Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A5 F13 I1 R1
|
17 |
935.6 |
30504812 |
99.2% |
30260773 |
142.2 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,861,780 |
A→G |
G117G (GGA→GGG) |
ygbJ → |
putative L‑threonate dehydrogenase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,861,780 | 0 | A | G | 99.8%
| 3815.7
/ NA
| 922 | G117G (GGA→GGG) | ygbJ | putative L‑threonate dehydrogenase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base G (469/451); total (471/451) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 922 total aligned reads displayed.
GTGCTGGTGGTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGATTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGTTGCCGGAAAAGTTTATCG > NC_000913/2861634‑2861926
|
gtgctggtgGTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGtt < 2:8850540/149‑1 (MQ=255)
gtgctggtgGTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGtt < 2:8850610/149‑1 (MQ=255)
tgctggtgGTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGtt < 1:8850199/148‑1 (MQ=255)
tgctggtgGTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCg < 2:8850326/150‑1 (MQ=255)
tggtggTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATc > 2:8851105/1‑150 (MQ=255)
gtggtCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATc < 2:8850803/148‑1 (MQ=255)
gtggtCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTg > 1:8851113/1‑150 (MQ=255)
cAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCCGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAAt > 2:8851127/1‑150 (MQ=255)
aaTGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAAt < 1:8850113/149‑1 (MQ=255)
aaTGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAAt < 1:8850677/149‑1 (MQ=255)
aaTGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATg > 1:8851130/1‑150 (MQ=255)
gCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGAt > 2:8851143/1‑150 (MQ=255)
cccAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATg < 2:8849715/150‑1 (MQ=255)
cccAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGCAt < 1:8849876/149‑1 (MQ=255)
cAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATgcg > 1:8851156/1‑150 (MQ=255)
cAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATgcg < 2:8850457/150‑1 (MQ=255)
cAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACAGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAANTGCTGGATgcg < 1:8850353/150‑1 (MQ=255)
aGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATgcgc > 2:8851159/1‑150 (MQ=255)
ggTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGcc < 2:8850158/150‑1 (MQ=255)
ttAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCt > 2:8851176/1‑139 (MQ=255)
aaaCAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGCTGCGCCAGtt > 1:8851180/1‑150 (MQ=255)
aaCAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGtt < 1:8850262/149‑1 (MQ=255)
cAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTc > 2:8851192/1‑149 (MQ=255)
ggTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCtgg < 1:8850557/150‑1 (MQ=255)
gTGCCGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCtggt > 1:8851203/1‑150 (MQ=255)
cTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTggtggt < 1:8849718/150‑1 (MQ=255)
tGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGgtggtg > 2:8851210/1‑150 (MQ=255)
tttGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCtggt > 1:8851219/1‑144 (MQ=255)
gTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTa < 2:8850244/149‑1 (MQ=255)
gTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTa < 2:8850293/149‑1 (MQ=255)
aaaCAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAg < 1:8850491/150‑1 (MQ=255)
aaaCAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACAATCGCTAGTGCAGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGTTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTaa > 2:8851233/1‑147 (MQ=255)
aaCAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGc < 1:8850316/150‑1 (MQ=255)
aCAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGcc > 1:8851235/1‑150 (MQ=255)
aCAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGcc < 1:8850021/150‑1 (MQ=255)
cAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTaaa < 2:8850403/145‑1 (MQ=255)
aGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGc > 1:8851248/1‑150 (MQ=255)
gCGTTGCACAACATCGGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTa < 1:8849935/150‑1 (MQ=255)
cGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTa > 2:8851262/1‑149 (MQ=255)
gTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAAc > 1:8851265/1‑150 (MQ=255)
ttGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACg > 2:8851280/1‑150 (MQ=255)
tGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGcc < 2:8849950/142‑1 (MQ=255)
tGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACgg > 1:8851283/1‑150 (MQ=255)
acaacaTCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATGGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGa < 2:8850654/150‑1 (MQ=255)
aacaTCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGaaa > 1:8851296/1‑150 (MQ=255)
caTCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAAt > 2:8851300/1‑149 (MQ=255)
tGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGc > 2:8851313/1‑96 (MQ=255)
aaaCCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACt < 1:8850425/147‑1 (MQ=255)
aaaCCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGt < 1:8850961/149‑1 (MQ=255)
aaCCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCa > 1:8851322/1‑150 (MQ=255)
aaCCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCa < 1:8850793/150‑1 (MQ=255)
aCCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGcc > 2:8851327/1‑127 (MQ=255)
ccGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATgg < 1:8850220/150‑1 (MQ=255)
cGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGc < 2:8850706/150‑1 (MQ=255)
cGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGAc > 2:8851349/1‑136 (MQ=255)
cGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCg > 1:8851348/1‑150 (MQ=255)
ggCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCg < 1:8850400/149‑1 (MQ=255)
gCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGcc > 2:8851365/1‑144 (MQ=255)
aGTAATGGTTTCTTCCACTNTCGCTAGTGCCGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAg > 1:8851368/1‑150 (MQ=255)
aGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCgg < 2:8850506/147‑1 (MQ=255)
gTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCt < 1:8850729/142‑1 (MQ=255)
gTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGc < 1:8850588/150‑1 (MQ=255)
tAATGGTTTCTTCCCCTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGc < 2:8850042/149‑1 (MQ=255)
aaTGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGc > 1:8851382/1‑148 (MQ=255)
aaTGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACAGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCt > 2:8851384/1‑94 (MQ=255)
ggTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGatat > 1:3763980/1‑150 (MQ=255)
tttCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTg > 1:8851399/1‑150 (MQ=255)
tcttcCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGcc > 2:8851402/1‑150 (MQ=255)
cTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGNTGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGa > 1:8851419/1‑148 (MQ=255)
tATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATTTg > 2:8851423/1‑55 (MQ=255)
tATCGCTACTGCTCATGCGCAAGAAATTGCTTCCGCTCTGGCTGGGTTCGGTCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCtggt < 2:8850758/82‑1 (MQ=255)
cGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACt > 1:8851435/1‑150 (MQ=255)
gCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACt < 2:8850477/149‑1 (MQ=255)
gCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCAGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGTCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTg > 2:8851442/1‑150 (MQ=255)
cTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTgg > 1:8851449/1‑150 (MQ=255)
aGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCa > 2:8851464/1‑150 (MQ=255)
aGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCGTTGAACGACTGGc > 1:8851469/1‑149 (MQ=255)
gTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCAc < 2:8850995/150‑1 (MQ=255)
tGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGaa < 2:8850904/139‑1 (MQ=255)
ttaTGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGt > 1:8851485/3‑150 (MQ=255)
tGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGt > 2:8851479/1‑150 (MQ=255)
aTGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTNGAACGACTGGCACCCGTGc < 1:8850884/150‑1 (MQ=255)
tGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGt < 1:8850161/147‑1 (MQ=255)
cgcAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTTGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGat < 2:8849826/119‑1 (MQ=255)
cgcAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGt < 2:8850370/113‑1 (MQ=255)
cgcAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTg < 2:8850840/149‑1 (MQ=255)
cgcAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTg > 1:8851502/1‑149 (MQ=255)
gcAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATTCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAAc < 2:8850678/85‑1 (MQ=255)
gcAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGACGCTAACGGTGAAATGAATGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTgg > 2:8851505/1‑149 (MQ=255)
cAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGaa < 1:8850534/150‑1 (MQ=255)
aaaTTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGt > 2:8851520/1‑107 (MQ=255)
aTTGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGtt < 2:8850578/150‑1 (MQ=255)
ttGCTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGTTg > 1:8851524/1‑150 (MQ=255)
cTACCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGTTGCCg > 2:8851534/1‑150 (MQ=255)
aCCGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGTTGCCgg > 1:8851541/1‑149 (MQ=255)
ccGCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGTTGCCgg < 1:8851070/148‑1 (MQ=255)
gCTCTGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGTTGCCGGaa > 2:8851550/1‑148 (MQ=255)
tctGGCTGGGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTg > 2:8851564/1‑118 (MQ=255)
ggctggGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGTTGCCGGAAAAGTTTa > 1:8851570/1‑150 (MQ=255)
gctggGTTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGTTGCCGGAAAAGTTTAt < 1:8850614/150‑1 (MQ=255)
|
GTGCTGGTGGTCAATGCGGCCCAGGTTAAACAGGTGCTGTTTGGTGAAACAGGCGTTGCACAACATCTGAAACCCGGTACGGCAGTAATGGTTTCTTCCACTATCGCTAGTGCTGATGCGCAAGAAATTGCTACCGCTCTGGCTGGATTCGATCTGGAAATGCTGGATGCGCCAGTTTCTGGTGGTGCAGTAAAAGCCGCTAACGGTGAAATGACTGTCATGGCCTCCGGTAGCGATATTGCCTTTGAACGACTGGCACCCGTGCTGGAAGCCGTTGCCGGAAAAGTTTATCG > NC_000913/2861634‑2861926
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
