Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F13 I1 R1
|
15 |
2083.3 |
68373553 |
99.6% |
68100058 |
141.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,213,249 |
A→G |
F466L (TTT→CTT) |
btsS ← |
high‑affinity pyruvate receptor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,213,249 | 0 | A | G | 99.2%
| 8538.9
/ 24.2
| 2049 | F466L (TTT→CTT) | btsS | high‑affinity pyruvate receptor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (7/10); new base G (914/1115); total (923/1126) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.11e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2063 total aligned reads displayed.
TTACCGGTTGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACTCCGAAGGCCGCTTTA > NC_000913/2213102‑2213395
|
ccGGTTGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCgg < 1:16183169/150‑1 (MQ=255)
ggTTGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGc < 1:16181949/150‑1 (MQ=255)
gTTGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCggg > 2:16184532/1‑148 (MQ=255)
gTTGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGc > 1:16184531/1‑149 (MQ=255)
aTACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAAtt < 1:16182253/149‑1 (MQ=255)
aCAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATtgct > 1:16184570/1‑150 (MQ=255)
cAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATtgctg < 1:16182377/150‑1 (MQ=255)
aaaCCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATtgctgc > 2:16184580/1‑150 (MQ=255)
aCCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGctgctg < 1:16182566/150‑1 (MQ=255)
ccGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTgg > 1:16184611/1‑150 (MQ=255)
ggCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGa < 1:16182640/150‑1 (MQ=255)
cATTGTCTTCAATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGGTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGAt > 1:16184642/1‑149 (MQ=255)
aTTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATaa < 1:16182470/150‑1 (MQ=255)
tCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTggg > 2:16184680/1‑142 (MQ=255)
cTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCt > 1:16184690/1‑149 (MQ=255)
cGATCTCCAGCATCAAGTGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGc < 2:16182574/149‑1 (MQ=255)
aTCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAANCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCgg > 2:16184731/1‑149 (MQ=255)
aTCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCgg > 1:16184727/1‑149 (MQ=255)
ccAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAg > 2:16184761/1‑150 (MQ=255)
cAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATa < 2:16182429/148‑1 (MQ=255)
cAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAg > 1:16184774/1‑149 (MQ=255)
cAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAg < 1:16183235/149‑1 (MQ=255)
cATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAAt < 2:16183170/150‑1 (MQ=255)
tCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGt > 1:16184808/1‑150 (MQ=255)
cAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGtt > 2:16184813/1‑150 (MQ=255)
aTGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGAc < 2:16183614/150‑1 (MQ=255)
tGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGAcc > 1:16184841/1‑150 (MQ=255)
tGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGAcc < 1:16183110/150‑1 (MQ=255)
tGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACGCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCggg < 2:16182876/107‑1 (MQ=255)
ttGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGc < 2:16182174/130‑1 (MQ=255)
ccccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCaa > 2:16184871/1‑150 (MQ=255)
ccccTCACGGCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGAt < 2:16183015/118‑1 (MQ=255)
cccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCa < 1:16182856/148‑1 (MQ=255)
ccTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAAcc < 1:16183452/150‑1 (MQ=255)
cTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACcg > 1:16184890/1‑150 (MQ=255)
aCGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACcgcg < 1:16181526/149‑1 (MQ=255)
aCGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACcgcg < 2:16183104/149‑1 (MQ=255)
aCGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACcgc < 1:16179708/148‑1 (MQ=255)
cGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATa > 1:16184918/1‑112 (MQ=255)
gTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACt > 2:16184920/1‑150 (MQ=255)
gggCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGa < 1:16183918/150‑1 (MQ=255)
cgcTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAgc > 1:16184959/1‑150 (MQ=255)
cgcTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGATGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAgc > 2:16184965/1‑150 (MQ=255)
cTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAgcgc < 1:16183046/150‑1 (MQ=255)
tGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATg > 1:16184992/1‑122 (MQ=255)
tGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAgcgc > 2:16185010/1‑145 (MQ=255)
tGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAgcg < 2:16182958/144‑1 (MQ=255)
gCCACTCGCTCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTTGAAGCGCGCCtt < 2:16184404/149‑1 (MQ=255)
ccACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCtttt < 1:16184395/150‑1 (MQ=255)
cACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTc < 1:16183681/150‑1 (MQ=255)
aCTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCa < 2:16183832/150‑1 (MQ=255)
cTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCaa > 1:16185037/1‑150 (MQ=255)
tCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTgg < 1:16182140/133‑1 (MQ=255)
tCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCaa < 1:16182915/149‑1 (MQ=255)
gCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAAttt < 1:16182726/150‑1 (MQ=255)
gCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAAttt > 2:16185044/1‑150 (MQ=255)
ccTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTg < 2:16181326/149‑1 (MQ=255)
tGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGGTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCact > 1:16185075/1‑142 (MQ=255)
tATCCAGCAGTTTTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAg < 2:16183237/148‑1 (MQ=255)
tATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAg < 2:16181942/148‑1 (MQ=255)
tATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAg < 2:16183475/148‑1 (MQ=255)
ccAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTc > 2:16185100/1‑136 (MQ=255)
cagcagTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAg < 2:16182312/149‑1 (MQ=255)
gcagTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCAt > 1:16185117/1‑150 (MQ=255)
agTTGTGATGTCCCATGTTTCCTGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCt < 2:16182732/81‑1 (MQ=255)
gTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTc > 2:16185137/1‑149 (MQ=255)
tgtgATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTca > 1:16185156/1‑148 (MQ=255)
aTGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGtt > 2:16185173/1‑150 (MQ=255)
ccATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt > 1:16185205/1‑150 (MQ=255)
ccATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt < 2:16184201/150‑1 (MQ=255)
ccATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAtt > 2:16185211/1‑150 (MQ=255)
ccATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAt < 2:16183718/149‑1 (MQ=255)
cATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCCATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAAttt < 1:16184034/150‑1 (MQ=255)
gTTTAATGGCGTTTTCCAGTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGCCCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCttt < 2:16183953/113‑1 (MQ=255)
gTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTtcgt > 1:16185250/1‑150 (MQ=255)
gTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTtcgt > 2:16185246/1‑150 (MQ=255)
tttAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCAt < 2:16181699/131‑1 (MQ=255)
tttAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTtcgtc < 1:16182792/150‑1 (MQ=255)
tAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTtcgtcg < 2:16184633/149‑1 (MQ=255)
aaTGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGc > 1:16185282/1‑150 (MQ=255)
aaTGGCGTTTTCCACTAGCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCgg < 2:16182802/149‑1 (MQ=255)
tGGCGTTTTCCACTATGGGATGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTtcgtc > 2:16185294/1‑145 (MQ=255)
tGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATaa < 2:16183406/122‑1 (MQ=255)
gTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGt < 1:16183814/150‑1 (MQ=255)
tttCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTaa > 1:16185331/1‑150 (MQ=255)
tttCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTa < 1:16183283/149‑1 (MQ=255)
ttCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTaa < 1:16183583/149‑1 (MQ=255)
ttCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTaa > 2:16185340/1‑149 (MQ=255)
tCCACTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAAc < 1:16182975/149‑1 (MQ=255)
aCTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAAc > 1:16185370/1‑150 (MQ=255)
cTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTcaca < 2:16183553/119‑1 (MQ=255)
cTATCGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTCCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACt > 2:16185381/1‑150 (MQ=255)
cGGTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACTCCg > 1:16185408/1‑149 (MQ=255)
ggTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACTCCGa < 1:16183367/149‑1 (MQ=255)
gTTGCAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACTCCGAAg > 2:16185423/1‑150 (MQ=255)
cAGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCgg < 2:16183338/125‑1 (MQ=255)
aGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACTCCGAAGGcc < 1:16184152/148‑1 (MQ=255)
aGGGTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACTCCGAAGGCCg > 1:16185446/1‑149 (MQ=255)
gTAAGCGCGTGCAATTGCTGCTGGGATCATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACTCCGAAg < 2:16182664/142‑1 (MQ=255)
gTAAGCGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACTCCGAAGGCCGCttt < 1:16183524/150‑1 (MQ=255)
|
TTACCGGTTGATACAAACCGGCATTGTCTTCGATCTCCAGCATCAAATGTTGCCCCTCACGTCGGGCGCTGATTGCCACTCGCCCTGTATCCAGCAGTTGTGATGTCCCATGTTTAATGGCGTTTTCCACTATCGGTTGCAGGGTAAACGCGGGCAATTGCTGCTGGGATAATTCTTGCGGAATAGCAATGTTGACCTGCAACCGCGACTGGAAGCGCGCCTTTTCAATTTGCAGATAAGCATTCACATGTTCAATTTCGTCGGCGAGAGTAACAAACTCCGAAGGCCGCTTTA > NC_000913/2213102‑2213395
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
