Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A6 F406 I3 R1
|
15 |
135.2 |
6912603 |
92.5% |
6394157 |
99.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,183,597 |
G→T |
D785Y (GAC→TAC) |
rpoB → |
RNA polymerase, beta subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,183,597 | 0 | G | T | 99.2%
| 426.6
/ NA
| 130 | D785Y (GAC→TAC) | rpoB | RNA polymerase, beta subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base G (0/0); major base T (68/61); minor base C (0/1); total (68/62) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.77e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 130 total aligned reads displayed.
TGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATC > NC_000913/4183502‑4183692
|
tGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACg > 2:167863/1‑99 (MQ=255)
tGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGATTGTGTCTCCGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATAca > 2:167914/1‑98 (MQ=255)
gACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGATTGAACGTGGCGCCGTGCTGGCATACgg > 2:2510959/1‑99 (MQ=255)
gACCAAAAACACCCATTCCAACCAGAACACCTGTATCAACCAGCTGCCGTGTCTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACgg < 2:174002/99‑1 (MQ=255)
aCCAAATACACCCGTTCTAACCAGACCACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgt < 2:1338195/99‑1 (MQ=255)
aCCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgt > 1:3446274/1‑99 (MQ=255)
ccAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtc < 1:1104621/99‑1 (MQ=255)
cAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtcc > 2:475695/1‑99 (MQ=255)
cAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATACCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtcc > 1:25290/1‑99 (MQ=255)
aaTACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtccgt > 1:2245045/1‑99 (MQ=255)
aTACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtccgtc < 2:3028454/99‑1 (MQ=255)
aTACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGgtccgtc > 2:233234/1‑99 (MQ=255)
acacCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCa < 2:191160/99‑1 (MQ=255)
cacCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCAc < 1:1113266/99‑1 (MQ=255)
acCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTTGCATACGCTCCGTCCAcc < 2:1897002/99‑1 (MQ=255)
cccGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCg > 2:246850/1‑99 (MQ=255)
ccGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGa > 1:988707/1‑99 (MQ=255)
cGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGAc < 1:2257967/99‑1 (MQ=255)
gTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGAcc > 1:3389334/1‑99 (MQ=255)
ttCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCt > 1:3040721/1‑99 (MQ=255)
cTAACCCGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGCTGAAGCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGTCTTCg < 2:3228238/99‑1 (MQ=255)
tAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTTTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGCACGTGGCGCCGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCgg > 2:874115/1‑99 (MQ=255)
tAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCgg > 2:3187221/1‑99 (MQ=255)
aaCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGt > 2:3399855/1‑99 (MQ=255)
aaCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGt > 1:238598/1‑99 (MQ=255)
aCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTg > 1:541803/1‑99 (MQ=255)
aCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTg > 2:3001801/1‑99 (MQ=255)
aCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTg > 2:528025/1‑99 (MQ=255)
aCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTg < 1:1930521/99‑1 (MQ=255)
aCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTACACCGACCTCGGTg > 1:1656890/1‑99 (MQ=255)
aCCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGCGTCTCTGGGTGAACCGGTAGAACGTGGAGACGTGCTGGCGTACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTg > 1:3234439/1‑99 (MQ=255)
aGAACAGCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGAGGTCGGTGGAc < 2:2674129/99‑1 (MQ=255)
cTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCt > 2:296885/1‑99 (MQ=255)
cTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCt > 1:2943531/1‑99 (MQ=255)
cTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCt > 1:1793825/1‑99 (MQ=255)
cTGTATCAACCAGAAGCCGTGTGTGTCTCAGGGTGAACCAGTTGTACGTGGCGACGCGCTGGCATACGGTCTGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCt > 1:3022917/1‑99 (MQ=255)
tGTATCAAGCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCtt < 2:269312/99‑1 (MQ=255)
gTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTg < 2:2870142/99‑1 (MQ=255)
aTCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGt < 2:1557117/99‑1 (MQ=255)
aTCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGt < 1:462737/99‑1 (MQ=255)
tCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTc > 1:3263049/1‑99 (MQ=255)
cAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCa < 1:2905677/99‑1 (MQ=255)
cAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGCTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGTCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCa < 1:2082861/99‑1 (MQ=255)
aaCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAg > 2:189973/1‑99 (MQ=255)
aaCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAg > 2:591118/1‑99 (MQ=255)
aCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGa > 1:2862633/1‑99 (MQ=255)
aCCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGa > 2:3424653/1‑99 (MQ=255)
ccAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGaa < 1:3392504/99‑1 (MQ=255)
ccAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGaa < 2:1349110/99‑1 (MQ=255)
cAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAAc < 2:533090/99‑1 (MQ=255)
aGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACa > 1:2241675/1‑99 (MQ=255)
gATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGGCCTCGGTGAACTTGCGCTTGGTCAGAACAt > 1:1906676/1‑99 (MQ=255)
gATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACAt < 1:3140423/99‑1 (MQ=255)
gATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACAt < 2:1748960/99‑1 (MQ=255)
aTGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATg > 1:2455439/1‑99 (MQ=255)
aTGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATg < 2:3076657/99‑1 (MQ=255)
tGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATgc > 2:898425/1‑99 (MQ=255)
tGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATgc < 1:1932797/99‑1 (MQ=255)
tGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATgc < 2:584208/99‑1 (MQ=255)
ccGTGTGTGTCTCAGGGTGAACCGGATGAACGTGGCGACGTGCTGGAATACGGCCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACGTgcga > 2:3193352/1‑98 (MQ=255)
tgtgtgtCTCTGGGTGAAGCGGATGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACTGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCCGAACATGCGCGtc > 2:3285281/1‑98 (MQ=255)
gtgtgtCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAg < 1:1733353/99‑1 (MQ=255)
tgtCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGt < 2:1943366/99‑1 (MQ=255)
tctcTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTc < 1:638609/99‑1 (MQ=255)
tctcTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTc < 1:638340/99‑1 (MQ=255)
ctctGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCa < 1:1809281/99‑1 (MQ=255)
tctGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCAt > 2:951836/1‑99 (MQ=255)
tGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGc < 1:740020/99‑1 (MQ=255)
ggTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCATCGACCTCGGTGAAATGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCg < 2:1095260/99‑1 (MQ=255)
ggTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCg > 1:2648348/1‑99 (MQ=255)
tGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTg < 1:2628346/99‑1 (MQ=255)
aaCCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGa < 1:1547414/99‑1 (MQ=255)
aaCCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGa > 1:971714/1‑99 (MQ=255)
aaCCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGa > 1:916026/1‑99 (MQ=255)
aCCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGaa < 1:2835640/99‑1 (MQ=255)
ccGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAAt > 1:441052/1‑99 (MQ=255)
cGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATg < 1:3240761/99‑1 (MQ=255)
ggTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATgg > 2:2380117/1‑99 (MQ=255)
ggTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCATGGAATgg < 2:2162867/99‑1 (MQ=255)
gTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGt > 1:2361124/1‑99 (MQ=255)
gTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGt < 1:2112701/99‑1 (MQ=255)
ttGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGtt > 2:2648549/1‑99 (MQ=255)
tGAACGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTa > 1:1515441/1‑99 (MQ=255)
aCGTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACaa < 2:3380497/99‑1 (MQ=255)
gTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACt > 1:2730472/1‑99 (MQ=255)
gTGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCCCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACt > 2:3051498/1‑99 (MQ=255)
tGGCGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACtt < 1:236120/99‑1 (MQ=255)
cGACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGa < 1:1557470/99‑1 (MQ=255)
gACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGaa < 2:2939474/99‑1 (MQ=255)
gACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGaa < 1:74750/99‑1 (MQ=255)
gACGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGaa < 2:3389483/99‑1 (MQ=255)
aCGTGCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAg > 1:2107172/1‑99 (MQ=255)
gCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc > 1:2324834/1‑99 (MQ=255)
gCTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTc < 1:750678/99‑1 (MQ=255)
cTGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTcc < 1:247190/99‑1 (MQ=255)
tGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCa > 1:1909785/1‑99 (MQ=255)
tGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCa > 2:1890510/1‑99 (MQ=255)
tGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCa < 1:3455194/99‑1 (MQ=255)
tGGCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCa > 1:406000/1‑99 (MQ=255)
gCATACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATc > 1:1342921/1‑99 (MQ=255)
|
TGACCAAATACACCCGTTCTAACCAGAACACCTGTATCAACCAGATGCCGTGTGTGTCTCTGGGTGAACCGGTTGAACGTGGCGACGTGCTGGCAGACGGTCCGTCCACCGACCTCGGTGAACTGGCGCTTGGTCAGAACATGCGCGTAGCGTTCATGCCGTGGAATGGTTACAACTTCGAAGACTCCATC > NC_000913/4183502‑4183692
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
