Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F13 I1 R1
|
18 |
2625.4 |
86379875 |
99.4% |
85861595 |
141.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,479,026 |
A→G |
K267K (AAA→AAG) |
ynbB → |
putative CDP‑diglyceride synthase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,479,026 | 0 | A | G | 98.4%
| 9457.5
/ 68.7
| 2310 | K267K (AAA→AAG) | ynbB | putative CDP‑diglyceride synthase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (14/22); new base G (985/1289); total (999/1311) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 6.16e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2320 total aligned reads displayed.
GCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTGGGGAACATTTTTTT > NC_000913/1478880‑1479173
|
gTCACTGATTATCGGACCGTTACTTACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTAtt < 1:13328125/150‑1 (MQ=255)
cACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGc > 1:13330856/1‑150 (MQ=255)
tGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCATCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGcc > 2:13330871/1‑148 (MQ=255)
aTTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAgg < 1:13330198/149‑1 (MQ=255)
aTTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAgg < 2:13328145/149‑1 (MQ=255)
tATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACa > 1:13330896/1‑150 (MQ=255)
aTCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACa < 1:13329282/149‑1 (MQ=255)
tCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACAt < 2:13328482/149‑1 (MQ=255)
ggACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGc < 1:13328929/150‑1 (MQ=255)
aCCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTAt > 2:13330939/1‑134 (MQ=255)
cGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGAc > 1:13330954/1‑150 (MQ=255)
gTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACt < 2:13329209/150‑1 (MQ=255)
gACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTGAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGc > 2:13331012/1‑128 (MQ=255)
gACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGa > 1:13331011/1‑150 (MQ=255)
gCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGAt < 1:13328734/150‑1 (MQ=255)
cTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGAtt > 2:13331063/1‑150 (MQ=255)
tAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGAtt > 1:13331075/1‑149 (MQ=255)
aaTACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGa < 2:13328766/149‑1 (MQ=255)
aCATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCa > 2:13331121/1‑150 (MQ=255)
aCATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCa > 1:13331125/1‑150 (MQ=255)
cATTACAGGCATTATTAGCTGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCAt < 2:13327711/150‑1 (MQ=255)
ttACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTa < 2:13329280/150‑1 (MQ=255)
tACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTaa > 1:13331169/1‑150 (MQ=255)
aGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAg > 2:13331190/1‑133 (MQ=255)
gCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATGAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAAtttt < 1:13327931/149‑1 (MQ=255)
attattAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCAc > 1:13331228/1‑150 (MQ=255)
ttattaGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCAcc > 2:13331238/1‑150 (MQ=255)
attaGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCg < 2:13328002/149‑1 (MQ=255)
aGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTcc > 1:13331278/1‑150 (MQ=255)
aGCGGGTTTGTTAATTGGTACTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTc < 1:13329365/149‑1 (MQ=255)
tgggTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCAcc < 2:13328593/142‑1 (MQ=255)
gggTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCgg > 2:13331297/1‑149 (MQ=255)
gTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTAt < 1:13329121/150‑1 (MQ=255)
tttGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGTACATGGCGGTCTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTa < 2:13329921/148‑1 (MQ=255)
tGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTAtttt > 1:13331333/1‑150 (MQ=255)
tGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTAttt < 2:13329136/149‑1 (MQ=255)
ttAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTAtttttt > 2:13331341/1‑150 (MQ=255)
aaTTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTAttttttt < 2:13329620/149‑1 (MQ=255)
aaTTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTtttta > 1:13331371/1‑150 (MQ=255)
ggTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTttttattt < 1:13329899/149‑1 (MQ=255)
gTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGTCTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTttttatttta > 2:13331400/1‑150 (MQ=255)
gTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTttttatttta < 1:13326116/150‑1 (MQ=255)
tATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTtttattttat < 1:13328636/150‑1 (MQ=255)
tATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTttttatttta > 1:13331407/1‑149 (MQ=255)
tAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACg > 1:13331442/1‑150 (MQ=255)
aGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACg < 1:13329448/149‑1 (MQ=255)
gTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGc < 1:13329032/149‑1 (MQ=255)
gTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTCTTTTTTTATTTTATACGCTAc > 2:13331464/1‑149 (MQ=255)
gTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTAc < 1:13328523/149‑1 (MQ=255)
tttGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTActgct > 1:13331489/1‑150 (MQ=255)
ttGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTAt < 2:13328276/125‑1 (MQ=255)
ttGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTActgct < 1:13329582/149‑1 (MQ=255)
tgaggggATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCg < 2:13328670/114‑1 (MQ=255)
tGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTActgctg < 1:13329195/149‑1 (MQ=255)
gcggcgATGTCGTGATGTCNGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTActgctgg > 2:13331511/1‑148 (MQ=255)
gcggcgATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAAtttt < 2:13329468/109‑1 (MQ=255)
cggcgATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTa < 2:13329410/150‑1 (MQ=255)
ggcgATTTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTActgc < 2:13329065/144‑1 (MQ=255)
ggcgATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTGTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATAc > 1:13331534/1‑136 (MQ=255)
gcgATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTc < 2:13329545/114‑1 (MQ=255)
gcgATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACt < 1:13329987/150‑1 (MQ=255)
gATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTAc > 2:13331552/1‑147 (MQ=255)
gATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGa < 1:13330611/150‑1 (MQ=255)
gATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGa < 1:13327579/150‑1 (MQ=255)
tCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAgg < 1:13328850/149‑1 (MQ=255)
tCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAg > 1:13331579/1‑148 (MQ=255)
gTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTAATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGaaa < 1:13329796/150‑1 (MQ=255)
tGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAg > 2:13331608/1‑145 (MQ=255)
gATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGaaaa > 1:13331621/1‑149 (MQ=255)
tCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATagag < 2:13326999/150‑1 (MQ=255)
aGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAgaga > 1:13331655/1‑149 (MQ=255)
aGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGaa < 2:13329842/150‑1 (MQ=255)
gCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGaaa < 2:13329773/150‑1 (MQ=255)
cATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAAt > 2:13331668/1‑150 (MQ=255)
cATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAAt < 1:13328375/150‑1 (MQ=255)
tCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATgg < 2:13330408/150‑1 (MQ=255)
aaaCGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGa > 1:13331693/1‑149 (MQ=255)
gagaTATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGagaa > 1:13331733/1‑148 (MQ=255)
gagaTATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAAtt < 2:13328933/150‑1 (MQ=255)
agaTATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAAtt > 2:13331736/1‑149 (MQ=255)
atatTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCa < 2:13329700/149‑1 (MQ=255)
atatTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCAc < 2:13330257/150‑1 (MQ=255)
tatTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACg < 2:13330100/150‑1 (MQ=255)
tatTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACg < 1:13330330/150‑1 (MQ=255)
atTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACt > 2:13331773/1‑118 (MQ=255)
ttGGTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGc < 1:13329520/149‑1 (MQ=255)
ggTGTTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATc > 1:13331788/1‑150 (MQ=255)
gtgtTAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATc < 2:13330029/149‑1 (MQ=255)
tAAAGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTgg > 2:13331815/1‑150 (MQ=255)
aaGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTGCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAg < 2:13328989/112‑1 (MQ=255)
aaGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTgggg < 1:13330075/150‑1 (MQ=255)
aaGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTggg < 1:13329716/149‑1 (MQ=255)
aGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTttttatttta > 2:13331851/1‑89 (MQ=255)
aGATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTgggg > 1:13331843/1‑149 (MQ=255)
gATAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTGGGGaa < 2:13329346/150‑1 (MQ=255)
aTAGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTGGGGAAc < 1:13329634/150‑1 (MQ=255)
aGCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTGGGGAACAt > 1:13331888/1‑150 (MQ=255)
gCGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTGGGGAACa < 2:13330725/148‑1 (MQ=255)
cGGAAAGCTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTGGGGAACAttt > 2:13331895/1‑150 (MQ=255)
aaagCTATTGCCAGGACATGGCGGGCTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTGGGGAACAtttttt < 2:13328832/150‑1 (MQ=255)
|
GCGTCACTGATTATCGGACCGTTACTGACACCGCTAAATACATTACAGGCATTATTAGCGGGTTTGTTAATTGGTATTAGTGGTTTTTGCGGCGATGTCGTGATGTCAGCCATCAAACGAGATATTGGTGTTAAAGATAGCGGAAAACTATTGCCAGGACATGGCGGACTCCTTGACAGGATTGACTCATTAATTTTCACCGCTCCGGTATTTTTTTATTTTATACGCTACTGCTGTTACTGAAGGAAAATAGAGAAAATGGAAAATTCACGCATCCCTGGGGAACATTTTTTT > NC_000913/1478880‑1479173
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
