Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F13 I1 R1
|
18 |
2625.4 |
86379875 |
99.4% |
85861595 |
141.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,168,456 |
T→C |
intergenic (‑150/‑256) |
yegR ← / → yegS |
uncharacterized protein YegR/lipid kinase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,168,456 | 0 | T | C | 98.7%
| 9829.5
/ 63.0
| 2388 | intergenic (‑150/‑256) | yegR/yegS | uncharacterized protein YegR/lipid kinase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (12/20); new base C (1140/1214); total (1153/1235) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.85e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2388 total aligned reads displayed.
CACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGCTCCTGGTGGTAACCACTGAATC > NC_000913/2168309‑2168601
|
aCCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAAc > 2:19121644/1‑150 (MQ=255)
cTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTGTAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCTCTTCAGGGCAACTc > 1:19121668/1‑150 (MQ=255)
cccccATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCa < 1:19118757/149‑1 (MQ=255)
cATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATgggg > 1:19121719/1‑150 (MQ=255)
aTTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATggggg < 1:19119710/150‑1 (MQ=255)
aTTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATggggg < 1:19120810/150‑1 (MQ=255)
aaTACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCtt > 1:19121762/1‑149 (MQ=255)
tACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCa < 2:19119028/138‑1 (MQ=255)
ccAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATCAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAat > 2:19121794/1‑149 (MQ=255)
ccAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAata < 1:19120134/150‑1 (MQ=255)
cAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAatat < 1:19119065/150‑1 (MQ=255)
cAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAatat < 1:19119782/150‑1 (MQ=255)
cAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAata > 1:19121804/1‑149 (MQ=255)
cacTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAAtatattata > 2:19121846/1‑150 (MQ=255)
acTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAAtatattatat > 1:19121861/1‑150 (MQ=255)
ctccctAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAAtatattatat < 1:19118264/149‑1 (MQ=255)
ctctAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGc < 2:19119141/132‑1 (MQ=255)
ctctAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAata < 2:19118875/139‑1 (MQ=255)
tctAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACAGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTg > 2:19121895/1‑148 (MQ=255)
tAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGa < 1:19120072/147‑1 (MQ=255)
tAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGa < 1:19115466/147‑1 (MQ=255)
aGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGAt > 1:19121918/1‑150 (MQ=255)
gtgtTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAAtatattata < 2:19119642/141‑1 (MQ=255)
gtgtTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGa < 1:19119541/148‑1 (MQ=255)
tttAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCa > 2:19121946/1‑150 (MQ=255)
ttAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCAc > 1:19121963/1‑150 (MQ=255)
aaaTATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACt < 2:19119852/149‑1 (MQ=255)
aaTATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGACGCCACt > 2:19122000/1‑148 (MQ=255)
tataATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGtt > 1:19122022/1‑149 (MQ=255)
taataaTGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACt > 2:19122046/1‑144 (MQ=255)
taataaTGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAg < 1:19120247/150‑1 (MQ=255)
ataatGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGt < 2:19119946/149‑1 (MQ=255)
taatGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGtt > 2:19122077/1‑149 (MQ=255)
aatGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTg > 1:19122088/1‑149 (MQ=255)
atGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGa < 2:19118708/149‑1 (MQ=255)
cATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAatat > 2:19122124/1‑149 (MQ=255)
aTGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAatat > 1:19122144/1‑148 (MQ=255)
aTGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTa < 2:19120285/150‑1 (MQ=255)
tGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAg < 2:19120451/150‑1 (MQ=255)
ttattaTAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGt > 1:19122182/1‑132 (MQ=255)
ttattaTAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGta < 2:19119316/150‑1 (MQ=255)
ttattaTAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGta > 2:19122177/1‑150 (MQ=255)
ttattaTAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGt < 2:19119542/149‑1 (MQ=255)
ttattaTAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGt < 2:19120166/149‑1 (MQ=255)
tattatAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAg < 2:19120049/146‑1 (MQ=255)
ataATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGTACATTGAGGCCCTTCAGCGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGtt < 2:19119236/128‑1 (MQ=255)
ataATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATg < 2:19120367/149‑1 (MQ=255)
ataATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATg > 2:19122226/1‑149 (MQ=255)
taATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGc < 1:19120004/149‑1 (MQ=255)
taATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATAGTAGGTATATGct > 1:19122235/1‑150 (MQ=255)
aaTTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGtt < 2:19118399/131‑1 (MQ=255)
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gAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCtttt > 2:19122274/1‑150 (MQ=255)
aaTAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCttttt < 1:19119628/150‑1 (MQ=255)
aaTAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCtttt < 2:19119763/149‑1 (MQ=255)
aaTAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCtttt < 1:19119260/149‑1 (MQ=255)
aTAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCtttttt < 1:19121100/150‑1 (MQ=255)
ggATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTg > 2:19122324/1‑148 (MQ=255)
ggATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGa < 2:19120830/149‑1 (MQ=255)
gATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGaaa < 1:19120530/150‑1 (MQ=255)
gATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGaaa > 1:19122334/1‑150 (MQ=255)
aTTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAAt < 1:19120696/150‑1 (MQ=255)
ttATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAAtt < 1:19119382/150‑1 (MQ=255)
ataataAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTa > 2:19122374/1‑150 (MQ=255)
ataataAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTa > 1:19122381/1‑150 (MQ=255)
taataaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATNTGCTCTTTTTTGAAATTTa < 2:19120620/149‑1 (MQ=255)
ataaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATc < 1:19120388/149‑1 (MQ=255)
ataaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATc < 1:19119931/149‑1 (MQ=255)
taaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATAtt > 2:19122418/1‑120 (MQ=255)
taaATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCgg < 2:19119412/150‑1 (MQ=255)
aaTGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTg > 1:19122434/1‑150 (MQ=255)
tGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGc < 1:19118924/150‑1 (MQ=255)
ttCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCa > 2:19122460/1‑149 (MQ=255)
cTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGcc > 1:19122486/1‑150 (MQ=255)
tACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGt > 2:19122518/1‑149 (MQ=255)
acaacaTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGt > 1:19122530/1‑148 (MQ=255)
caacaTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTa < 1:19119860/149‑1 (MQ=255)
caacaTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTa < 1:19121413/149‑1 (MQ=255)
caTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCttttt > 2:19122570/1‑121 (MQ=255)
caTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTAt > 1:19122570/1‑150 (MQ=255)
aTTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAg < 1:19120943/139‑1 (MQ=255)
tttCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTc < 1:19119472/150‑1 (MQ=255)
tttCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTc < 1:19120291/150‑1 (MQ=255)
ccTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCttttt > 2:19122623/1‑116 (MQ=255)
ccTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCt > 1:19122619/1‑150 (MQ=255)
cATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTcc > 1:19122664/1‑150 (MQ=255)
aTAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTa > 2:19122671/1‑136 (MQ=255)
ggAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATg > 2:19122717/1‑96 (MQ=255)
ggAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGc > 1:19122715/1‑149 (MQ=255)
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aTTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGc < 1:19118563/150‑1 (MQ=255)
cGGACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGCTCCt < 1:19120458/150‑1 (MQ=255)
ggACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATCTTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGCTCCtg > 1:19122761/1‑150 (MQ=255)
gACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGCTCCtg < 2:19121149/149‑1 (MQ=255)
gACATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTATAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGCTCCtgg > 2:19122762/1‑150 (MQ=255)
cATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGCTCCtggtg < 1:19120601/150‑1 (MQ=255)
cATTGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGCTCCtggtg < 1:19120186/150‑1 (MQ=255)
tGAGGCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCaa > 2:19122801/1‑137 (MQ=255)
ggCCCTTCAGGGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGCTCCtggtg > 1:19122822/1‑144 (MQ=255)
cccTTCAGTGCAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTCAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTcccc < 2:19121723/125‑1 (MQ=255)
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CACCTTCCCCCATTAAATACCAACGACACTCTCTAGTGTTTAAATATAATAATGGCATGATTATTATAATTGAATAGGATTATAATAAATGTTCTGTACAACATTTCCTACATAAGTAGGAATTACGGACATTGAGGCCCTTCAGGGTAACTCCATGGGGGCTTTAATATATTATATTGAAGATGCCACTGTTTAGTTGAATATTAGGTATATGCTCTTTTTTGAAATTTATCGGTGGCAGCCGTTAGTATTCGCTGTCCCCATTGCAAGCTCCTGGTGGTAACCACTGAATC > NC_000913/2168309‑2168601
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
