Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F13 I1 R1
|
21 |
2440.9 |
80198605 |
99.5% |
79797611 |
141.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,490,503 |
A→G |
V483A (GTT→GCT) |
oxc ← |
oxalyl‑CoA decarboxylase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,490,503 | 0 | A | G | 98.7%
| 9822.9
/ 63.8
| 2416 | V483A (GTT→GCT) | oxc | oxalyl‑CoA decarboxylase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (12/19); new base G (1087/1296); total (1100/1316) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.74e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.89e-01 |
Only 100 of 2449 total aligned reads displayed.
GACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAACCAGAAGTCACGC > NC_000913/2490356‑2490650
|
gACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAgca > 2:20916832/1‑150 (MQ=255)
aCTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAgcac > 1:20916843/1‑150 (MQ=255)
aaTACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCg < 1:20912778/148‑1 (MQ=255)
aaTACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGtc < 2:20914912/150‑1 (MQ=255)
aTACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGtct > 1:20916893/1‑150 (MQ=255)
ccGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCg > 2:20916913/1‑144 (MQ=255)
cGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCGACGAAACGCATCCATTAATTTGTCAGACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTctcct < 2:20913992/149‑1 (MQ=255)
ggtggtTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTctcct < 1:20915364/148‑1 (MQ=255)
tggtTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCAcc > 1:20916946/1‑139 (MQ=255)
aaGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATgc > 2:20916982/1‑150 (MQ=255)
aGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATgcc > 1:20916997/1‑150 (MQ=255)
cATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATg < 2:20915343/146‑1 (MQ=255)
aTGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATgccgcc < 1:20915069/150‑1 (MQ=255)
aTGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATgccgcc < 2:20915694/150‑1 (MQ=255)
tGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCa > 1:20917042/1‑150 (MQ=255)
gACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCat > 2:20917046/1‑150 (MQ=255)
aaGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCattatt < 1:20914054/150‑1 (MQ=255)
gTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCAttatta < 2:20915415/149‑1 (MQ=255)
gTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCAttatta > 2:20917093/1‑149 (MQ=255)
tttaTCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGNATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGTCATTATTaaa < 1:20914994/147‑1 (MQ=255)
tCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAg < 2:20915752/132‑1 (MQ=255)
cATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTaaaaa > 1:20917115/1‑150 (MQ=255)
tGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCATCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATgc > 2:20917154/1‑131 (MQ=255)
gTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAAc > 1:20917163/1‑149 (MQ=255)
tCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATa < 1:20915285/146‑1 (MQ=255)
tCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACg < 2:20915119/149‑1 (MQ=255)
gtggtgACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATc < 2:20915266/150‑1 (MQ=255)
gtggtgACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATc < 1:20913858/150‑1 (MQ=255)
tggtgACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCg > 1:20917200/1‑150 (MQ=255)
gtgACTTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTc < 2:20914967/150‑1 (MQ=255)
gACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCAc > 2:20917225/1‑150 (MQ=255)
cGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCg < 1:20915203/150‑1 (MQ=255)
ttATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCgg > 1:20917252/1‑149 (MQ=255)
ttATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGATGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGa < 2:20914215/139‑1 (MQ=255)
tataGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCa > 2:20917273/1‑122 (MQ=255)
ccAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGtt < 2:20915989/149‑1 (MQ=255)
ccAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTta > 1:20917302/1‑150 (MQ=255)
ccAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTta < 1:20914199/150‑1 (MQ=255)
cAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTtat < 1:20914790/150‑1 (MQ=255)
aaCGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGAGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGactc > 2:20917332/1‑98 (MQ=255)
aCGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTTAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCg < 2:20914616/139‑1 (MQ=255)
aCGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTatat < 2:20916257/150‑1 (MQ=255)
cGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTatat > 1:20917342/1‑149 (MQ=255)
cGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATc < 1:20914391/150‑1 (MQ=255)
ccACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCAcc < 2:20914697/135‑1 (MQ=255)
aCGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAg > 1:20917384/1‑138 (MQ=255)
cGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCCCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGAc > 2:20917395/1‑148 (MQ=255)
aaaCGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAAt > 1:20917429/1‑150 (MQ=255)
aCGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGAt < 2:20915194/121‑1 (MQ=255)
gCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTta > 2:20917473/1‑135 (MQ=255)
gCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGtt > 1:20917469/1‑150 (MQ=255)
cATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGttt < 1:20914618/150‑1 (MQ=255)
aTCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTTGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGttt < 2:20915565/149‑1 (MQ=255)
tCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCa < 1:20915446/150‑1 (MQ=255)
ccATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCaa > 1:20917515/1‑150 (MQ=255)
aTTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAg > 2:20917542/1‑87 (MQ=255)
aTTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAAtt < 1:20915502/150‑1 (MQ=255)
aTTAATTTGCCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAAt < 2:20915044/140‑1 (MQ=255)
aaTTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTc > 1:20917567/1‑149 (MQ=255)
aTTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTcc < 1:20916223/149‑1 (MQ=255)
tttGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCatt > 2:20917590/1‑93 (MQ=255)
tCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGACGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCa > 1:20917621/1‑150 (MQ=255)
cATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATCTCGACAAATCGTTTCa > 2:20917635/1‑137 (MQ=255)
aTACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCAc < 1:20914897/149‑1 (MQ=255)
aTACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACt < 1:20915814/150‑1 (MQ=255)
ccTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAAt > 1:20917674/1‑135 (MQ=255)
cTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAgcac < 2:20915618/58‑1 (MQ=255)
cTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGaaa < 2:20914341/150‑1 (MQ=255)
cTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGa > 2:20917683/1‑148 (MQ=255)
gCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAAc < 2:20913302/148‑1 (MQ=255)
aggTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCa > 2:20917728/2‑138 (MQ=255)
ggTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAg > 1:20917730/1‑150 (MQ=255)
cAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCAc < 1:20914505/149‑1 (MQ=255)
aaCAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTa < 1:20916473/150‑1 (MQ=255)
aGATCCGTTGGTGATGGTGNACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAAtt > 2:20917780/1‑120 (MQ=255)
aGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCa > 1:20917777/1‑150 (MQ=255)
gATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCAc < 1:20915758/150‑1 (MQ=255)
aTCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCattatt < 2:20913741/69‑1 (MQ=255)
cGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATgccgcc > 2:20917824/1‑60 (MQ=255)
cGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTc < 2:20915491/150‑1 (MQ=255)
cGTGGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTc < 1:20915878/150‑1 (MQ=255)
gTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTc > 1:20917829/1‑149 (MQ=255)
gTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCa < 2:20914804/150‑1 (MQ=255)
ttGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCAc < 2:20915858/144‑1 (MQ=255)
ggTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTctcctc > 2:20917860/1‑43 (MQ=255)
ggTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAAt < 1:20916082/149‑1 (MQ=255)
tGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGc < 1:20915675/150‑1 (MQ=255)
tGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGc < 1:20915955/150‑1 (MQ=255)
tGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATg > 2:20917900/1‑142 (MQ=255)
tGCACCAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAAc > 1:20917900/1‑150 (MQ=255)
cAGCGCCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGgag < 1:20915153/150‑1 (MQ=255)
gcCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGc < 2:20914494/117‑1 (MQ=255)
gcCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAAc > 1:20917950/1‑149 (MQ=255)
gcCACTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAAc > 2:20917951/1‑149 (MQ=255)
cTGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAACCAGaa < 1:20914717/150‑1 (MQ=255)
tGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTaaa > 2:20917999/1‑43 (MQ=255)
tGAGATCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAACCAGa > 1:20917996/1‑148 (MQ=255)
gaTCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAACCAGAAGTc < 2:20916102/149‑1 (MQ=255)
gaTCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAACCAGAAGTCa < 1:20915565/150‑1 (MQ=255)
aTCAGCACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACANCCGGAGAACCAGAAGTCAc < 2:20916491/150‑1 (MQ=255)
|
GACTGAATACCGGTGGTTAAAGCATGACGAAGTTCATCTGTCGTGGTGACGTTATAGCCAACGCCACGAAACGCATCCATTAATTTGTCATACCTTGCATGGTGCAACAGATCCGTTGGTGATGGTGCACCAGCGCCACTGAGATCAACACCGTCTCCTCTGTAGATGCCGCCATTATTAAAAATAACGATCGTCACCGGCAGGTTATATCGACAAATCGTTTCAATTTCCATCCCACTGAAACCAAAAGCACTATCACCTTCAATGGCGACAACCGGAGAACCAGAAGTCACGC > NC_000913/2490356‑2490650
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
