Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F13 I1 R1
|
28 |
562.2 |
19051950 |
96.7% |
18423235 |
140.8 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,931,561 |
(G)7→8 |
coding (246/1869 nt) |
kup → |
K(+):H(+) symporter Kup |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,931,554 | 1 | . | G | 97.8%
| 2094.2
/ 33.3
| 500 | coding (239/1869 nt) | kup | K(+):H(+) symporter Kup |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (5/6); new base G (254/235); total (259/241) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.65e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 549 total aligned reads displayed.
TACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑GG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGC > NC_000913/3931405‑3931698
|
cacTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑g < 1:7763711/149‑1 (MQ=255)
acTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑gg‑g > 2:7764243/1‑150 (MQ=255)
cTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑gg‑g‑g > 1:7764249/1‑150 (MQ=255)
cTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑gg‑g‑g < 1:7763820/150‑1 (MQ=255)
gTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑gg‑g‑gggg > 1:5028794/1‑149 (MQ=255)
gTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑gg‑g‑gggg > 1:7764259/1‑149 (MQ=255)
tGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTAATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTCA‑gg‑g‑g > 2:7764262/1‑145 (MQ=255)
aTGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑gg‑g‑gggggatcc > 1:7764269/1‑145 (MQ=255)
tGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCt < 1:7763907/150‑1 (MQ=255)
tGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACg > 2:7764275/1‑150 (MQ=255)
tGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACg > 1:7764278/1‑150 (MQ=255)
ccGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACgat > 1:7764288/1‑147 (MQ=255)
cGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGa > 2:7764288/1‑150 (MQ=255)
gCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGCTAACGCCGGGGA‑GGCG‑GGGGATCCTGACGTTGATg > 1:7764296/1‑150 (MQ=255)
cAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTc > 1:7764302/1‑150 (MQ=255)
cAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTc < 1:7763736/150‑1 (MQ=255)
gTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTg < 2:7763887/137‑1 (MQ=255)
tttGGTTTTGGCGCTGAACGCGGTGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAACCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCt < 1:7763413/150‑1 (MQ=255)
tGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTg > 1:7764308/1‑150 (MQ=255)
gTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGcc < 1:7763607/150‑1 (MQ=255)
gTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGc < 1:7763652/149‑1 (MQ=255)
ttGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCggg > 2:7764313/1‑150 (MQ=255)
ggCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCCGGc > 1:7764321/1‑149 (MQ=255)
gTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGCCGtt > 2:7764324/1‑129 (MQ=255)
gAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATAc > 1:7764330/1‑150 (MQ=255)
gcgATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTg < 2:7763800/133‑1 (MQ=255)
gcgATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCg > 1:7764340/1‑150 (MQ=255)
gcgATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCg > 2:7764339/1‑150 (MQ=255)
cgATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCgg < 1:7763531/150‑1 (MQ=255)
gATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGgc > 1:7764346/1‑150 (MQ=255)
ccGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGcgcg < 1:7763953/149‑1 (MQ=255)
cGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACNTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGa > 2:7764355/1‑149 (MQ=255)
tttGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACcac < 2:7764059/150‑1 (MQ=255)
tttGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACca > 1:7764364/1‑149 (MQ=255)
ttGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCgg > 2:7764366/1‑125 (MQ=255)
ttgCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGgcg < 1:7763867/138‑1 (MQ=255)
gCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATc > 1:7764371/1‑149 (MQ=255)
cTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCaa < 2:7763832/150‑1 (MQ=255)
tATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCt < 1:7763789/149‑1 (MQ=255)
aTCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTgg > 2:7764377/1‑150 (MQ=255)
gCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTg < 2:7763987/149‑1 (MQ=255)
tGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGGTGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACAt < 2:7763532/136‑1 (MQ=255)
tGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGAt > 1:7764385/1‑149 (MQ=255)
gATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTa > 1:7764392/1‑150 (MQ=255)
aTCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTAt > 2:7764393/1‑150 (MQ=255)
aTCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑GG‑GTGGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCaa < 2:7763593/137‑1 (MQ=255)
cttctGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGAt > 2:7764400/1‑145 (MQ=255)
tctGGCTGTTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGAAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTg < 2:7763638/141‑1 (MQ=255)
ctGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATggg < 1:7763843/148‑1 (MQ=255)
ctGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATg < 1:7764224/146‑1 (MQ=255)
ctGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGc > 1:7764409/1‑150 (MQ=255)
tGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGAtt > 2:7764412/1‑142 (MQ=255)
ctgctAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTa < 2:7763969/148‑1 (MQ=255)
ctgctAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAAt > 1:7764420/1‑150 (MQ=255)
tgctAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATggg < 2:7763934/143‑1 (MQ=255)
tgctAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATc > 2:7764421/1‑150 (MQ=255)
ctAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATcgg < 1:7764060/150‑1 (MQ=255)
ctAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATcg < 2:7763872/149‑1 (MQ=255)
ctAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATc < 1:7764163/148‑1 (MQ=255)
aaTCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATcggcg > 1:7764433/1‑150 (MQ=255)
aTCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGa > 2:7764435/1‑131 (MQ=255)
aTCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATcggcgg < 2:7763856/150‑1 (MQ=255)
aTCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATcggcg < 2:7763902/149‑1 (MQ=255)
tCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATcggcgg > 1:7764440/1‑149 (MQ=255)
tgtgGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCa < 2:7763785/147‑1 (MQ=255)
tgGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCttt < 2:7763662/150‑1 (MQ=255)
gTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCttttt > 2:7764448/1‑150 (MQ=255)
gTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCttttt > 1:7764452/1‑150 (MQ=255)
tCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTa > 2:7764460/1‑150 (MQ=255)
tCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTa > 1:7764463/1‑150 (MQ=255)
ccATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTa < 1:7764079/149‑1 (MQ=255)
cATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATg > 2:7764468/1‑150 (MQ=255)
aTTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATgg < 1:7763763/150‑1 (MQ=255)
tAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGt > 2:7764476/1‑149 (MQ=255)
aaaTATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGt > 1:7764482/1‑148 (MQ=255)
aaTATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGaa < 1:7764008/150‑1 (MQ=255)
atatCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGa < 2:7763765/111‑1 (MQ=255)
atCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGt > 2:7764487/1‑144 (MQ=255)
ctcACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAgtcgt > 1:7764491/1‑150 (MQ=255)
aCCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGGGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGAtt < 2:7763718/106‑1 (MQ=255)
aCCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGGGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAgtcgtc < 2:7764132/148‑1 (MQ=255)
ccTTCGTGATGCGGGGAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATg < 2:7763681/108‑1 (MQ=255)
ctgcGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCAt < 2:7764100/145‑1 (MQ=255)
cTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATa < 2:7763819/149‑1 (MQ=255)
cGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAacac > 2:7764499/1‑150 (MQ=255)
cGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAacac > 1:7764502/1‑150 (MQ=255)
gTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAacac < 1:7763930/149‑1 (MQ=255)
tGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACAccc < 1:7764107/150‑1 (MQ=255)
gATGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATc > 1:7764511/1‑110 (MQ=255)
aTGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAgtcgtc < 2:7764016/139‑1 (MQ=255)
aTGCGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGc > 2:7764510/1‑150 (MQ=255)
cGGGCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTAt < 1:7763977/150‑1 (MQ=255)
gggCCGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAacac < 2:7763747/142‑1 (MQ=255)
gggCAGATAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTAtt > 1:7764519/1‑150 (MQ=255)
aTAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGt > 1:7764528/1‑149 (MQ=255)
aTAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTg < 1:7764027/150‑1 (MQ=255)
tAACGCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTg > 2:7764528/1‑149 (MQ=255)
gCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGGTTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCg > 2:7764534/1‑134 (MQ=255)
gCCGGTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCt < 2:7763947/110‑1 (MQ=255)
ggTGAGGG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGc > 1:7764543/1‑150 (MQ=255)
|
TACACTTCGTGAATGTTTGTCCGGCCAGTTTGGTTTTGGCGTTGAACGCGATGCCGTGTTTGGCTTTTTATCGCTGATCTTCTGGCTGCTAATCTTTGTGGTTTCCATTAAATATCTCACCTTCGTGATGCGGGCAGATAACGCCGGTGA‑GG‑G‑GGGGATCCTGACGTTGATGTCGCTTGCCGGGCGTAATACGTCGGCGCGAACCACATCAATGCTGGTGATTATGGGGCTAATCGGCGGCAGCTTTTTCTATGGTGAAGTCGTCATAACACCCGCTATTTCGGTGATGTCAGC > NC_000913/3931405‑3931698
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
