Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A0 F0 I1 R1
|
29 |
281.6 |
8141248 |
99.5% |
8100541 |
150.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
BS168_reference_genome |
2,271,505 |
C→T |
V51V (GTG→GTA) |
uvrX ← |
lesion bypass phage DNA polymerase; phage SPbeta |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | BS168_reference_genome | 2,271,505 | 0 | C | T | 99.2%
| 867.5
/ NA
| 256 | V51V (GTG→GTA) | uvrX | lesion bypass phage DNA polymerase; phage SPbeta |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base C (0/0); major base T (133/121); minor base A (1/1); total (134/122) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 263 total aligned reads displayed.
AAACAGCTTTGTAATTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATTCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAACACTACACTTCCCTGTCTATCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAATTGTGAGTAATC > BS168_reference_genome/2271358‑2271651
|
aGCTTTGTAATTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAatactaca > 1:2811011/1‑150 (MQ=21)
gCTTTGTAATTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAatactacac > 2:602141/1‑150 (MQ=21)
gCTTTGTAATTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGGGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGACTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCCTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAatactacac > 1:1459117/1‑150 (MQ=11)
tttGTAATTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACtt > 1:1546190/1‑150 (MQ=21)
tGTAATTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTcc < 1:3640441/150‑1 (MQ=21)
tGTAATTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTACCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTcc < 1:424837/150‑1 (MQ=255)
tAATTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCt > 1:1696997/1‑150 (MQ=21)
aaTTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTACCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTg < 2:1342613/150‑1 (MQ=255)
aTTTCAGTTGTATCTCTGATGAAAGGCGTCACTAGTGGAGTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCAATCCTGTTTTGATTCCATCAGCTTTTATAAGTGCAGGAGATGCAACTAATAATACACTTCCCTGt > 2:2727032/1‑150 (MQ=11)
aTTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGGGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGt > 1:3106421/1‑150 (MQ=255)
ttCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCt > 1:3304298/1‑150 (MQ=17)
ttCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCt > 1:2383639/1‑150 (MQ=17)
tCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCtc < 2:3771443/150‑2 (MQ=17)
aaaCTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTAt < 1:1802658/150‑1 (MQ=12)
aaCTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTAtt > 1:2615138/1‑150 (MQ=12)
aCTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGTTCCTGTTTTGATTCCATAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTc > 1:1243123/1‑150 (MQ=11)
tctGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTccc < 2:1616712/150‑1 (MQ=12)
tgatgaAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGGATTCCCTa > 2:3643346/1‑150 (MQ=255)
tgaAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATTCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTacaa < 1:3929662/150‑1 (MQ=17)
tgaAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTacaa < 1:3343783/150‑1 (MQ=12)
gaAAAGCTTCATTTGTGGATTTACACTGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGGTTCCAAATTCTTTTTTAAGTGCAGGAGAGGCTGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTCTTCCCTacaac > 2:1585868/1‑150 (MQ=11)
aaaGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAg < 1:3760020/150‑1 (MQ=16)
aGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAACCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCa < 2:539450/150‑1 (MQ=255)
aGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTACCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCa < 2:3135722/150‑1 (MQ=255)
cTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAg > 2:3032275/1‑150 (MQ=255)
ttCATTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGa < 2:3215143/150‑1 (MQ=255)
aTTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTACTACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAg > 2:1503745/1‑150 (MQ=255)
aTTTGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACGACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGaatg > 2:1905377/1‑147 (MQ=11)
ttGTGGATTTACATTGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCa < 2:557498/150‑1 (MQ=255)
ttGTGGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCa > 2:3683897/1‑150 (MQ=255)
gtgGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATg > 2:1144823/1‑150 (MQ=255)
gtgGATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATg < 1:3902131/150‑1 (MQ=255)
gtgGATTTACAATGTGTATCCTTGGACCCTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGTAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATg < 1:3369700/150‑1 (MQ=11)
ggATTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGtt < 1:664177/150‑1 (MQ=255)
aTTTACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTaa < 1:2239543/150‑1 (MQ=255)
aTTTACAATGTGTACCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATCCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTaa < 2:1984433/150‑1 (MQ=11)
tttACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGAACCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTaaa > 1:849244/1‑150 (MQ=255)
tACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAgg < 1:2540834/150‑1 (MQ=255)
tACAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAgg < 2:4041495/150‑1 (MQ=255)
cAATGTGTATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGt < 2:279042/150‑1 (MQ=255)
tgtATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCACCAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGGTAAGc > 1:3980185/1‑150 (MQ=11)
tATCCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGccc < 1:2054969/150‑1 (MQ=255)
tccTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGGTAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCa > 1:1906909/3‑150 (MQ=255)
tccTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCa > 2:1773767/3‑150 (MQ=255)
cTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCAtt > 1:2976920/1‑150 (MQ=255)
ttGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTg > 2:3936429/1‑150 (MQ=255)
tGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGt < 2:2448777/150‑1 (MQ=255)
ggATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGtt > 1:1430772/1‑150 (MQ=255)
tCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACa > 2:3701647/1‑150 (MQ=255)
ttCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGc > 2:1829565/1‑150 (MQ=255)
tCAGGTACCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGcc < 1:2325421/150‑1 (MQ=255)
aGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGa < 2:821439/150‑1 (MQ=255)
aTCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACa < 1:602141/150‑1 (MQ=255)
ctcAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGCTACAGa > 1:1984348/1‑150 (MQ=255)
ctcAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATCCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTCCCCTGTCTCTCCGTATCCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTAAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGa < 2:1915095/150‑1 (MQ=14)
cacAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGa < 1:3470687/148‑1 (MQ=255)
tcAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGaa < 2:690133/150‑1 (MQ=255)
cAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGCATTCCCTACAACAGCAAGAAAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAg > 1:1026388/1‑150 (MQ=255)
aTAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCAt < 1:2272723/150‑1 (MQ=255)
aGTCTCGATCCTGTTTTGTTTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATaa < 2:3290598/150‑1 (MQ=255)
gTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATaaa > 2:39148/1‑150 (MQ=255)
ctcGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGTTGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCTTAAAAg < 1:2796045/150‑1 (MQ=255)
cGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGGAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGACGATACAGAAGCATAAAAGGa < 1:536979/150‑1 (MQ=255)
cGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGa < 2:2860398/150‑1 (MQ=255)
cGATCCTGTTTTGATACCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCCCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGa < 1:72159/150‑1 (MQ=255)
aTCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGAtt > 2:1382291/1‑150 (MQ=255)
aTCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGAtt > 2:1063009/1‑150 (MQ=255)
tCCTGTTTTGATTCCAGAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGAttt < 2:2152120/150‑1 (MQ=255)
tCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATTAAAGGAttt > 1:2172975/1‑150 (MQ=255)
tCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGAttt > 2:3382338/1‑150 (MQ=255)
tCCTGTTTTGATCCCAAAACCTCTTTAAAGTGCGGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCGGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGAttt < 1:3733297/150‑1 (MQ=14)
ccTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTc > 2:2418254/1‑150 (MQ=255)
ttGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTAAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCg < 1:3262429/150‑1 (MQ=255)
tCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGAcaca < 1:2882632/150‑1 (MQ=255)
ccAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACaa < 2:2246585/150‑1 (MQ=255)
ccAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATACCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACaa < 1:910104/150‑1 (MQ=255)
cAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACaaa > 2:122722/1‑150 (MQ=255)
cAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACaaa > 1:1531755/1‑150 (MQ=255)
cAAAATCATTTTCAAGTGCAGGAGATGCACCTCATACTACACTGCCCTGACTCGCCGGATCCCCTCCCACAGCAAGGGAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACaaa < 2:2674644/150‑1 (MQ=14)
aTCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGtat > 1:2840355/1‑150 (MQ=255)
aTCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGtat < 1:3929194/150‑1 (MQ=255)
tCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACTAAGtata > 1:3379252/1‑150 (MQ=255)
tCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGtata > 1:3712353/1‑150 (MQ=255)
cTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTatat > 1:1820838/1‑150 (MQ=255)
cTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTatat > 1:2935262/1‑150 (MQ=255)
cTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTatat < 1:3418014/150‑1 (MQ=255)
tttttAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTc > 2:3515691/1‑150 (MQ=255)
tttAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATCCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCtt < 1:1607883/150‑1 (MQ=255)
ttAAGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTa < 2:1707036/150‑1 (MQ=255)
aGTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGt > 1:3509951/1‑150 (MQ=255)
gTGCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGACCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACgag > 2:1188023/1‑148 (MQ=255)
gCAGGAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGa > 2:695727/1‑150 (MQ=255)
ggAGATGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAAt > 1:1089488/1‑150 (MQ=255)
gagaTGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACCACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAAtt < 2:1673492/150‑1 (MQ=255)
gagaTGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAAtt < 1:3449840/150‑1 (MQ=255)
aTGCAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAATtgtg > 2:2287868/1‑150 (MQ=255)
tGCAGCTAATACTACCCTGCCCTGTCCCTCGGTATTCCCTAGAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTCCAGGCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATAGCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAATTGTGa < 1:1385974/150‑1 (MQ=14)
ccAGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAATTGTGAg < 2:2892873/149‑1 (MQ=255)
aGCTAATACTACCCTTCCCTGTCCCCCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAATTGTGAGTa < 2:2969643/150‑1 (MQ=14)
aGCTAATACTACACTTCCCTGTCTCTCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAATTGTGAgga > 2:2568384/1‑148 (MQ=255)
|
AAACAGCTTTGTAATTTCAGTTGAAACTCTGATGAAAAGCTTCATTTGTGGATTTACAATGTGTATTCTTGGATCTTCAGGTATCTCAAATAGTCTCGATCCTGTTTTGATTCCAAAATCTTTTTTAAGTGCAGGAGATGCAGCTAACACTACACTTCCCTGTCTATCCGTATTCCCTACAACAGCAAGATAGCATGTTAAAGGGTTAAGCCCCATTGTTACAGCCGATACAGAAGCATAAAAGGATTTCATATCGACACAAAGTATATTCTTACGTGGAAATTGTGAGTAATC > BS168_reference_genome/2271358‑2271651
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 15 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
