Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F13 I1 R1
|
28 |
562.2 |
19051950 |
96.7% |
18423235 |
140.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,421,855 |
(G)5→6 |
coding (531/1104 nt) |
yhdY → |
putative ABC transporter membrane subunit YhdY |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,421,850 | 1 | . | G | 97.2%
| 2055.2
/ 46.6
| 506 | coding (526/1104 nt) | yhdY | putative ABC transporter membrane subunit YhdY |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (7/7); new base G (219/272); total (227/279) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.88e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.99e-01 |
Only 100 of 544 total aligned reads displayed.
TTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑GGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCGGTCATGCTGCCGTTGTTTATGGCAG > NC_000913/3421701‑3421994
|
gCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑g < 1:6683385/149‑1 (MQ=255)
gCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑g < 2:6683137/149‑1 (MQ=255)
cGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑ggg < 1:6682834/150‑1 (MQ=255)
cGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑ggg > 1:6683659/1‑150 (MQ=255)
cGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑gg < 1:6683261/149‑1 (MQ=255)
gacTGGGGTGTGATTTACCCACTCATAGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑ggg‑gg < 1:6683243/148‑1 (MQ=255)
gCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑ggg‑gg < 1:6682721/150‑1 (MQ=255)
gCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑ggg‑gg < 1:6683337/150‑1 (MQ=255)
ccTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑ggg‑gg > 2:6683663/1‑149 (MQ=255)
tGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑ggg‑gggat > 1:6683670/1‑147 (MQ=255)
tGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTAc < 1:6683024/148‑1 (MQ=255)
aTTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGc > 1:6683682/1‑150 (MQ=255)
ttACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑ggg‑gggat < 2:6683108/139‑4 (MQ=255)
aCCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGtt < 1:6683091/149‑1 (MQ=255)
aCCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGt > 1:6683689/1‑148 (MQ=255)
cccACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTa < 2:6683123/149‑1 (MQ=255)
cTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTGTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑ggg‑g > 2:6683699/1‑128 (MQ=255)
tGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTc < 2:6683273/144‑1 (MQ=255)
gTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTc > 1:6683714/1‑150 (MQ=255)
gtggCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCata < 2:6683248/150‑1 (MQ=255)
gtggCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCat < 1:6683319/149‑1 (MQ=255)
gtggCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCa < 2:6683220/148‑1 (MQ=255)
atggatggCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCg < 2:6682895/148‑1 (MQ=255)
aTGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGAt > 1:6683724/1‑150 (MQ=255)
gTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAATCCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTcgccgc < 2:6682815/134‑1 (MQ=255)
tGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGc < 1:6683198/150‑1 (MQ=255)
ggCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAGCCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCatat < 2:6682987/138‑1 (MQ=255)
ggCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGc < 2:6683004/149‑1 (MQ=255)
gTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAgg > 2:6683728/1‑119 (MQ=255)
ttttttGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCt > 1:6683731/1‑149 (MQ=255)
ttttGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCtt < 1:6683377/148‑1 (MQ=255)
tttGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTAt < 1:6683129/149‑1 (MQ=255)
tttGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTAt < 1:6683181/149‑1 (MQ=255)
tGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCgg > 1:6683741/1‑150 (MQ=255)
gCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCNTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGt > 2:6683740/1‑150 (MQ=255)
tctTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCa > 2:6683749/1‑150 (MQ=255)
gAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCAt < 1:6683446/147‑1 (MQ=255)
aGCGGGTTGAAACGCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATtgtg < 2:6683402/129‑1 (MQ=255)
gCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTa > 1:6683758/1‑150 (MQ=255)
cGGGTTGAATCCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTCTTa < 2:6683378/149‑1 (MQ=255)
cGGGTTGAAANCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATc < 2:6683176/138‑1 (MQ=255)
gggTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATc > 1:6683763/1‑150 (MQ=255)
gAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAAt < 1:6683511/149‑1 (MQ=255)
gAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAAt > 2:6683768/1‑149 (MQ=255)
aaCCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCAt < 1:6683427/136‑1 (MQ=255)
aaCCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCt > 1:6683775/1‑150 (MQ=255)
ccGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATc < 2:6683201/127‑1 (MQ=255)
ccGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCa < 2:6683084/132‑1 (MQ=255)
ccGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCt < 2:6683459/147‑1 (MQ=255)
ccGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGgc > 2:6683779/1‑150 (MQ=255)
ccGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGAGCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTg < 2:6683344/148‑1 (MQ=255)
ggCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGgcgc < 1:6683701/150‑1 (MQ=255)
aaTGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCgcggc > 1:6683789/1‑150 (MQ=255)
aaTGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCgcggc > 2:6683788/1‑150 (MQ=255)
gcgggcTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCg > 1:6683801/1‑150 (MQ=255)
cgggcTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCg > 2:6683802/1‑149 (MQ=255)
gggcTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGc < 1:6683303/149‑1 (MQ=255)
ggcTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCt > 1:6683812/1‑149 (MQ=255)
ggcTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCt > 2:6683809/1‑149 (MQ=255)
gcTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGTCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGt < 2:6683300/142‑1 (MQ=255)
gcTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGa < 1:6682884/150‑1 (MQ=255)
cTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATc > 2:6683819/1‑124 (MQ=255)
tGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGAt > 1:6683824/1‑149 (MQ=255)
gACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGgcg > 2:6683827/1‑133 (MQ=255)
aCGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGTGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTa < 1:6683156/149‑1 (MQ=255)
cGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTAcc > 1:6683838/1‑150 (MQ=255)
gCTAATTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCa < 2:6683288/111‑1 (MQ=255)
gCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGGCGCTCCCAAATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCg > 2:6683840/1‑150 (MQ=255)
cTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑GGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCNATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGt > 1:6683847/1‑149 (MQ=255)
aaCTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTAcc > 2:6683854/1‑146 (MQ=255)
aCTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCTCGGCGTGCCGCTGATTACCGtt > 1:6683859/1‑148 (MQ=255)
cTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGGTGa > 2:6683861/1‑139 (MQ=255)
cTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTg < 1:6683279/150‑1 (MQ=255)
ttAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGtt > 1:6683871/1‑150 (MQ=255)
ttAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTCGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGt > 2:6683873/1‑149 (MQ=255)
tAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGt < 2:6683418/148‑1 (MQ=255)
tAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGt < 1:6683601/148‑1 (MQ=255)
aaTTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGAtt < 2:6683066/83‑1 (MQ=255)
aaTTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGttt < 1:6683400/149‑1 (MQ=255)
ttattGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCTCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGgc < 2:6682953/118‑1 (MQ=255)
attGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGt < 2:6683432/149‑1 (MQ=255)
tGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCt < 1:6683460/149‑1 (MQ=255)
tGCATCAGTCGGGATTGCGGCGGCGCTACC‑GT‑GGGCGGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTGCCGTTCTGTTTATGTCtt > 2:6683881/1‑150 (MQ=255)
cATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCg < 1:6683540/150‑1 (MQ=255)
cATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCg < 1:6683058/150‑1 (MQ=255)
aTCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCgg > 1:6683887/1‑150 (MQ=255)
cAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCg > 2:6683890/1‑130 (MQ=255)
cAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCGGt < 2:6683644/149‑1 (MQ=255)
cAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCAGATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGt < 1:6683366/136‑1 (MQ=255)
gTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCGGTCa > 2:6683898/1‑149 (MQ=255)
gTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCGGTCAt > 1:6683899/1‑150 (MQ=255)
ttGGGATTGCGGGGGCGCTACCGGG‑GGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGGCGCCGCTCCCATATGCCGAGTGTGCGTATCtt < 2:6683228/80‑1 (MQ=255)
ttGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCGGTCAtg < 2:6683485/150‑1 (MQ=255)
ggATTGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTAcc < 2:6683564/123‑1 (MQ=255)
ttGCGGGGGCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGAt > 2:6683905/1‑116 (MQ=255)
gggggCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCGGTCATGCTGCCgttgt > 1:6683914/1‑150 (MQ=255)
ggggCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCGGTCAtg < 2:6683320/139‑1 (MQ=255)
gggCGCTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCtt < 2:6683507/130‑1 (MQ=255)
gcTACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTACCGCTGATTa > 2:6683918/1‑108 (MQ=255)
tACC‑GTGGGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCGGTCATGCTGCCGTTGTTTATgg > 1:6683925/1‑148 (MQ=255)
|
TTGCGGCCTGGGCGGTGATTTACCCACTGATTGTCTGGTGGCTGATGTATGGCGGTTTTTTTGCTCTTGAGCGGGTTGAAACCCGGCAATGGGGCGGGCTGACGCTAACTTTAATTATTGCATCAGTTGGGATTGCGGGGGCGCTACC‑GT‑GGG‑GGATCTTACTGGCGTTAGGTCGCCGCTCCCATATGCCGATTGTGCGTATCTTATCGGTCATTTTTATCGAATTCTGGCGCGGCGTGCCGCTGATTACCGTTCTGTTTATGTCTTCGGTCATGCTGCCGTTGTTTATGGCAG > NC_000913/3421701‑3421994
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
