Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
480,566 |
A→C |
L48W (TTG→TGG) |
tomB ← |
Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 480,566 | 0 | A | C | 98.7%
| 263.8
/ NA
| 75 | L48W (TTG→TGG) | tomB | Hha toxicity attenuator; conjugation‑related protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/0); new base C (40/34); total (41/34) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
ATAAACTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTG > NC_000913/480342‑480793
|
aTAAACTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTg > 2:133289/1‑236 (MQ=255)
cTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGc < 1:550601/236‑1 (MQ=255)
aTTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGtt < 1:140919/235‑1 (MQ=255)
tcgtcgCATTGACAATACCACGGAATATTCGGTTCCCTAACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGttt < 2:638699/236‑1 (MQ=255)
cgtcgCATTTACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAGTATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTa > 1:599702/1‑236 (MQ=255)
cgtcgCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTa < 1:133289/236‑1 (MQ=255)
gATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTAATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCCAGGttt > 1:281138/1‑236 (MQ=255)
gACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTgg < 2:366404/191‑1 (MQ=255)
gACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTgg > 1:366404/1‑191 (MQ=255)
gACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCa > 2:355054/1‑231 (MQ=255)
gACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCa < 1:355054/231‑1 (MQ=255)
ccGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCa < 1:149846/235‑1 (MQ=255)
gCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGa > 2:199067/1‑236 (MQ=255)
cATTTCGGAACGTCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCa < 2:281138/231‑1 (MQ=255)
tttCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACa > 2:52370/1‑236 (MQ=255)
ttCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAGTATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACa < 2:599702/235‑1 (MQ=255)
tCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCTAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCGTCAAGGTTTGCAAGGACGTCATGATACAgg > 2:707204/1‑236 (MQ=255)
ccTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACag > 1:429293/1‑236 (MQ=255)
tGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACagag > 2:283792/1‑236 (MQ=255)
aTACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAg < 1:52370/236‑1 (MQ=255)
ccATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCtg > 1:358316/1‑236 (MQ=255)
cATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTAccc > 1:29432/1‑165 (MQ=255)
cATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTAccc < 2:29432/165‑1 (MQ=255)
aTAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAgg > 2:114450/1‑196 (MQ=255)
aTAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAgg < 1:114450/196‑1 (MQ=255)
tAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGc < 2:24120/166‑1 (MQ=255)
tAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGc > 1:24120/1‑166 (MQ=255)
tAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTTACAGAGAAACTTAAGCTGTGc > 1:369028/1‑236 (MQ=255)
actGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGataa > 2:391772/1‑235 (MQ=255)
tGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCa < 1:283792/236‑1 (MQ=255)
gAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGc > 2:666855/1‑188 (MQ=255)
gAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGc < 1:666855/188‑1 (MQ=255)
caacaTAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTc > 1:614363/1‑236 (MQ=255)
caTAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTttcttc < 1:435344/168‑1 (MQ=255)
caTAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTttcgtc > 2:435344/1‑168 (MQ=255)
caTAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCttt > 1:44302/1‑236 (MQ=255)
caTAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCttt > 1:307759/1‑236 (MQ=255)
tAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGATTCACAGAGAAACTTAAGCTTTGCGATATCATGTCTTTTg > 1:331285/1‑236 (MQ=255)
aGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGt < 2:44302/236‑1 (MQ=255)
aGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGt < 1:391772/236‑1 (MQ=255)
tCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTgg < 1:271352/128‑1 (MQ=255)
tCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTgg > 2:271352/1‑128 (MQ=255)
tCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGat > 2:172887/1‑215 (MQ=255)
tCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGat < 1:172887/215‑1 (MQ=255)
tCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTa > 1:187070/1‑236 (MQ=255)
tCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTATTTTGGGTGAGTa > 1:185130/1‑236 (MQ=255)
cAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGGAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCAt < 2:588157/236‑1 (MQ=255)
aTCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATa > 2:235648/1‑164 (MQ=255)
aTCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATa < 1:235648/164‑1 (MQ=255)
aTCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAg < 2:232783/188‑1 (MQ=255)
aTCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAg > 1:232783/1‑188 (MQ=255)
gCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCctt > 1:222608/1‑236 (MQ=255)
tGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTcc > 2:231639/1‑226 (MQ=255)
tGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTcc < 1:231639/226‑1 (MQ=255)
tGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGc > 2:144119/1‑236 (MQ=255)
ttATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATACCGCGTCCCCTTCTTATCGGTTg > 2:673092/1‑236 (MQ=255)
tATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACaga > 2:738597/1‑162 (MQ=255)
tATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACaga < 1:738597/162‑1 (MQ=255)
cATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGa < 2:187070/236‑1 (MQ=255)
cATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGa < 2:429293/236‑1 (MQ=255)
aTTAAACTTATGTTGGGAATTAAGTGCGAAGGTCGTAATATGCTCAATCCGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGa < 2:661047/235‑1 (MQ=255)
tataCTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGacac > 2:649492/1‑236 (MQ=255)
aaTTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCa > 1:691940/1‑124 (MQ=255)
aaTTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCa < 2:691940/124‑1 (MQ=255)
ttAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGGGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGaaaaa > 2:173980/1‑236 (MQ=255)
tGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTa < 2:614363/236‑1 (MQ=255)
tGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTa < 1:144119/236‑1 (MQ=255)
gCGAAGGTCGCAATAGGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGATGTTGATCGCCGTGGTGTGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTAc < 2:1628/236‑1 (MQ=255)
ggTCCCAATATGCTCAATCAGTACATTCCACTGGAGGTTGATCCCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGAc < 2:331285/235‑1 (MQ=255)
gCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGa > 2:754831/1‑236 (MQ=255)
gCAATATGCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGa > 1:17588/1‑236 (MQ=255)
gCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCAC‑‑AGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTa > 2:597026/1‑217 (MQ=255)
gCTCAATCAGTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCAC‑‑AGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTa < 1:597026/217‑1 (MQ=255)
gTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAGAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTg > 1:139165/1‑236 (MQ=255)
gTTCATTCCACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTACAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTg > 1:744465/1‑236 (MQ=255)
ttccACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACt < 2:244177/203‑1 (MQ=255)
ttccACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACt > 1:244177/1‑203 (MQ=255)
|
ATAAACTCGCAGGATTCTCTTTCGTCGCATTGACAAAACAACGGAATAGTCGATTACCTGACTTCCGCCATTTCTGAAGATCCTGCATATTAATACCATAACTACTGAACAACATAAAGGTGTCATCCAGATATTCGTCGATCTGCTCAATGAGCTTATTGTCTTCATTATACTTAATTTTGTAATTAAGTGCGAAGGTCGCAATATGCTCAATCAGTTCATTCAACTGGAGGTTGATCGCCGAGGTTGGGTCGTTTACCCAGCCATGATTGCTTTCTTCAAGGTTTGCAAGGCAGTCATGATACAGGGTTTCACAGAGAAACTTAAGCTGTGCGATATCATGTCTTTTGGGTGAGTATTCATCCATAACGCGTCCCCTTCTTAGCGGTTGAACTAACGGACACCTTTCGGGATGGAAAAAACTTACTGACCTGGACTTGCCCTCTCGTTTG > NC_000913/480342‑480793
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 25 ≤ ATCG/ATCG < 34 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
