Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A14 F1 I1 R1
|
71 |
51.6 |
2219666 |
95.9% |
2128659 |
118.7 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,556,610 |
T→C |
intergenic (‑290/‑383) |
yjiC ← / → iraD |
uncharacterized protein/RpoS stabilzer after DNA damage, anti‑RssB factor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,556,610 | 0 | T | C | 100.0%
| 299.9
/ NA
| 79 | intergenic (‑290/‑383) | yjiC/iraD | uncharacterized protein/RpoS stabilzer after DNA damage, anti‑RssB factor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base C (46/33); total (46/33) |
ATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGTTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCGGAATATT > NC_000913/4556475‑4556744
|
aTCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTAt > 2:869148/1‑139 (MQ=255)
aTCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTAt > 2:619659/1‑139 (MQ=255)
cAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCa > 1:337252/1‑139 (MQ=255)
gCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTatat < 2:458856/139‑1 (MQ=255)
tCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTAtatta > 1:946095/1‑139 (MQ=255)
ttGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTaa > 2:906936/1‑137 (MQ=255)
ttGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTaa < 1:906936/137‑1 (MQ=255)
catgcaATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGtt < 2:962956/139‑1 (MQ=255)
catgcaATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGtt < 2:311090/139‑1 (MQ=255)
catgcaATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGtt < 2:153947/139‑1 (MQ=255)
atgcaATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGttt < 2:337252/139‑1 (MQ=255)
tgcaATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTc < 1:989783/139‑1 (MQ=255)
cATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATgg > 2:265653/1‑139 (MQ=255)
tatCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCt > 1:381560/1‑139 (MQ=255)
tatCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCt > 1:702900/1‑139 (MQ=255)
ttaCTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATg < 2:800549/139‑1 (MQ=255)
ttaCTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATg > 1:454312/1‑139 (MQ=255)
aCTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCg < 1:161164/139‑1 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTACTAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGaaa > 1:263810/1‑139 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGtt > 2:173848/1‑109 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGtt < 1:173848/109‑1 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGaaa > 2:125471/1‑139 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGaaa > 2:114164/1‑139 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGaaa > 2:1084844/1‑139 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGaaa > 2:538884/1‑139 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGaaa > 1:609302/1‑139 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGaaa > 1:345783/1‑139 (MQ=255)
aTTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGaaa > 2:914519/1‑139 (MQ=255)
tttGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGtt > 2:157313/1‑102 (MQ=255)
tttGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGtt < 1:157313/102‑1 (MQ=255)
tGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCAc < 2:702900/139‑1 (MQ=255)
tGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCAc < 1:1101434/139‑1 (MQ=255)
cTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCg > 2:675834/1‑139 (MQ=255)
ggTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTGTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGt > 1:660895/1‑139 (MQ=255)
gTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTa > 2:998389/1‑139 (MQ=255)
gTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTa > 2:594061/1‑139 (MQ=255)
gTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTa > 2:1105804/1‑139 (MQ=255)
gTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTa > 2:105662/1‑139 (MQ=255)
tCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTag < 2:381560/139‑1 (MQ=255)
tatTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTaggagc > 1:313559/1‑139 (MQ=255)
tatTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTagcagc > 1:245744/1‑139 (MQ=255)
tatTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTagcagc > 1:853689/1‑139 (MQ=255)
tatTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTagcagc > 1:618945/1‑139 (MQ=255)
aatGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACa < 2:874571/139‑1 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAaataa < 1:133168/75‑1 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAaataa > 2:133168/1‑75 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCa > 2:814822/1‑111 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCa < 1:814822/111‑1 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTag < 1:928240/125‑1 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTag > 2:928240/1‑125 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGt > 1:831483/1‑139 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGt > 2:13270/1‑139 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGt > 1:899063/1‑139 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGt > 1:254545/1‑139 (MQ=255)
gCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGt > 2:587596/1‑139 (MQ=255)
cTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAg > 2:831514/1‑136 (MQ=255)
cTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAg < 1:831514/136‑1 (MQ=255)
tgAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTAtttt > 1:20510/1‑139 (MQ=255)
aaTGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCa < 1:105662/139‑1 (MQ=255)
aaTGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCa < 2:254545/139‑1 (MQ=255)
aTGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCAt < 1:515847/139‑1 (MQ=255)
aTGGTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCAt < 2:609302/139‑1 (MQ=255)
ggTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACaa < 1:580175/127‑1 (MQ=255)
ggTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACaa > 2:580175/1‑127 (MQ=255)
gTATTTTTGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTa < 1:1084844/139‑1 (MQ=255)
ttttGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCAc < 1:23765/97‑1 (MQ=255)
ttttGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCAc > 2:23765/1‑97 (MQ=255)
ttttGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTa < 2:831483/139‑1 (MQ=255)
tttGATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTaa < 1:125471/139‑1 (MQ=255)
gATGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTa > 1:265886/1‑139 (MQ=255)
tGTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTAtt > 2:121231/1‑139 (MQ=255)
gTATTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTc > 2:930817/1‑139 (MQ=255)
aTTTGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCgg > 2:184296/1‑139 (MQ=255)
tttGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCGGa > 2:669313/1‑139 (MQ=255)
tttGATATGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCGGa < 1:998389/139‑1 (MQ=255)
atatGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCGGAatat < 1:914519/139‑1 (MQ=255)
tatGCTTTCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCGGAATAtt < 2:896766/139‑1 (MQ=255)
tatGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCGGAATAtt < 1:670778/139‑1 (MQ=255)
tatGCTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCGGAATAtt < 1:538884/139‑1 (MQ=255)
|
ATCAAAAAACGCTCATTTAAAATTATTTGCATGCAATTTAAAAGCATATCTTATTACTAATTGGAATTTGATGTTGCTATATTGAGGTCTATATTAATAATGCCTGTGAATGGTATTTTTGATGTATTTGATATGTTATCAATTTATATTATTTACAAACTAATTGTTTCAAATAATACATGGCTGATTATGCGGAAATAAATAATTTCCCACCGGAATTAAGTAGCAGCGGTGACAAGTATTTTCATCTACGTAACTATTCGGAATATT > NC_000913/4556475‑4556744
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
