Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F13 I1 R1
|
18 |
2625.4 |
86379875 |
99.4% |
85861595 |
141.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,753,814 |
G→A |
T70T (ACG→ACA) |
bamE → |
outer membrane protein assembly factor BamE |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,753,814 | 0 | G | A | 98.7%
| 11320.3
/ 51.0
| 2490 | T70T (ACG→ACA) | bamE | outer membrane protein assembly factor BamE |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (15/17); new base A (1149/1308); total (1164/1326) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2510 total aligned reads displayed.
CACTCTGGAGCGAGTGGTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTC > NC_000913/2753667‑2753960
|
tctGGAGCGAGTGGTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATa < 2:24355346/149‑1 (MQ=255)
tctGGAGCGAGTGGTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATa > 2:24358411/1‑149 (MQ=255)
gAGCGAGTGGTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATAcc < 2:24356251/147‑1 (MQ=255)
gAGCGAGTGGGTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCt < 2:24356415/148‑1 (MQ=255)
aGCGAGTGGTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGt > 1:24358443/1‑150 (MQ=255)
cGAGTGGTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGtt < 1:24353303/149‑1 (MQ=255)
gAGTGGTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTTGtt > 2:24358476/1‑148 (MQ=255)
tGGTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTAt < 2:24356018/149‑1 (MQ=255)
ggTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGt > 1:24358496/1‑150 (MQ=255)
gTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGt < 1:24355508/149‑1 (MQ=255)
tttACCGTCCTCACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAAt < 1:24355032/134‑1 (MQ=255)
aCCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTc < 2:24354966/149‑1 (MQ=255)
ccGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTcc < 1:24356489/149‑1 (MQ=255)
ccGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCg > 2:24358534/1‑150 (MQ=255)
ccGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCg < 1:24357338/150‑1 (MQ=255)
cGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGc > 1:24358548/1‑150 (MQ=255)
tCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCa < 1:24355852/150‑1 (MQ=255)
cTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAg > 2:24358584/1‑149 (MQ=255)
cATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAAc > 1:24358611/1‑149 (MQ=255)
tCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAg < 2:24357154/150‑1 (MQ=255)
aaCCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATGTGGTACAAATACCTGGt > 2:24358638/1‑124 (MQ=255)
cAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCAt > 1:24358663/1‑150 (MQ=255)
ggAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAg < 1:24356068/150‑1 (MQ=255)
aaCTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGgt > 2:24358704/1‑150 (MQ=255)
aaCTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGgt > 1:24358705/1‑150 (MQ=255)
tCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAAc > 1:24358757/1‑150 (MQ=255)
aCCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACt < 1:24356238/147‑1 (MQ=255)
cGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGc > 1:24358810/1‑149 (MQ=255)
cGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGc > 2:24358804/1‑149 (MQ=255)
aaCGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAccg > 2:24358857/1‑150 (MQ=255)
aaCGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAac > 1:24358862/1‑149 (MQ=255)
cgacgTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAacgct < 1:24357524/150‑1 (MQ=255)
acgTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAacgctga > 1:24358911/1‑150 (MQ=255)
acgTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAacgctga < 2:24356783/150‑1 (MQ=255)
cgTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAacgctgac > 2:24358915/1‑150 (MQ=255)
tATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAacgctgacgc > 1:24358958/1‑150 (MQ=255)
aTCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTAGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAacgctgacgct > 2:24358968/1‑150 (MQ=255)
aaTACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCtt > 1:24359011/1‑150 (MQ=255)
aTACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCttt < 2:24357063/150‑1 (MQ=255)
aTACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCtt > 2:24359022/1‑149 (MQ=255)
tACGGGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCtt < 2:24356163/148‑1 (MQ=255)
cGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTaa < 1:24356340/149‑1 (MQ=255)
gtgtTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAgga > 2:24359058/1‑115 (MQ=255)
gtgtTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACa < 2:24355927/150‑1 (MQ=255)
tgtTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAg < 2:24356331/150‑1 (MQ=255)
gtTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGCCAGGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAg > 1:24359071/1‑149 (MQ=255)
tGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAacgc < 2:24356515/128‑1 (MQ=255)
gCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCAATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGc < 2:24355813/149‑1 (MQ=255)
aTGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGgt > 1:24359117/1‑150 (MQ=255)
aTGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTCACCTTTAACAGTAGCGgt > 2:24359116/1‑150 (MQ=255)
tGACGCAACAACAAATTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGgt < 2:24357284/149‑1 (MQ=255)
cGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACgctgacgctgac < 2:24355668/130‑1 (MQ=255)
gCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGtt < 2:24358754/150‑1 (MQ=255)
caacaacaaGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGtt > 1:24359164/1‑149 (MQ=255)
caacaacaaGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTg < 1:24356785/150‑1 (MQ=255)
acaacaaGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGAc > 2:24359178/1‑150 (MQ=255)
acaaGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCaa > 1:24359207/1‑150 (MQ=255)
aaGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAata < 1:24356967/150‑1 (MQ=255)
aaGTTGCATACGTATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAat < 2:24357911/149‑1 (MQ=255)
gTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGgtgt > 2:24359237/1‑137 (MQ=255)
gTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATAtt < 1:24357067/150‑1 (MQ=255)
tGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGa > 1:24359249/1‑150 (MQ=255)
gCGTACGCAATGGATACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTg < 1:24355281/148‑1 (MQ=255)
cGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGAt < 1:24355695/149‑1 (MQ=255)
gTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATaa < 1:24356888/150‑1 (MQ=255)
tACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATaa > 1:24359292/1‑149 (MQ=255)
tACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAAc < 1:24356575/150‑1 (MQ=255)
tACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGATCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATaa > 2:24359291/1‑149 (MQ=255)
cATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAAc < 1:24357240/150‑1 (MQ=255)
aTTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAAcc > 2:24359332/1‑150 (MQ=255)
aTTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAAcc < 1:24356702/150‑1 (MQ=255)
ttGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCt < 1:24356639/150‑1 (MQ=255)
tGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTg > 1:24359354/1‑150 (MQ=255)
gggTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTg < 1:24355955/149‑1 (MQ=255)
ggTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGAt < 2:24355534/138‑1 (MQ=255)
tACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCt < 1:24357790/150‑1 (MQ=255)
acacCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCt > 2:24359382/1‑149 (MQ=255)
acCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCt < 2:24357686/142‑1 (MQ=255)
acCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGa > 1:24359401/1‑149 (MQ=255)
ccGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGt < 1:24356422/150‑1 (MQ=255)
cGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTg < 2:24356617/150‑1 (MQ=255)
cTGATGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCt > 2:24359428/1‑143 (MQ=255)
aTGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTa < 2:24357435/148‑1 (MQ=255)
aTGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAAc > 1:24359459/1‑150 (MQ=255)
tGTCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGACGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAAc > 2:24359468/1‑149 (MQ=255)
tCCGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACta < 1:24357917/149‑1 (MQ=255)
cGATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACtaa > 2:24359511/1‑148 (MQ=255)
gATCCATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGa > 1:24359528/1‑136 (MQ=255)
ccATTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACtaataata < 2:24356986/149‑1 (MQ=255)
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aTTTGGTACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAg < 2:24356696/150‑1 (MQ=255)
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tACAAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGctc > 1:24359617/1‑150 (MQ=255)
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CACTCTGGAGCGAGTGGTTTACCGTCCTGACATCAACCAGGGGAACTATCTGACCGCTAACGACGTATCCAAAATACGTGTTGGCATGACGCAACAACAAGTTGCGTACGCATTGGGTACACCGCTGATGTCCGATCCATTTGGTACGAATACCTGGTTCTATGTCTTCCGCCAGCAACCAGGTCATGAAGGTGTAACTCAGCAAACGCTGACGCTGACCTTTAACAGTAGCGGTGTGTTGACCAATATTGATAACAAACCTGCGCTGAGTGGTAACTAATAATAAAGTTGCTC > NC_000913/2753667‑2753960
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| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
