Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F13 I1 R1
|
18 |
2625.4 |
86379875 |
99.4% |
85861595 |
141.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
1,491,244 |
T→C |
F115L (TTT→CTT) |
cybB → |
cytochrome b561 |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 1,491,244 | 0 | T | C | 98.6%
| 9502.0
/ 60.9
| 2315 | F115L (TTT→CTT) | cybB | cytochrome b561 |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (16/16); new base C (1141/1139); total (1158/1157) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2434 total aligned reads displayed.
TACCCAACCCCGCCGATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGTTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTATTTCTGGAAGGAC > NC_000913/1491097‑1491393
|
tACCCAACCCCGCCGATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCgctt < 2:13430210/150‑1 (MQ=255)
aCCCAACCCCGCCGATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTGTGCgcttg > 2:13432080/1‑150 (MQ=255)
aaCCCCGCCGATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCgcttggttt > 1:13432121/1‑150 (MQ=255)
ccgccgATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCgcttggtt > 2:13432148/1‑145 (MQ=255)
ccgccgATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACg < 1:13426201/150‑1 (MQ=255)
cgccgATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGa < 1:13430087/150‑1 (MQ=255)
ccgATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATg > 1:13432178/1‑150 (MQ=255)
ccgATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATg < 1:13430249/150‑1 (MQ=255)
ccgATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATg < 1:13430401/150‑1 (MQ=255)
ttATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGAGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCt > 1:13432220/1‑149 (MQ=255)
tataCCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTa > 2:13432226/1‑150 (MQ=255)
ataCCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTa < 1:13431388/149‑1 (MQ=255)
aCCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGc > 1:13432259/1‑150 (MQ=255)
aGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCtt > 2:13432285/1‑147 (MQ=255)
cAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTAc < 1:13432307/140‑1 (MQ=255)
aaaCCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGcc < 2:13430775/150‑1 (MQ=255)
aaaCCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGc > 1:13432349/1‑149 (MQ=255)
cGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAAtt < 1:13429887/150‑1 (MQ=255)
gatgatGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCa > 2:13432393/1‑146 (MQ=255)
gatgatGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAAttt > 1:13432391/1‑150 (MQ=255)
atgatgACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTc < 2:13430968/150‑1 (MQ=255)
atgaCGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGaa > 1:13432430/1‑150 (MQ=255)
gaCGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACg > 2:13432449/1‑150 (MQ=255)
gggACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACggg > 1:13432477/1‑149 (MQ=255)
ggACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTa < 2:13430327/150‑1 (MQ=255)
agACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTc < 2:13429117/127‑1 (MQ=255)
gACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAg < 1:13431019/150‑1 (MQ=255)
gACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAAAggg > 2:13432495/1‑147 (MQ=255)
aCTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGa < 1:13429817/150‑1 (MQ=255)
cgcATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCTGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGAc < 2:13428701/106‑1 (MQ=255)
cgcATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGTTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCt > 1:13432537/1‑150 (MQ=255)
gcATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCaga < 2:13430049/123‑1 (MQ=255)
gcATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCt > 2:13432539/1‑149 (MQ=255)
cATTTGGGACATTTGTTGATTTATCTCCTGTTTAGTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTAGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAAAGGCCAATTTAGAACGGGTAATTAGCTTa < 2:13430485/150‑1 (MQ=255)
cATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTa < 1:13430324/150‑1 (MQ=255)
aTTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACggg < 2:13429557/138‑1 (MQ=255)
tGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGt > 1:13432584/1‑150 (MQ=255)
gggACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTc > 2:13432587/1‑150 (MQ=255)
ggACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCg < 2:13429989/150‑1 (MQ=255)
ggACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCg < 1:13429557/150‑1 (MQ=255)
ggACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCg < 1:13429976/150‑1 (MQ=255)
tttGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCTTTACGCTTCAGAGGCCAAttt > 2:13432638/1‑120 (MQ=255)
tttGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCa > 1:13432638/1‑150 (MQ=255)
tttGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCa < 1:13431081/150‑1 (MQ=255)
tGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCAt < 1:13429457/149‑1 (MQ=255)
aTTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGTACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAAc > 2:13432685/1‑149 (MQ=255)
aTTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACg < 1:13429346/150‑1 (MQ=255)
tttATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTGAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGc > 1:13432691/1‑150 (MQ=255)
tctcCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGc > 1:13432733/1‑150 (MQ=255)
ctcCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGc > 2:13432750/1‑149 (MQ=255)
tcCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAg < 2:13430139/121‑1 (MQ=255)
ccTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGaa > 1:13432773/1‑150 (MQ=255)
cTGTTTATTGCGCTGCCAGTGAGTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAAt < 2:13429857/150‑1 (MQ=255)
cTGGTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGTTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGaa < 1:13430766/149‑1 (MQ=255)
tttATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCt < 1:13432055/149‑1 (MQ=255)
ttATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAGACGCTGGCGACTc > 1:13432819/1‑147 (MQ=255)
ttATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTgg > 2:13432808/1‑150 (MQ=255)
aTTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTggg < 1:13429115/149‑1 (MQ=255)
gcgcTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGatat > 2:13432853/1‑150 (MQ=255)
gcgcTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGGTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATa < 2:13430419/109‑1 (MQ=255)
cgcTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGatat < 1:13428911/149‑1 (MQ=255)
cgcTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATAtt > 1:13432871/1‑150 (MQ=255)
cTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTc > 2:13432903/1‑116 (MQ=255)
gCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGt > 1:13432920/1‑150 (MQ=255)
ccAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTc < 1:13430677/150‑1 (MQ=255)
cAGGGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTc < 2:13429698/76‑1 (MQ=255)
aGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCa > 2:13432953/1‑149 (MQ=255)
tGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATc < 2:13430914/149‑1 (MQ=255)
tGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCg < 1:13430543/150‑1 (MQ=255)
tGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCg > 1:13432972/1‑150 (MQ=255)
tggtttggtGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGt < 2:13429367/149‑1 (MQ=255)
tggtttggtGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGt < 1:13431578/149‑1 (MQ=255)
tggtttggtGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGACATGAAACGCTGGCGAATCTGGGa > 2:13433004/1‑133 (MQ=255)
ggtttggtGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGtt < 1:13430593/149‑1 (MQ=255)
gtttggtGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTg > 1:13433020/1‑149 (MQ=255)
tttggtGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCa < 2:13432325/150‑1 (MQ=255)
ggtGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCtt > 2:13433053/1‑93 (MQ=255)
gatgatGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGc > 1:13433067/1‑150 (MQ=255)
atgTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCt > 1:13433104/1‑150 (MQ=255)
tgTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCg > 2:13433111/1‑146 (MQ=255)
tataACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCa < 2:13431638/150‑1 (MQ=255)
ataACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGc > 1:13433138/1‑135 (MQ=255)
taACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACt < 2:13431241/150‑1 (MQ=255)
aCCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTgg > 2:13433167/1‑150 (MQ=255)
aCCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTg < 2:13430584/149‑1 (MQ=255)
cGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGca > 1:13433185/1‑150 (MQ=255)
cGGGGCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGca < 1:13430843/150‑1 (MQ=255)
ggggCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGcac < 1:13430480/150‑1 (MQ=255)
gggCAACCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCAc < 2:13431119/143‑1 (MQ=255)
aaCCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCAcacca > 1:13433231/1‑149 (MQ=255)
aaCCCGTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCAcacca > 2:13433227/1‑149 (MQ=255)
gTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTAttt < 2:13431452/150‑1 (MQ=255)
gTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTAttt > 1:13433273/1‑150 (MQ=255)
gTGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTAttt < 1:13429714/150‑1 (MQ=255)
tGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTNGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTATTTc > 2:13433280/1‑150 (MQ=255)
tGGTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACCGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTATTTc < 1:13431188/150‑1 (MQ=255)
ggTTTGCGCTTGGTTTGACGTTGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTATTTc < 2:13430682/149‑1 (MQ=255)
gTTTGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTATTTCt < 1:13430914/149‑1 (MQ=255)
ttGCGCTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTATTTCTgg > 1:13433316/1‑149 (MQ=255)
cGTTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTATTTCTGGAAgg < 2:13430830/150‑1 (MQ=255)
|
TACCCAACCCCGCCGATTATACCTAAGCCAAAACCGATGATGACGGGACTGGCGCATTTGGGACATTTGGTGATTTATCTCCTGTTTATTGCGCTGCCAGTGATTGGTTTGGTGATGATGTATAACCGGGGCAACCCGTGGTTTGCGTTTGGTTTGACGATGCCTTACGCTTCAGAGGCCAATTTCGAACGGGTAGATAGCTTAAAGTCGTGGCATGAAACGCTGGCGAATCTGGGATATTTTGTCATCGGGTTGCACGCTGCGGCTGCACTGGCACACCACTATTTCTGGAAGGAC > NC_000913/1491097‑1491393
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
