Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A4 F13 I1 R1
|
15 |
2083.3 |
68373553 |
99.6% |
68100058 |
141.6 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
3,638,367 |
T→C |
I242I (ATT→ATC) |
pitA → |
metal phosphate:H(+) symporter PitA |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 3,638,367 | 0 | T | C | 99.6%
| 8491.0
/ 6.8
| 1998 | I242I (ATT→ATC) | pitA | metal phosphate:H(+) symporter PitA |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/8); new base C (1019/968); total (1022/976) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.88e-02 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 2075 total aligned reads displayed.
CCCAGCGGAGCGTGAAAAGAAAGACGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATTGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTACCGGTGCTGATCAGTTAG > NC_000913/3638220‑3638512
|
gAGCGTGAAAAGAAAGACGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTcgcg < 1:26681579/150‑1 (MQ=255)
gAGCGTGAAAAGAAAGACGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTcgcg > 2:26683751/1‑150 (MQ=255)
aaagaaagACGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCcagcag < 2:26681778/149‑1 (MQ=255)
aaagaaagACGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCcagcag < 2:26682280/149‑1 (MQ=255)
aaagaaagACGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAgg < 1:26681455/150‑1 (MQ=255)
aagaaagaCGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCcagcag > 2:26683811/1‑148 (MQ=255)
aagaaagaCGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGc > 1:26683807/1‑150 (MQ=255)
agaCGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCgt > 1:26683850/1‑150 (MQ=255)
agaCGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCCGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCgt > 2:26683853/1‑150 (MQ=255)
ggCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCgtggtg < 1:26682346/150‑1 (MQ=255)
aaGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGaa > 2:26683899/1‑149 (MQ=255)
aaGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGaa > 1:26683899/1‑149 (MQ=255)
aaaaGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATg > 2:26683935/1‑149 (MQ=255)
aaGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAAt > 1:26683956/1‑150 (MQ=255)
cgccgTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCa > 1:26683987/1‑150 (MQ=255)
gccgTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGCTGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAgg > 2:26683998/1‑126 (MQ=255)
gTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTgg > 1:26684021/1‑150 (MQ=255)
gTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTgg < 1:26682023/150‑1 (MQ=255)
cTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCt < 1:26682609/149‑1 (MQ=255)
cTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCt < 1:26682183/149‑1 (MQ=255)
cTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTa > 2:26684046/1‑150 (MQ=255)
tGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGc < 2:26681179/140‑1 (MQ=255)
tGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTAc > 1:26684064/1‑150 (MQ=255)
aCGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGaa < 1:26682859/150‑1 (MQ=255)
aCGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGa > 1:26684096/1‑149 (MQ=255)
cgcgTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCGTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGaaa > 2:26684101/1‑150 (MQ=255)
gcgTATTGCGCTGCTCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTgg < 2:26682170/141‑1 (MQ=255)
cgTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATc < 1:26681822/150‑1 (MQ=255)
ttATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCcagcag < 2:26682551/110‑1 (MQ=255)
gTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGNAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCa > 1:26684140/1‑150 (MQ=255)
gTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCa > 2:26684140/1‑150 (MQ=255)
ttGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCaccc < 1:26681919/150‑1 (MQ=255)
ttGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCacc < 2:26682616/149‑1 (MQ=255)
cgcTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCTTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGaa < 2:26681888/118‑1 (MQ=255)
cgcTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCacccgta > 1:26684173/1‑150 (MQ=255)
tGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCacccgtaccc > 2:26684203/1‑150 (MQ=255)
tGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCacccgtaccc > 1:26684205/1‑150 (MQ=255)
aTCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCacccgtacccgt > 1:26684241/1‑150 (MQ=255)
aTCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCacccgtaccc < 1:26682412/148‑1 (MQ=255)
tCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCa > 2:26684252/1‑138 (MQ=255)
cTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGa < 1:26682537/149‑1 (MQ=255)
ttCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGc > 1:26684282/1‑150 (MQ=255)
cGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGATATCACCCGTACCCGTGAtc > 2:26684294/1‑145 (MQ=255)
agcGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCAt < 1:26681169/144‑1 (MQ=255)
aTCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCacccgtac < 2:26681596/134‑1 (MQ=255)
tCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATcaaca < 2:26683225/150‑1 (MQ=255)
tCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATcaac < 2:26682433/149‑1 (MQ=255)
tCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATcaac > 1:26684330/1‑149 (MQ=255)
tCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATcaac > 2:26684328/1‑149 (MQ=255)
ggcgtggcgtTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCaacaac < 2:26683028/150‑1 (MQ=255)
cgtggcgtTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCGGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGt > 1:26684361/1‑150 (MQ=255)
tggcgtTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCg < 2:26682019/150‑1 (MQ=255)
gcgtTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCaacaac > 2:26684383/1‑144 (MQ=255)
cgtTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGAt < 2:26682802/131‑1 (MQ=255)
cgtTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAg < 1:26682108/150‑1 (MQ=255)
gtTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGc > 1:26684397/1‑150 (MQ=255)
ttCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCtt < 1:26682723/149‑1 (MQ=255)
tCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTa < 2:26683537/149‑1 (MQ=255)
gCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACtt > 2:26684429/1‑150 (MQ=255)
gCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACtt < 2:26682361/150‑1 (MQ=255)
gCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACt < 2:26682697/149‑1 (MQ=255)
cACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACttt > 1:26684439/1‑150 (MQ=255)
cGGCGCGACCGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACt < 2:26680614/94‑1 (MQ=255)
gcgAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGagcag > 1:26684470/1‑150 (MQ=255)
cgAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGagcagc < 1:26683702/150‑1 (MQ=255)
gAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAgcagca < 1:26682661/150‑1 (MQ=255)
gAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAgcagca > 2:26684484/1‑150 (MQ=255)
aaCGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCAt > 1:26684511/1‑150 (MQ=255)
aCGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTg > 2:26684521/1‑141 (MQ=255)
cGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATcc < 2:26682967/150‑1 (MQ=255)
gATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAgcagca < 1:26682262/146‑1 (MQ=255)
aTGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTg < 1:26683242/150‑1 (MQ=255)
tGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTgc > 1:26684547/1‑150 (MQ=255)
gTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCTACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTgc < 1:26683768/148‑1 (MQ=255)
tCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGt < 2:26682876/120‑1 (MQ=255)
cAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTCACTTTGAGCAGCATCCTGCgctg > 2:26684570/1‑150 (MQ=255)
aGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCgctgc > 1:26684585/1‑150 (MQ=255)
aaGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTc > 2:26684613/1‑149 (MQ=255)
aGGCATTGGTGTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGTCATCAANAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCgctg > 1:26684629/1‑145 (MQ=255)
cATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACa < 1:26683000/150‑1 (MQ=255)
cATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTCCgctgct > 2:26684662/1‑144 (MQ=255)
aTTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAg > 1:26684666/1‑150 (MQ=255)
ttGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAgg < 1:26683118/150‑1 (MQ=255)
gTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCt < 2:26682096/149‑1 (MQ=255)
gTCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCt < 2:26681423/149‑1 (MQ=255)
tCTGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTAc > 1:26684700/1‑150 (MQ=255)
tGGTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGCACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACACGTGATGCCATCAACAACGTCgca > 2:26684714/1‑105 (MQ=255)
gTTATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTAcc < 1:26683405/147‑1 (MQ=255)
ttATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGaa < 1:26682475/104‑1 (MQ=255)
ttATGTTGGTATGGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATg > 2:26684745/1‑50 (MQ=255)
tATGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTACCGGTGc > 1:26684747/1‑150 (MQ=255)
tGTTGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATcc < 1:26681694/121‑1 (MQ=255)
tGGTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGa < 2:26683125/109‑1 (MQ=255)
ggTATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTACCGGTGCTGATc < 1:26682932/149‑1 (MQ=255)
tATTGATCGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTACCGGTGCTGATCAGt > 1:26684784/1‑150 (MQ=255)
attgatcgGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTACCGGTGCTGATCAGt > 2:26684801/1‑149 (MQ=255)
ttgatcgGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTAc < 2:26682494/54‑1 (MQ=255)
ttgatcgGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTACCGGTGCTGATCAGTTa < 1:26682785/150‑1 (MQ=255)
tgatcgGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTACCGGTGCTGATCAGTTAg > 1:26684817/1‑150 (MQ=255)
tgatcgGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTACCGGTGCTGATCAGTTAg > 1:17369468/1‑150 (MQ=255)
|
CCCAGCGGAGCGTGAAAAGAAAGACGGCAAGAAAAAGCCGCCGTTCTGGACGCGTATTGCGCTGATCCTTTCCGCTATCGGCGTGGCGTTTTCGCACGGCGCGAACGATGGTCAGAAAGGCATTGGTCTGGTTATGTTGGTATTGATTGGCGTCGCGCCAGCAGGCTTCGTGGTGAACATGAATGCCACTGGCTACGAAATCACCCGTACCCGTGATGCCATCAACAACGTCGAAGCTTACTTTGAGCAGCATCCTGCGCTGCTCAAACAGGCTACCGGTGCTGATCAGTTAG > NC_000913/3638220‑3638512
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
