Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F13 I1 R1
|
20 |
580.9 |
19806870 |
98.8% |
19569187 |
140.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,054,799 |
A→G |
Q386R (CAG→CGG) |
shiA → |
shikimate:H(+) symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,054,799 | 0 | A | G | 98.5%
| 1950.5
/ 10.9
| 479 | Q386R (CAG→CGG) | shiA | shikimate:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/3); new base G (224/248); total (228/251) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.13e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.37e-01 |
Only 100 of 482 total aligned reads displayed.
TGAAGCACAATCTATTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCAGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGAC > NC_000913/2054653‑2054944
|
tGAAGCACAATCTATTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCAGGt > 2:4278270/1‑150 (MQ=255)
gAAGCACAATCTATTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGtt > 1:4278275/1‑150 (MQ=255)
aGCACAATCTATTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGtt < 2:4277935/148‑1 (MQ=255)
cacaATCTATTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCa < 1:4277858/150‑1 (MQ=255)
cacaATCTATTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCa < 2:4277859/150‑1 (MQ=255)
caATCTATTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAgt < 1:4277640/150‑1 (MQ=255)
caATCTATTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAgt < 1:4277787/150‑1 (MQ=255)
aTTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGtt > 1:4278284/1‑150 (MQ=255)
ttttCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTgg < 2:4277946/147‑1 (MQ=255)
ttttCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGtt < 2:4277823/149‑1 (MQ=255)
cTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCgg > 1:4278291/1‑150 (MQ=255)
tGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGTTTGGCGGt > 2:4278293/1‑150 (MQ=255)
gATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTg < 1:4277829/149‑1 (MQ=255)
aTAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTgg > 1:4278301/1‑149 (MQ=255)
gTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGNTGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGAttt < 1:4277905/150‑1 (MQ=255)
gTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGAtt < 2:4278124/149‑1 (MQ=255)
ttttCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTa < 1:4277805/150‑1 (MQ=255)
gtttCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGtt > 2:4278308/2‑125 (MQ=255)
tcttctCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTaca < 1:4278195/149‑1 (MQ=255)
cttctCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACAcc > 1:4278315/1‑150 (MQ=255)
ctcCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCttt > 2:4278317/1‑150 (MQ=255)
tcCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCttt > 1:4278324/1‑149 (MQ=255)
ccATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGGGTGGTTGGCGGTgg > 1:4278331/1‑136 (MQ=255)
cATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTa < 2:4277912/149‑1 (MQ=255)
cATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTAt < 1:4277875/150‑1 (MQ=255)
cATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTAt > 2:4278331/1‑150 (MQ=255)
tAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTg > 1:4278337/1‑150 (MQ=255)
tGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCg < 1:4277761/150‑1 (MQ=255)
tGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCg < 2:4277881/150‑1 (MQ=255)
gCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGc > 1:4278345/1‑150 (MQ=255)
tGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCt < 2:4278096/149‑1 (MQ=255)
ggCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTg > 1:4278354/1‑149 (MQ=255)
gCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCa < 2:4277838/150‑1 (MQ=255)
cAAACGTTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCAc < 2:4277973/150‑1 (MQ=255)
cAAACATTGCTCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTAtt < 2:4277698/140‑1 (MQ=255)
cAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCAc > 2:4278356/1‑150 (MQ=255)
aCATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACtca > 1:4278364/1‑150 (MQ=255)
cATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACtcat < 1:4277979/150‑1 (MQ=255)
aTTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACtcat > 2:4278369/1‑149 (MQ=255)
gcgcATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGa > 2:4278375/1‑117 (MQ=255)
gcATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCactta > 1:4278379/1‑150 (MQ=255)
aTGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAGATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACtcatc > 2:4278385/1‑143 (MQ=255)
gACATTGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCact < 2:4277793/144‑1 (MQ=255)
aCATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACttt < 1:4277958/149‑1 (MQ=255)
aCATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACttt < 1:4277681/149‑1 (MQ=255)
aCATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTg < 2:4277963/150‑1 (MQ=255)
aTGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATNTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGATTATCGGGTCGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGc < 2:4277892/149‑1 (MQ=255)
gtggtgTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCggg < 1:4277996/150‑1 (MQ=255)
tggtgTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGc < 2:4278002/121‑1 (MQ=255)
tgtgtgCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCTAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGc > 2:4278398/1‑140 (MQ=255)
tgtgtgCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTCTCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACCTACTTTGCCGGGAACTgg > 1:4278398/1‑150 (MQ=255)
gtgtgCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCact < 2:4277747/131‑1 (MQ=255)
tgCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATa < 2:4278044/150‑1 (MQ=255)
caacaaCCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGc > 1:4278407/1‑150 (MQ=255)
caacaaCCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGc < 1:4277709/150‑1 (MQ=255)
caacaaCCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGc < 1:4277892/150‑1 (MQ=255)
aacaacCGATGTTTACCGAANTGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAg < 2:4277771/148‑1 (MQ=255)
aacaacCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGcc > 2:4278409/1‑144 (MQ=255)
aacaacCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCg < 1:4277497/150‑1 (MQ=255)
acaacCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCa < 2:4277762/115‑1 (MQ=255)
caacCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTc < 1:4277585/150‑1 (MQ=255)
acCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCg > 2:4278415/1‑149 (MQ=255)
cGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGcc < 2:4277642/149‑1 (MQ=255)
gATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCat > 1:4278422/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCatt > 2:4278422/1‑150 (MQ=255)
tttACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCattta < 1:4278018/149‑1 (MQ=255)
ttACCGAAACGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGAATAGCGTCGCCatttatt > 2:4278429/1‑150 (MQ=255)
ccGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTgg > 2:4278435/1‑128 (MQ=255)
gAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTgctg > 1:4278439/1‑150 (MQ=255)
aaTGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTgctggc > 2:4278444/1‑150 (MQ=255)
aTGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTgctggct > 1:4278448/1‑150 (MQ=255)
gTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGcc > 2:4278453/1‑150 (MQ=255)
ccAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGa < 2:4278067/150‑1 (MQ=255)
ccAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGa > 1:4278458/1‑150 (MQ=255)
aGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGa < 2:4277923/148‑1 (MQ=255)
aGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGAtt < 1:4277922/150‑1 (MQ=255)
aGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGAtt > 1:4278465/1‑150 (MQ=255)
gTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTGGGCGGTGGATTTACGCCTTTGATTGCCGCTGTACTCCTCACTTACTTTGcc > 2:4278465/1‑101 (MQ=255)
aTCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTcc < 2:4278341/149‑1 (MQ=255)
cGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGc > 2:4278471/1‑149 (MQ=255)
cTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTcc > 2:4278478/1‑145 (MQ=255)
cTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAAt < 1:4278050/150‑1 (MQ=255)
tataGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAAt > 1:4278482/1‑149 (MQ=255)
taGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATg < 1:4278129/148‑1 (MQ=255)
gTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATg > 1:4278490/1‑130 (MQ=255)
gTGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTCGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGNACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGAcc < 1:4277851/149‑1 (MQ=255)
tGGCGCTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCg > 2:4278490/1‑149 (MQ=255)
gcgcTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCTGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTNGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCtt < 1:4278152/150‑1 (MQ=255)
gcgcTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCtt < 1:4278389/150‑1 (MQ=255)
cgcTGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCttt < 1:4278079/150‑1 (MQ=255)
tGGAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTttgtt > 1:4278500/1‑150 (MQ=255)
gAGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTttgtt < 1:4278115/148‑1 (MQ=255)
aGTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTtgat < 1:4278180/150‑1 (MQ=255)
gTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACt > 2:4278505/1‑62 (MQ=255)
gTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTtgatg < 1:4277946/150‑1 (MQ=255)
gTCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTATATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTtgat > 1:4278505/1‑149 (MQ=255)
tCGGTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCttt < 2:4278077/142‑1 (MQ=255)
gTTATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGAt > 1:4278511/1‑114 (MQ=255)
ttATCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGa < 2:4278209/150‑1 (MQ=255)
aTCGGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGAc < 2:4278013/149‑1 (MQ=255)
|
TGAAGCACAATCTATTTTCTGGATAGTTTTCTTCTCCATAATGCTGGCAAACATTGCGCATGACATGGTGGTGTGTGTGCAACAACCGATGTTTACCGAAATGTTTGGTGCCAGTTATCGCTATAGTGGCGCTGGAGTCGGTTATCAGGTTGCCAGTGTGGTTGGCGGTGGATTTACACCTTTTATTGCCGCTGCACTCATCACTTACTTTGCCGGGAACTGGCATAGCGTCGCCATTTATTTGCTGGCTGGATGCCTGATTTCCGCAATGACCGCTTTGTTGATGAAAGAC > NC_000913/2054653‑2054944
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
