (MQ=255)
gCAGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGATTACGGGGGTCGAg < 1:396682/147‑1 (MQ=255)
aGGGCTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGATTACGGGGGTCGAGGCGCt > 1:9184516/1‑150 (MQ=255)
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AATCGTCGCCCCGCAGCTGGATACCTGGATAGTTCCCCTCTCAATTATCGTTCTCACTTTATTATTTATGATTCAAAAACATGGCACGGCTATGGTCGGTAAGCTGTTTGCGCCGATCATGCTGACCTGGTTTTTGATTCTGGCAGGACTGGGGTTACGTAGCATTATTGCTAACCCGGAAGTGCTGCATGCGCTGAATCCAATGTGGGCGGTGCATTTCTTCCTTGAATACAAAACGGTTTCTTTTATTGCATTAGGGGCAGTGGTGTTGTCGATTACGGGGGTCGAGGCGCT > NC_000913/3931714‑3932007
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
