Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F406 I2 R1
|
14 |
182.2 |
9069404 |
93.8% |
8507100 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,183,597 |
G→T |
D785Y (GAC→TAC) |
rpoB → |
RNA polymerase, beta subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,183,597 | 0 | G | T | 98.9%
| 609.5
/ ‑3.8
| 176 | D785Y (GAC→TAC) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (1/1); new base T (89/85); total (90/86) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.87e-01 |
Only 100 of 176 total aligned reads displayed.
CCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCC > NC_000913/4183500‑4183693
|
ccTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATAc < 1:1871456/100‑1 (MQ=255)
tGACCAAATACCCCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACgg < 1:1014775/100‑1 (MQ=255)
tGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACgg > 1:81797/1‑100 (MQ=255)
tGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACgg > 2:4292387/1‑100 (MQ=255)
gACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgt > 1:1622881/1‑100 (MQ=255)
ccAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtcc < 2:681363/100‑1 (MQ=255)
ccAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtcc > 1:3930217/1‑100 (MQ=255)
ccAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtcc > 1:3734649/1‑100 (MQ=255)
cAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtccg < 2:1577098/100‑1 (MQ=255)
aaTGCACCCGTTCTAAACAGAACACCTGTATCAACCCCATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGACCGTGGCGACGTGCTGGCATCCGgtccgtc < 2:205110/100‑1 (MQ=255)
aaTACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtccgtc > 2:593039/1‑100 (MQ=255)
aaTACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtccgtc > 1:4473963/1‑100 (MQ=255)
cacCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCAcc > 1:1267831/1‑100 (MQ=255)
cacCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCAcc > 2:41834/1‑100 (MQ=255)
gcgggTTCTAACCAGAACCATTATATCAACCAAATGCCGTATGTGACTTTGGCTGAAGCTGTTGAACGTGGCGACGGGCTTGCAGACGGTCCCTccgccg > 2:2185672/5‑100 (MQ=255)
acCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCg > 1:3132327/1‑100 (MQ=255)
cccGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGa > 2:3110941/1‑100 (MQ=255)
cccGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGa > 2:415904/1‑100 (MQ=255)
cccGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGa > 2:416028/1‑100 (MQ=255)
cGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGAcc < 2:2309116/100‑1 (MQ=255)
cTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCgg > 2:4362810/1‑100 (MQ=255)
cTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCgg < 2:3201365/100‑1 (MQ=255)
cTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCgg > 2:543193/1‑100 (MQ=255)
cTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCgg < 1:3052741/100‑1 (MQ=255)
cTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCgg < 1:2511746/100‑1 (MQ=255)
tAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGt > 2:2072228/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGAGCACCTGTATCAACCAGATGCGGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTg < 2:3720414/100‑1 (MQ=255)
ccAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGCCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGaa > 1:4176645/1‑100 (MQ=255)
cAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGAGGTCGGTGGAc < 2:1607764/100‑1 (MQ=255)
cAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAAc > 1:2714061/1‑100 (MQ=255)
cAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAAc < 2:4419185/100‑1 (MQ=255)
aGAACACCTGTATCAACCATATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACt < 2:3902780/100‑1 (MQ=255)
aGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGGGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACt < 2:3902768/100‑1 (MQ=255)
gAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGAGGTCGGTGGAcgg < 1:2198032/100‑3 (MQ=255)
gAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGAGGTCGGTGGAcgg < 2:3967785/100‑3 (MQ=255)
acacCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGACCCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGgc < 1:3753512/100‑1 (MQ=255)
acacCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGgc > 1:561652/1‑100 (MQ=255)
cacCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGgcg < 1:525719/100‑1 (MQ=255)
cacCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGgcg < 2:3161390/100‑1 (MQ=255)
acCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGgcgc > 2:3145590/1‑100 (MQ=255)
tGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTg < 2:2557546/100‑1 (MQ=255)
aTCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTc > 1:282565/1‑100 (MQ=255)
aTCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTc > 1:2753283/1‑100 (MQ=255)
aTCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTc > 1:1326811/1‑100 (MQ=255)
tCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCa < 1:2912087/100‑1 (MQ=255)
tCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCa < 1:1765516/100‑1 (MQ=255)
cAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGGATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAg < 2:749912/100‑1 (MQ=255)
cAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAg < 1:352931/100‑1 (MQ=255)
aaCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGa > 1:1578422/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGa > 1:552473/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGa > 2:1031188/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGa > 1:2422675/1‑100 (MQ=255)
aCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGaa > 1:3153691/1‑100 (MQ=255)
aCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGaa > 1:122158/1‑100 (MQ=255)
cAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACa < 2:169437/100‑1 (MQ=255)
tGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGTATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATgcg < 1:27161/100‑1 (MQ=255)
tGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATgcg < 2:3653232/100‑1 (MQ=255)
tGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATgcg > 1:2471154/1‑100 (MQ=255)
cGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGt < 2:3345988/100‑1 (MQ=255)
tgtgtCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCg > 1:596990/1‑100 (MQ=255)
gtCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTc < 1:2795809/100‑1 (MQ=255)
tctcTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCa > 1:2125176/1‑100 (MQ=255)
tctcTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCa < 2:2301531/100‑1 (MQ=255)
tttGGGTGAACGGGGTGAACGTGGCGACGGTCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATg < 1:2269915/98‑1 (MQ=255)
ctGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGc < 2:440811/100‑1 (MQ=255)
ctGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGc < 2:4444891/100‑1 (MQ=255)
ctGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGc > 1:2692964/1‑100 (MQ=255)
tGGTTGAACCGCTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGcc < 1:3907435/100‑1 (MQ=255)
ggTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGt > 2:40702/1‑100 (MQ=255)
ggTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGt > 2:2879410/1‑100 (MQ=255)
ggTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGt > 1:2036390/1‑100 (MQ=255)
gTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTg > 1:785153/1‑100 (MQ=255)
tGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTgg < 1:1975538/100‑1 (MQ=255)
tGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTgg < 1:327123/100‑1 (MQ=255)
aCCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAAt > 1:1018009/1‑100 (MQ=255)
ccGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATg < 2:643501/100‑1 (MQ=255)
acGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATg < 1:4573013/99‑1 (MQ=255)
ggTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGt > 1:3055150/1‑100 (MQ=255)
gTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGtt < 2:2038866/100‑1 (MQ=255)
ttGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTa < 1:1049223/100‑1 (MQ=255)
tGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTAc > 1:3585497/1‑100 (MQ=255)
gAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACa > 2:1213274/1‑100 (MQ=255)
aaCGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACaa > 1:1283280/1‑100 (MQ=255)
aCGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAAc < 1:4237608/100‑1 (MQ=255)
tGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTc < 1:2241611/100‑1 (MQ=255)
gACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAg < 1:1855627/100‑1 (MQ=255)
gACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAg < 1:1408341/100‑1 (MQ=255)
gACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAg < 2:3066663/100‑1 (MQ=255)
aCGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGa < 2:1301018/100‑1 (MQ=255)
gTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACt < 1:2005954/100‑1 (MQ=255)
tGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc < 1:4512797/100‑1 (MQ=255)
tGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc < 1:2139528/100‑1 (MQ=255)
tGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc > 1:1816216/1‑100 (MQ=255)
tGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc > 1:1815952/1‑100 (MQ=255)
tGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc < 1:1615946/100‑1 (MQ=255)
tGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc > 2:3521356/1‑100 (MQ=255)
tGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCAt > 1:3390833/1‑100 (MQ=255)
ggCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATc > 1:2458741/1‑100 (MQ=255)
gCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATcc > 2:1841348/1‑100 (MQ=255)
gCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATcc > 1:985047/1‑100 (MQ=255)
|
CCTGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATCC > NC_000913/4183500‑4183693
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
