Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A9 F13 I1 R1
|
112 |
360.8 |
17302090 |
99.7% |
17250183 |
98.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,988,505 |
T→C |
Y2H (TAC→CAC) |
yqeI → |
putative transcriptional regulator YqeI |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,988,505 | 0 | T | C | 99.8%
| 1824.2
/ ‑4.5
| 426 | Y2H (TAC→CAC) | yqeI | putative transcriptional regulator YqeI |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base C (227/198); total (228/198) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.85e-01 |
Only 100 of 426 total aligned reads displayed.
TAAATATAAAATTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGTACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAACGCCAGC > NC_000913/2988407‑2988602
|
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tAAATATAAAATTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCAc > 2:5541931/1‑101 (MQ=255)
tAAATATAAAATTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCAc > 1:5541927/1‑101 (MQ=255)
aaaTATAAAATTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACt > 2:5541935/1‑101 (MQ=255)
aaaTATAAAATTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACt < 2:5541875/101‑1 (MQ=255)
atatAAAATTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTgg > 1:5541942/1‑101 (MQ=255)
tataAAATTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGa > 2:5541946/1‑101 (MQ=255)
tataAAATTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGa > 1:5541949/1‑101 (MQ=255)
aaaTTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGattat < 1:5541215/101‑1 (MQ=255)
aaaTTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGattat > 1:5541955/1‑101 (MQ=255)
aaTTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGattatt < 2:5541104/101‑1 (MQ=255)
aaTTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGattatt < 2:5541404/101‑1 (MQ=255)
aTTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGAttatta < 2:5541524/101‑1 (MQ=255)
aTTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGAttatta > 2:5541957/1‑101 (MQ=255)
ttAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTaa < 2:5541230/101‑1 (MQ=255)
tAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAAc > 1:5541964/1‑101 (MQ=255)
aaTATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTTTTGACGTATGCACTGGATTATTAACg > 2:5541972/1‑101 (MQ=255)
aaTATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACg > 1:5541970/1‑101 (MQ=255)
tatatatTAATGCCGTAAATACCAATTTACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGat > 1:5541979/1‑101 (MQ=255)
atatatTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGata < 1:5541544/101‑1 (MQ=255)
atatatTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGata < 1:5541441/101‑1 (MQ=255)
tatatTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGataa > 2:5541987/1‑101 (MQ=255)
tatatTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGataa > 1:5541986/1‑101 (MQ=255)
atTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAatat < 2:5541343/101‑1 (MQ=255)
atTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAatat > 1:5541995/1‑101 (MQ=255)
tttATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATc > 2:5541999/1‑101 (MQ=255)
tttATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATc > 1:5542001/1‑101 (MQ=255)
ttATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCg < 2:5541373/101‑1 (MQ=255)
ttATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCg < 2:5541306/101‑1 (MQ=255)
tATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGa < 2:5541499/101‑1 (MQ=255)
aTGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAg < 2:5541040/101‑1 (MQ=255)
aTGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAg < 2:5541638/101‑1 (MQ=255)
tGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGt > 1:5542010/1‑101 (MQ=255)
tGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGt > 2:5542006/1‑101 (MQ=255)
tGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGt < 1:5541453/101‑1 (MQ=255)
ccGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTc > 1:5542015/1‑101 (MQ=255)
cGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCt > 2:5542018/1‑101 (MQ=255)
gTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTg < 2:5540961/101‑1 (MQ=255)
gTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTg < 2:5541486/101‑1 (MQ=255)
aaaTACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGc > 1:5542022/1‑101 (MQ=255)
aTACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCt < 1:5541263/101‑1 (MQ=255)
aTACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCt < 1:5541365/101‑1 (MQ=255)
aTACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCt < 1:5541576/101‑1 (MQ=255)
aCCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGa < 2:5541448/101‑1 (MQ=255)
aCCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGa < 2:5541471/101‑1 (MQ=255)
ccAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAg > 2:5542029/1‑101 (MQ=255)
cAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGc < 2:5541510/101‑1 (MQ=255)
atatACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCAc > 1:5542033/1‑101 (MQ=255)
atatACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCAc > 2:5542036/1‑101 (MQ=255)
ataCTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCg < 2:5541422/101‑1 (MQ=255)
taCTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGa > 1:5542041/1‑101 (MQ=255)
cTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGaaa < 1:5541014/101‑1 (MQ=255)
ttAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGaaaa > 1:5542049/1‑101 (MQ=255)
ttAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGaaaa > 2:5542045/1‑101 (MQ=255)
tAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAAt < 1:5541504/101‑1 (MQ=255)
aGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAAtt < 1:5541291/101‑1 (MQ=255)
aGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAAtt > 2:5542055/1‑101 (MQ=255)
gCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTa < 1:5541594/101‑1 (MQ=255)
cAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGtt > 2:5542060/1‑78 (MQ=255)
cAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTaa < 2:5541267/101‑1 (MQ=255)
aaaCTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAat < 2:5541543/101‑1 (MQ=255)
aaCTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAata > 1:5542063/1‑101 (MQ=255)
aCTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAatat > 1:5542067/1‑101 (MQ=255)
cTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATc < 1:5541416/101‑1 (MQ=255)
aTGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCgg > 1:5542072/1‑101 (MQ=255)
tgtgATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGt < 2:5541363/101‑1 (MQ=255)
tgATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTAc > 2:5542075/1‑101 (MQ=255)
aTCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACAt > 2:5542081/1‑101 (MQ=255)
tctcCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATa > 1:5542085/1‑101 (MQ=255)
ctcCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATaa > 2:5542087/1‑101 (MQ=255)
tcCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAAc > 1:5542091/1‑101 (MQ=255)
ccATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACg < 2:5541388/101‑1 (MQ=255)
cATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGc > 1:5542099/1‑101 (MQ=255)
tttCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCg < 2:5541963/101‑1 (MQ=255)
tttCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCg < 2:5541161/101‑1 (MQ=255)
tttCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCg > 2:5542102/1‑101 (MQ=255)
ttCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGa > 1:5542104/1‑101 (MQ=255)
attgattTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCtt > 1:5542112/1‑101 (MQ=255)
ttgattTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTa > 2:5542114/1‑101 (MQ=255)
gattTAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGcc > 1:5542119/1‑92 (MQ=255)
ttAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAAcgtc < 1:5541730/101‑1 (MQ=255)
ttAGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAAcgtc > 2:5542121/1‑101 (MQ=255)
aGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAAcgtcgt < 1:5541402/101‑1 (MQ=255)
aGTGTTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAAcgtcgt < 1:5540764/101‑1 (MQ=255)
tgtTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTc > 2:5542128/1‑101 (MQ=255)
gtTTATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCt > 1:5542131/1‑101 (MQ=255)
tttATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTg < 1:5541654/101‑1 (MQ=255)
tttATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTg < 2:5541569/101‑1 (MQ=255)
ttATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGa > 2:5542134/1‑101 (MQ=255)
tATTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGAc > 1:5542138/1‑101 (MQ=255)
aTTGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACa < 1:5541476/101‑1 (MQ=255)
tGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAAc < 1:5541326/101‑1 (MQ=255)
tGACGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAAc < 2:5541690/101‑1 (MQ=255)
aCGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAACgc > 2:5542146/1‑101 (MQ=255)
cGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAACgcc < 2:5541607/101‑1 (MQ=255)
cGTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAACgcc < 2:5541284/101‑1 (MQ=255)
gTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAACgcca < 1:5541767/101‑1 (MQ=255)
gTATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAACgcca > 1:5542147/1‑101 (MQ=255)
tATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAACgccag > 2:5542153/1‑101 (MQ=255)
tATGCACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAACgccag > 1:5542156/1‑101 (MQ=255)
|
TAAATATAAAATTAATATATATTTATGCCGTAAATACCAATATACTTAGCAAACTATGTGATCTCCATTTCGATTGATTTAGTGTTTATTGACGTATGTACTGGATTATTAACGATAATATCGAGTTCTGGCCTGAGCACCGAAAATTAATATCGGTACATAACGCCGATCTTAACGTCGTTCTGACAACGCCAGC > NC_000913/2988407‑2988602
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
