Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F13 I1 R1
|
24 |
670.1 |
22273598 |
98.8% |
22006314 |
140.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,215,187 |
A→G |
H303R (CAC→CGC) |
metA → |
homoserine O‑succinyltransferase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,215,187 | 0 | A | G | 99.6%
| 2785.2
/ ‑0.5
| 678 | H303R (CAC→CGC) | metA | homoserine O‑succinyltransferase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base G (342/332); total (345/333) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.63e-01 |
Only 100 of 680 total aligned reads displayed.
GACTAGACCCGGATGTACCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGTTATCAACAA > NC_000913/4215040‑4215332
|
gACCCGGATGTACCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAAt > 2:9938298/1‑150 (MQ=255)
cccGGATGTACCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATGCACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCACAACTATTATGTCTACCAGATCACGCGATACGATCTACGGCGCATGAATc > 1:9938301/1‑149 (MQ=255)
ccGGATGTACCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATcc < 1:9937501/149‑1 (MQ=255)
ggATGTACCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAAc < 2:9937670/150‑1 (MQ=255)
gATGTACCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACg > 1:9938312/1‑150 (MQ=255)
aCCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTAGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACg > 2:9938323/1‑145 (MQ=255)
ccGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGa < 2:9937598/149‑1 (MQ=255)
tataACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTaa > 1:9938333/1‑150 (MQ=255)
ataACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGCTTaa > 2:9938340/1‑149 (MQ=255)
aaCTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAAtct > 1:9938350/1‑150 (MQ=255)
aaCTATATCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAAtct > 2:9938349/1‑150 (MQ=255)
tATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAAtcttc > 1:9938358/1‑149 (MQ=255)
tCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGATAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAAc < 1:9937667/130‑1 (MQ=255)
ccGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAAc > 1:9938368/1‑128 (MQ=255)
ccGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGAt < 1:9937991/149‑1 (MQ=255)
ccGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATa < 1:9937486/150‑1 (MQ=255)
gCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGt > 2:9938371/1‑150 (MQ=255)
acaATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTTATAGTc > 1:9938383/1‑149 (MQ=255)
caATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCg > 2:9938388/1‑149 (MQ=255)
aTGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATc < 2:9937614/150‑1 (MQ=255)
tGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCg < 1:9937088/150‑1 (MQ=255)
gATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGt > 1:9938394/1‑150 (MQ=255)
ccGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGtt > 1:9938405/1‑148 (MQ=255)
ccGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTa < 2:9937700/149‑1 (MQ=255)
cGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCg < 2:9937335/141‑1 (MQ=255)
cGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAg > 2:9938406/1‑150 (MQ=255)
aaTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGAtt < 1:9937392/150‑1 (MQ=255)
aTACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGAt > 1:9938417/1‑148 (MQ=255)
tACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCa < 2:9937818/150‑1 (MQ=255)
acCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGc > 1:9938429/1‑141 (MQ=255)
acCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCa > 2:9938428/1‑150 (MQ=255)
cgcgAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCAc < 1:9937957/149‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCAc < 1:9937631/149‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCAc < 1:9937568/149‑1 (MQ=255)
cgcgAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTAAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACg > 2:9938439/1‑104 (MQ=255)
gagcgagcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCt > 1:9938445/1‑148 (MQ=255)
gagcTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCt > 2:9938452/1‑149 (MQ=255)
tGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTTAGCACCTTAcc > 1:9938462/1‑144 (MQ=255)
ggCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCa > 2:9938463/1‑150 (MQ=255)
gCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGc < 2:9937843/148‑1 (MQ=255)
tAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATGCAga > 2:9938475/1‑130 (MQ=255)
gTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTc < 2:9937897/149‑1 (MQ=255)
tCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCgg < 1:9937702/150‑1 (MQ=255)
cACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCggg > 1:9938484/1‑150 (MQ=255)
cACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCggg > 2:9938483/1‑150 (MQ=255)
gTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCCGCAc > 1:9938493/1‑125 (MQ=255)
aTTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCa > 1:9938502/1‑131 (MQ=255)
tttACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCATGCACCTTCGGGTGCCtttt > 2:9938504/1‑150 (MQ=255)
cTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCggg > 1:9938516/1‑138 (MQ=255)
cTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTa < 1:9937535/149‑1 (MQ=255)
tGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTAtt > 2:9938519/1‑150 (MQ=255)
tACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCtgt > 1:9938527/1‑84 (MQ=255)
tACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTAtt < 2:9937510/146‑1 (MQ=255)
ccAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCa < 2:9938064/106‑1 (MQ=255)
ccAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGa < 1:9937854/149‑1 (MQ=255)
ccAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAAAGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGaa < 1:9937226/150‑1 (MQ=255)
cAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAAtattc > 1:9938537/1‑78 (MQ=255)
aaCTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGAt < 2:9937166/69‑1 (MQ=255)
aaCTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAAc < 1:9937874/150‑1 (MQ=255)
aCTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACg > 2:9938538/1‑150 (MQ=255)
aCTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACg < 1:9937794/150‑1 (MQ=255)
cTGGCTCAACTATTACGTCTGCCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGTATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGt < 1:9937338/150‑1 (MQ=255)
tGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTCCCTCAGGCACCTTCGGGt > 2:9938548/1‑127 (MQ=255)
cTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATc < 2:9937398/85‑1 (MQ=255)
cTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCt < 2:9937775/150‑1 (MQ=255)
tCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCt > 1:9938553/1‑149 (MQ=255)
cAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGc < 2:9937557/56‑1 (MQ=255)
aaatATTACGTCTACCAGATCACGCCAGACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCt < 2:9937456/103‑1 (MQ=255)
aaCTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTcag > 2:9938560/1‑150 (MQ=255)
aCTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTcagc < 2:9937990/150‑1 (MQ=255)
aCTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTc > 2:9938569/1‑147 (MQ=255)
aTTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAgg > 1:9938577/1‑150 (MQ=255)
ttACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGt < 1:9937726/150‑1 (MQ=255)
tACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGt > 2:9938580/1‑149 (MQ=255)
aCGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTg < 1:9937832/149‑1 (MQ=255)
cGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGa < 2:9938220/149‑1 (MQ=255)
gTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAAt < 1:9938245/150‑1 (MQ=255)
cTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTc > 1:9938588/1‑96 (MQ=255)
ccggATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATaa < 2:9937742/144‑1 (MQ=255)
ccAGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATaaa < 1:9937601/148‑1 (MQ=255)
aGATCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAAttt > 1:9938596/1‑149 (MQ=255)
aTCACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTAcc > 2:9938601/1‑128 (MQ=255)
cACGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCGGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAAtttt < 1:9937459/146‑1 (MQ=255)
cGCCATACGCTCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAAttt < 1:9938286/143‑1 (MQ=255)
cGCCATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGGGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTcagc > 2:9938610/1‑129 (MQ=255)
ccATACGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCatat > 1:9938614/1‑150 (MQ=255)
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cGATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGtt < 2:9937958/149‑1 (MQ=255)
gATCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGTTAt > 2:9938631/1‑150 (MQ=255)
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tCTACGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCCGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTa > 2:9938640/1‑135 (MQ=255)
aCGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGTTATcaac > 1:9938651/1‑149 (MQ=255)
cGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGTTATcaacaa < 1:9938047/150‑1 (MQ=255)
cGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGTTATcaacaa < 1:9937654/150‑1 (MQ=255)
cGGCGCATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGTTATcaac < 2:9937933/148‑1 (MQ=255)
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GACTAGACCCGGATGTACCGTATAACTATTTCCCGCACAATGATCCGCAAAATACACCGCGAGCGAGCTGGCGTAGTCACGGTAATTTACTGTTTACCAACTGGCTCAACTATTACGTCTACCAGATCACGCCATACGATCTACGGCACATGAATCCAACGCTGGATTAATCTTCTGTGATAGTCGATCGTTAAGCGATTCAGCACCTTACCTCAGGCACCTTCGGGTGCCTTTTTTATTTCCGAAACGTACCTCAGCAGGTGAATAAATTTTATTCATATTGTTATCAACAA > NC_000913/4215040‑4215332
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
