Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A2 F13 I1 R1
|
20 |
580.9 |
19806870 |
98.8% |
19569187 |
140.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,485,023 |
A→G |
L310P (CTA→CCA) |
pepA ← |
aminopeptidase A/I |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,485,023 | 0 | A | G | 98.9%
| 2590.9
/ 5.3
| 643 | L310P (CTA→CCA) | pepA | aminopeptidase A/I |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (4/3); new base G (303/328); total (309/334) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.16e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 645 total aligned reads displayed.
AGTACCAGGCGGCCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTAGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCACGATTGGGCGTGCA > NC_000913/4484876‑4485169
|
gTACCAGGCGGCCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCt < 1:9484232/150‑1 (MQ=255)
tACCAGGCGGCCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCt < 1:9484554/149‑1 (MQ=255)
cAGGCGGCCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCcgc > 1:9485132/1‑150 (MQ=255)
cAGGCGGCCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGCGGCTCcg > 2:9485130/1‑149 (MQ=255)
aGGCGGCCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCcgcg < 2:9484751/150‑1 (MQ=255)
gcggcCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGCTTTACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGa < 2:9484598/149‑1 (MQ=255)
ggcCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGAcc > 1:9485148/1‑149 (MQ=255)
ggcCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGAcc > 2:9485145/1‑149 (MQ=255)
gcCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCAt < 1:9484461/150‑1 (MQ=255)
ttCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCg > 1:9485162/1‑150 (MQ=255)
ttCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCg > 2:9485157/1‑150 (MQ=255)
gCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCAt > 1:9485177/1‑149 (MQ=255)
gTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGCTAACGTTACTCGCCCGTTGTGGCTCcg > 2:9485176/1‑134 (MQ=255)
cGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACg < 2:9484471/149‑1 (MQ=255)
ggTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGcc < 1:9484425/150‑1 (MQ=255)
ggTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGcc < 2:9484432/150‑1 (MQ=255)
gtgtTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCg > 1:9485190/1‑150 (MQ=255)
ttCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTa < 1:9484500/149‑1 (MQ=255)
ttCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTa > 2:9485193/1‑149 (MQ=255)
cAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAAc > 1:9485202/1‑150 (MQ=255)
aGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAAcc < 1:9484621/150‑1 (MQ=255)
gCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATAGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCg < 2:9484499/150‑1 (MQ=255)
aCTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGc > 2:9485205/1‑149 (MQ=255)
cGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGccgcac > 1:9485221/1‑150 (MQ=255)
cGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGccgcac > 2:9485215/1‑150 (MQ=255)
ggTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGccgcac < 2:9484826/149‑1 (MQ=255)
gTTTGCCCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGATCcgcg < 2:9484300/114‑1 (MQ=255)
aNCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTa < 2:9484614/129‑1 (MQ=255)
aCCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCcgcaccgcac > 1:9485234/1‑148 (MQ=255)
cGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACatat > 2:9485233/1‑150 (MQ=255)
aCATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCTTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCt > 1:9485248/1‑99 (MQ=255)
cATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTa > 2:9485247/1‑150 (MQ=255)
aTGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTAc < 2:9484742/150‑1 (MQ=255)
gtggtTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTTAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACtt > 1:9485257/1‑149 (MQ=255)
gtggtTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACtt < 1:9484714/149‑1 (MQ=255)
gtTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTtcat < 2:9484918/149‑1 (MQ=255)
tAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTtcatct > 2:9485261/1‑149 (MQ=255)
tCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATg > 2:9485272/1‑150 (MQ=255)
tCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATg < 1:9484635/150‑1 (MQ=255)
gCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGcc > 1:9485279/1‑150 (MQ=255)
cccGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCt < 1:1545127/150‑1 (MQ=255)
ccGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCtt > 2:9485281/1‑150 (MQ=255)
cGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTc < 1:9484701/150‑1 (MQ=255)
ggACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCt < 2:9484533/150‑1 (MQ=255)
aCGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTg > 1:9485298/1‑149 (MQ=255)
aCGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGa < 1:9484689/150‑1 (MQ=255)
cGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGcaca > 2:9485295/1‑118 (MQ=255)
aGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCa < 2:9484369/135‑1 (MQ=255)
ggCCCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCt < 1:9485003/149‑1 (MQ=255)
gCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACatat > 2:9485309/1‑115 (MQ=255)
gCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCtt > 1:9485312/1‑149 (MQ=255)
cTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCCGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGa < 2:9484389/150‑1 (MQ=255)
gTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAg < 1:9484300/141‑1 (MQ=255)
gTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGAt < 1:9484823/148‑1 (MQ=255)
gTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATc > 2:9485322/1‑149 (MQ=255)
gTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATc > 1:9485325/1‑149 (MQ=255)
gTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATc < 1:9484786/149‑1 (MQ=255)
cGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCgag < 1:9484645/149‑1 (MQ=255)
ccAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCAACCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATa > 2:9485333/1‑150 (MQ=255)
cAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTAGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAGGGCTTGATc > 1:9485342/1‑143 (MQ=255)
aGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATAcc > 1:9485349/1‑150 (MQ=255)
aGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATAcc < 1:9484575/150‑1 (MQ=255)
aGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATAcc < 1:9484371/150‑1 (MQ=255)
ggCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATAccg < 1:9484801/150‑1 (MQ=255)
ggCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATAccg < 1:9484852/150‑1 (MQ=255)
ggCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATAcc < 1:9484764/149‑1 (MQ=255)
gCATGTTTTCGCAGCCTGCCAGCACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCga < 1:9484945/142‑1 (MQ=255)
gCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGcc > 2:9485349/1‑124 (MQ=255)
tGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCgg < 1:9484735/150‑1 (MQ=255)
gTTTTCGCAGCCTGCCAACATGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCAc < 2:9484680/69‑1 (MQ=255)
gTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATAccgccg > 1:9485361/1‑148 (MQ=255)
ttttCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGa < 2:9484787/149‑1 (MQ=255)
cGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCa < 2:9484568/63‑1 (MQ=255)
gCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGa < 2:9484871/149‑1 (MQ=255)
cAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGCGATAccgcc > 1:9485372/1‑140 (MQ=255)
aGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAgg < 2:9484659/150‑1 (MQ=255)
ccTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAg > 2:9485375/1‑141 (MQ=255)
ccAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTaa < 1:9484594/148‑1 (MQ=255)
cAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAAcc < 1:9484877/150‑1 (MQ=255)
aaCACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCt > 2:9485385/1‑150 (MQ=255)
acacGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCtt < 1:9484531/150‑1 (MQ=255)
cacGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGACGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCt > 2:9485393/1‑148 (MQ=255)
cacGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCttt < 1:9485119/150‑1 (MQ=255)
cacGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCtt > 1:9485394/1‑149 (MQ=255)
ccGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTACACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCtc > 2:9485402/1‑109 (MQ=255)
cGATAACGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGGACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTc < 2:9484190/130‑1 (MQ=255)
aaCGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATAcc < 1:9484664/117‑1 (MQ=255)
aaCGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAg > 1:9485413/1‑150 (MQ=255)
aCGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGGCGAAGGGTAAACCTTTACCCACCAg > 2:9485413/1‑149 (MQ=255)
cGTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCa < 1:9484920/150‑1 (MQ=255)
gTTAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCAc < 2:9484978/150‑1 (MQ=255)
ttAATCGGCAGTTGGGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCACg < 2:9485102/150‑1 (MQ=255)
tAATCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCACGa > 1:9485428/1‑150 (MQ=255)
tAATCGGCAGTTGTAGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCTCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCtt > 2:9485426/1‑100 (MQ=255)
aaTCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCACGa < 2:9485365/149‑1 (MQ=255)
tCGGCAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCACGATTg > 1:9485438/1‑150 (MQ=255)
tCGGCAGTTGGGGCTCCGCGACCATCCGCNTCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTaa < 2:9484849/127‑1 (MQ=255)
ccgTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCACACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGACTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCACGATTGGGCg < 2:9485012/148‑1 (MQ=255)
cAGTTGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCACGATTGGGc > 2:9485441/1‑149 (MQ=255)
ttGTGGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCACGATTGGGCGTg > 1:9485452/1‑149 (MQ=255)
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AGTACCAGGCGGCCTTCAGCGTCGGTGTTCAGCACTTCAACGGTTTGACCGGACATGGTGGTTAACACATCGCCCGGACGATAGGCTCGTCCGCCAGGCATGTTTTCGCAGCCTGCCAACACGCCGATAACGTTAATCGGCAGTTGTAGCTCCGCGACCATCCGCATCACGCCGTAAACCGCTGCCGCACCGCACATATCGTACTTCATCTCATCCATGCCTTCTGAAGGCTTGATCGAGATACCGCCGGAGTCGAAGGTTAAACCTTTACCCACCAGCACGATTGGGCGTGCA > NC_000913/4484876‑4485169
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
