Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A1 F13 I1 R1
|
18 |
2625.4 |
86379875 |
99.4% |
85861595 |
141.3 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,762,142 |
G→A |
P467S (CCA→TCA) |
abpB ← |
CP4‑57 prophage; putative helicase YfjK |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,762,142 | 0 | G | A | 98.8%
| 11102.5
/ 44.3
| 2490 | P467S (CCA→TCA) | abpB | CP4‑57 prophage; putative helicase YfjK |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (17/12); new base A (1211/1248); total (1230/1260) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.54e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2523 total aligned reads displayed.
TGCAGCATTTCGAACTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGGGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTGATGTTCCCATGGGTGAATTTGTC > NC_000913/2761994‑2762289
|
cagcaTTTCGAACTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGt < 1:24434446/150‑1 (MQ=255)
agcaTTTCGAACTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTa < 2:24435245/150‑1 (MQ=255)
gcaTTTCGAACTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTAt < 1:24434193/150‑1 (MQ=255)
aTTTCGAACTGCTCGACACNGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATc > 2:24436855/1‑149 (MQ=255)
aTTTCGAACTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATc > 1:24436855/1‑149 (MQ=255)
aTTTCGAACTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTCAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATc < 2:24434031/149‑1 (MQ=255)
tCGAACTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAACCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAAt < 1:24434075/149‑1 (MQ=255)
gAACTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGcc > 2:24436905/1‑150 (MQ=255)
aaCTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACGAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGccc > 1:24436918/1‑150 (MQ=255)
aCTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCt < 2:24433395/150‑1 (MQ=255)
cTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAAt < 1:24430382/150‑1 (MQ=255)
atCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAAt < 1:24433708/149‑1 (MQ=255)
tCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGACTa > 2:24436963/1‑150 (MQ=255)
cGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGCTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATAc > 1:24436969/1‑150 (MQ=255)
acGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGa > 1:24437010/1‑149 (MQ=255)
acGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAg < 1:24435158/150‑1 (MQ=255)
cGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATTGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGc < 1:24435254/150‑1 (MQ=255)
ggAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGc < 2:24434770/149‑1 (MQ=255)
gAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCgg < 1:24435955/150‑1 (MQ=255)
aaGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGa < 1:24434745/150‑1 (MQ=255)
aaGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATGGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCgg > 2:24437043/1‑149 (MQ=255)
aGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGaa > 1:24437058/1‑150 (MQ=255)
cGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCaa < 2:24433694/125‑1 (MQ=255)
cGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGa > 2:24437090/1‑140 (MQ=255)
aaTGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCa > 1:24437113/1‑150 (MQ=255)
aTGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCAc < 1:24434334/150‑1 (MQ=255)
cttcttCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGAGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGACTATCCAGctc > 2:24437145/1‑150 (MQ=255)
ttcttcACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACctct > 1:24437155/1‑150 (MQ=255)
cttcACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACctct < 1:24435329/148‑1 (MQ=255)
cttcACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCtt < 1:24434561/149‑1 (MQ=255)
ttcACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATAAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAatat < 2:24435604/139‑1 (MQ=255)
acaAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCttgattg < 1:24434803/150‑1 (MQ=255)
acaAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCttgattg < 2:24434136/150‑1 (MQ=255)
acaAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCttgatt > 1:24437203/1‑149 (MQ=255)
acaAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCttgatt > 2:24437204/1‑149 (MQ=255)
caAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCAcc < 2:24434412/140‑1 (MQ=255)
ggTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACTGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGAt < 2:24435136/150‑1 (MQ=255)
gTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGAtt > 1:24437253/1‑150 (MQ=255)
tCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGAtt > 2:24437262/1‑149 (MQ=255)
aTGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCt > 1:24437292/1‑150 (MQ=255)
gAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTgag > 2:24437319/1‑140 (MQ=255)
gAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTc < 1:24435083/149‑1 (MQ=255)
aaCACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCgg > 1:24437346/1‑150 (MQ=255)
cacGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGa > 2:24437362/1‑104 (MQ=255)
cacGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGa < 1:24434648/150‑1 (MQ=255)
ggTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGAttt > 1:24437391/1‑150 (MQ=255)
cGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTtcct > 1:24437432/1‑150 (MQ=255)
gTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTtcctc > 2:24437434/1‑150 (MQ=255)
gTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTtcct < 2:24434871/149‑1 (MQ=255)
ttATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCt < 2:24434638/134‑1 (MQ=255)
tATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCa < 1:24433316/149‑1 (MQ=255)
aTGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAgg > 1:24437480/1‑150 (MQ=255)
aTGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAg < 2:24435335/149‑1 (MQ=255)
tGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAgg > 2:24437488/1‑149 (MQ=255)
aaaaCCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGc < 2:24433834/148‑1 (MQ=255)
aaaaCCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCaa < 1:24433937/150‑1 (MQ=255)
aaaaCCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCaa < 1:24434869/150‑1 (MQ=255)
aaaCCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCa > 1:24437525/1‑148 (MQ=255)
aaCCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTNTGGTTGAACGGTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCaaaa < 1:24435019/150‑1 (MQ=255)
ccTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCaa > 2:24437545/1‑146 (MQ=255)
tcatcaAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGAtt > 1:24437573/1‑150 (MQ=255)
atcaAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGAtt > 2:24437592/1‑130 (MQ=255)
aaGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGcc > 1:24437630/1‑149 (MQ=255)
aaGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCcg < 2:24435873/150‑1 (MQ=255)
aaGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTGGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGAt < 2:24434297/112‑1 (MQ=255)
aGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCACTGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCCGGCaac > 2:24437637/1‑137 (MQ=255)
gATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGGGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCcgacg < 2:24434527/149‑1 (MQ=255)
aTCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCcgacg > 2:24437686/1‑148 (MQ=255)
aTCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTACCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCcgacg > 1:24437685/1‑148 (MQ=255)
cTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGt < 1:24435615/149‑1 (MQ=255)
tgtgAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCcgacg < 2:24435732/144‑1 (MQ=255)
tgAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAAc > 2:24437737/1‑150 (MQ=255)
tgAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAAc < 1:24434949/150‑1 (MQ=255)
tgAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAAc > 1:24437736/1‑150 (MQ=255)
aaCTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAAc > 2:24437773/1‑146 (MQ=255)
cTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCAt > 1:24437797/1‑150 (MQ=255)
cGGAGAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAgg < 2:24435420/116‑1 (MQ=255)
ggACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATgcg < 1:24435843/150‑1 (MQ=255)
ggACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATg < 1:24435748/148‑1 (MQ=255)
gACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCAc > 2:24437825/1‑77 (MQ=255)
cAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGCTTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGccc < 1:24435509/150‑1 (MQ=255)
aaGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCg > 1:24437850/1‑150 (MQ=255)
gTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAg < 2:24434939/108‑1 (MQ=255)
gTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCgg > 2:24437866/1‑149 (MQ=255)
gTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGgcgc < 1:24435419/149‑1 (MQ=255)
cTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGAc > 1:24437904/1‑150 (MQ=255)
gTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCtt < 2:24436172/150‑1 (MQ=255)
gTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCtt > 2:24437918/1‑150 (MQ=255)
gAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTg < 1:24436122/149‑1 (MQ=255)
aaCGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTgc > 1:24437955/1‑148 (MQ=255)
aCGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTGATg < 2:24435518/150‑1 (MQ=255)
cGCTGGCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCACGCAAAAGATTTTGcc > 2:24437967/1‑109 (MQ=255)
gCTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTGATGTTCCCa > 2:24438009/1‑150 (MQ=255)
cTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTGATGTTCCCAt > 1:24438017/1‑150 (MQ=255)
cTAACAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGCAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCttt < 2:24436513/139‑1 (MQ=255)
cAGGTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTGATGTTCCCATGGGt > 2:24438053/1‑150 (MQ=255)
gTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTc < 2:24432966/66‑1 (MQ=255)
gTTGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTGATGTTCCCATGGGTGaa < 1:24436444/150‑1 (MQ=255)
tGATTGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTGATGTTCCCATGGGTGAAtt > 1:24438081/1‑150 (MQ=255)
ttGAGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTGATGTTCCCATGGGTGAATTTGt < 2:24435050/150‑1 (MQ=255)
|
TGCAGCATTTCGAACTGCTCGACACGGAAGTACGAATGCTTCTTCACAAGGTCGATGGAAACACGGTCGTTTATGAAAACCTCATCAAAGCGATCCTGTGAAAACTCGGACAAGTGGTCTGGTTGAACGCTGGCTAACAGGTTGATTGGGGTATCAATGCCCTGAATACCGAGCGGAATATCCACCTCTTGATTGAGATTGTCTTCCGGGATTTCCTCCAGGCAAAAGATTTTGCCGACGAAGTGAACGCCCATGCGCCCGGCGCGACCTTTGATGTTCCCATGGGTGAATTTGTC > NC_000913/2761994‑2762289
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
