Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A3 F13 I1 R1
|
185 |
260.8 |
12342668 |
99.6% |
12293297 |
98.5 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,935,179 |
T→C |
G315G (GGT→GGC) |
fucP → |
L‑fucose:H(+) symporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,935,179 | 0 | T | C | 77.3%
| 557.4
/ 169.7
| 251 | G315G (GGT→GGC) | fucP | L‑fucose:H(+) symporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (29/28); new base C (95/99); total (124/127) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 8.80e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.30e-01 |
Only 100 of 251 total aligned reads displayed.
CGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCAT > NC_000913/2935081‑2935278
|
cGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCAc < 1:3797794/101‑1 (MQ=255)
cTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCt < 1:3797324/101‑1 (MQ=255)
cTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCt > 1:3798028/1‑101 (MQ=255)
tACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTg < 1:3797616/101‑1 (MQ=255)
cGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGc > 2:3798030/1‑101 (MQ=255)
gCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCt < 1:3797750/101‑1 (MQ=255)
gCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCt > 2:3798035/1‑101 (MQ=255)
cTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCtc < 2:3797704/101‑1 (MQ=255)
tGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCtca > 1:3798037/1‑101 (MQ=255)
tAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCtcatc > 2:3798038/1‑101 (MQ=255)
agaagaAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCtcatca > 1:3798040/1‑101 (MQ=255)
agaagaAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCtcatca < 2:3797592/101‑1 (MQ=255)
agaagaAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCtcatca < 1:3797660/101‑1 (MQ=255)
aagaaATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGt > 2:3798044/1‑101 (MQ=255)
agaaATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTc < 2:3797780/101‑1 (MQ=255)
taaaTTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCg > 1:3798046/2‑101 (MQ=255)
gaaATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCg < 2:3797674/101‑1 (MQ=255)
aaaTTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGc > 2:3798048/1‑101 (MQ=255)
aaaTTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGc < 2:3797609/101‑1 (MQ=255)
aaTTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGt < 2:3797472/97‑1 (MQ=255)
aaTTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCt < 2:3797630/101‑1 (MQ=255)
aaTTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCt < 1:3797712/101‑1 (MQ=255)
aTTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCtt < 2:3797602/101‑1 (MQ=255)
ttCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTc < 1:3797781/101‑1 (MQ=255)
ttCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTc < 1:3797665/101‑1 (MQ=255)
ttCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTc > 1:3798051/1‑101 (MQ=255)
cAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGca > 1:3798055/1‑101 (MQ=255)
gTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCtt > 2:3798058/1‑94 (MQ=255)
tATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGcaccac > 1:3798060/1‑101 (MQ=255)
tATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGcaccac > 2:3798061/1‑101 (MQ=255)
gACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACcacaca > 2:3798066/1‑101 (MQ=255)
gACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACcacaca > 1:3798067/1‑101 (MQ=255)
aCTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACaa > 2:3798069/1‑101 (MQ=255)
cTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACaaa < 2:3797977/101‑1 (MQ=255)
cAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTc > 1:3798074/1‑101 (MQ=255)
ggCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCt < 1:3797504/101‑1 (MQ=255)
gCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTg < 2:3797700/101‑1 (MQ=255)
cTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTgg > 1:3798079/1‑101 (MQ=255)
cTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTgg > 1:3798077/1‑101 (MQ=255)
ttGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGgcc < 2:3797572/101‑1 (MQ=255)
ttGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGgcc < 1:3797869/101‑1 (MQ=255)
ttGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGgcc > 2:3798080/1‑101 (MQ=255)
ttGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGgcc < 1:3797678/101‑1 (MQ=255)
gCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGgccgc < 2:3797639/101‑1 (MQ=255)
ccGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGgccgcc > 2:3798083/1‑101 (MQ=255)
gCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTa > 1:3798085/1‑101 (MQ=255)
gCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTa < 1:3797947/101‑1 (MQ=255)
cTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTAc > 2:3798088/1‑101 (MQ=255)
tAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACg < 2:3797822/101‑1 (MQ=255)
tAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACg < 2:3797882/101‑1 (MQ=255)
tAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACg > 2:3798090/1‑101 (MQ=255)
aaCTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGc > 1:3798093/1‑101 (MQ=255)
aCTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCa < 1:3797687/101‑1 (MQ=255)
cTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCAt < 2:3797522/101‑1 (MQ=255)
cTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCAt < 1:3797560/101‑1 (MQ=255)
cTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCAt < 2:3797728/101‑1 (MQ=255)
tATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCAtt > 1:3798097/1‑101 (MQ=255)
ttAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAAt > 1:3798099/1‑101 (MQ=255)
ccGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCt > 2:3798102/1‑101 (MQ=255)
cGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACg > 1:3798105/1‑89 (MQ=255)
cGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTa > 2:3798104/1‑101 (MQ=255)
ggAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTAt > 2:3798108/1‑101 (MQ=255)
aaCCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATgg > 1:3798112/1‑101 (MQ=255)
ccATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCa > 2:3798114/1‑101 (MQ=255)
ccATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCa < 1:3797655/101‑1 (MQ=255)
cATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCAc > 1:3798116/1‑101 (MQ=255)
aTGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACt < 2:3797546/101‑1 (MQ=255)
tGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACtg > 2:3798120/1‑101 (MQ=255)
tGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACtg < 2:3797759/101‑1 (MQ=255)
ggTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACtgt < 1:3797852/101‑1 (MQ=255)
ggTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACtgt > 1:3798122/1‑101 (MQ=255)
ggTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACtgt < 1:3797682/101‑1 (MQ=255)
ggTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACtgt < 1:3797767/101‑1 (MQ=255)
gtgtGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACtgtg < 1:3797847/101‑1 (MQ=255)
tgtgCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGc > 2:3798123/1‑101 (MQ=255)
gCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTg < 2:3798010/101‑1 (MQ=255)
gCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTg < 2:3797937/101‑1 (MQ=255)
cttcttTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGa > 2:3798128/1‑101 (MQ=255)
ttcttTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGAt > 1:3798129/1‑101 (MQ=255)
cttTATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACaaa > 1:3798131/1‑55 (MQ=255)
tttATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGAtctc > 2:3798133/1‑101 (MQ=255)
ttATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCa < 1:3797783/101‑1 (MQ=255)
ttATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCa > 1:3798136/1‑101 (MQ=255)
tATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAg < 1:3797818/101‑1 (MQ=255)
tATTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAg > 1:3798139/1‑101 (MQ=255)
aTTGGTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGc > 2:3798142/1‑101 (MQ=255)
ggTCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCtt > 2:3798145/1‑101 (MQ=255)
tCGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTACTgg > 1:3798146/1‑53 (MQ=255)
cGTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGc < 1:3797434/101‑1 (MQ=255)
gTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCt < 2:3797763/101‑1 (MQ=255)
gTTTCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCt > 1:3798148/1‑101 (MQ=255)
tttCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTg < 1:3797731/101‑1 (MQ=255)
ttCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTgg < 1:3797877/101‑1 (MQ=255)
tCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGc < 2:3797795/101‑1 (MQ=255)
tCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGc < 2:3797663/101‑1 (MQ=255)
tCACCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGc < 1:3797727/101‑1 (MQ=255)
aCCGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCgg > 2:3798151/1‑101 (MQ=255)
ccGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGt < 2:3797817/101‑1 (MQ=255)
ccGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGt < 2:3797742/101‑1 (MQ=255)
cGGCACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTc < 2:3797830/101‑1 (MQ=255)
|
CGCTACGCTGTAGAAGAAATTCCAGGTATGACTGCAGGCTTTGCCGCTAACTATTTAACCGGAACCATGGTGTGCTTCTTTATTGGTCGTTTCACCGGTACCTGGCTCATCAGTCGCTTCGCACCACACAAAGTCCTGGCCGCCTACGCATTAATCGCTATGGCACTGTGCCTGATCTCAGCCTTCGCTGGCGGTCAT > NC_000913/2935081‑2935278
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
