Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
491,048 |
T→G |
F56C (TTT→TGT) |
ybaN → |
DUF454 family inner membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 491,048 | 0 | T | G | 98.9%
| 288.9
/ NA
| 92 | F56C (TTT→TGT) | ybaN | DUF454 family inner membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (1/0); new base G (51/40); total (52/40) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.96e-01 |
AAGACCTCAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGCACTGAAGCACAACAATCGCAGTTGCAA > NC_000913/490816‑491281
|
aaGACCTCAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCCTGGtgtg > 1:553799/1‑235 (MQ=255)
gACCTCAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCCTTGTGTGGCa > 2:312141/1‑236 (MQ=255)
aCCTAAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGATTCATTTTAATCATCATTGGCTGGTTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTTCCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAg < 1:331343/236‑1 (MQ=255)
cAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTa > 1:478362/1‑235 (MQ=255)
cAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGGGTGGCAGGTa > 1:548700/1‑235 (MQ=255)
aTGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTTACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGTCAGCTATCt > 2:474360/1‑236 (MQ=255)
tGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTTCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTTCTGTACCGCTCATGGAGTGGCTGCTCTCTa > 1:762618/1‑236 (MQ=255)
gATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCGGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATACCGCTGGCGGCCTGGCGCTTTGCACGTTCTTCCTCGCGATTTCACACCTGGTCGCTGTACTGATCATGGTGTGGCTGGTACCTACGtcta > 2:180620/1‑232 (MQ=255)
tAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTgg < 1:84659/236‑1 (MQ=255)
tGTTAGGCTAAAGTACCCCATCTGTAAGCTGACAACCCTCAATTTGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGa < 2:131736/236‑1 (MQ=255)
agtaacgCTAAATTACCCAATCTGTAAGCTGACAACCCTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATGGGATGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGa < 2:659823/230‑1 (MQ=255)
aTGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAAca > 1:112671/1‑236 (MQ=255)
aaGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGCTTCCGGCAGAAACATCCTGc > 1:526896/1‑236 (MQ=255)
aaGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCGATCTTCGGTTCTGGCCGAAACATCATgg > 2:127249/1‑235 (MQ=255)
gTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGGGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCg > 1:689924/1‑235 (MQ=255)
gCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTTCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCCGTACCGCTCATGGTGTGGCCGCCTGTTACGCTTCTCGCCGACAcatatatcgatgc > 2:1885/1‑226 (MQ=255)
gCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGCTTCTGGCCGAAACATCTATCGATGc > 2:129517/1‑236 (MQ=255)
ccACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGGATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCCTGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCCTGCAGAAACATCATGCGATGc > 2:152874/1‑235 (MQ=255)
cACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGAt < 1:9470/232‑1 (MQ=255)
tctGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCcgcgc > 1:597978/1‑236 (MQ=255)
tctGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCcgcg < 2:720071/235‑1 (MQ=255)
gACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAAc > 1:265826/1‑236 (MQ=255)
caacaCTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACcg > 1:517253/1‑236 (MQ=255)
caacaCTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGGTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATTTCCGTTTCTGGCCGAAACATCATGCGATGCCGCCCGGCGTCAAACcg > 2:224839/1‑236 (MQ=255)
acacTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCCTGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGCAACCTCATTCGATTCCGCGCGTCGTCaacaccc > 2:694648/1‑230 (MQ=255)
acacTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCCATCTACGTTTCTGGCCGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAAcacct > 2:232874/1‑232 (MQ=255)
acTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCggg < 1:329746/236‑1 (MQ=255)
atatGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCCAACCGCGGGCGAt > 1:510576/1‑235 (MQ=255)
gCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGAGATTTTGc > 2:727451/1‑236 (MQ=255)
aaCGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTGTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCCAACCCCCGGCGGATTTGcgc > 2:405858/1‑234 (MQ=255)
aaCGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCCATATACGTTACTGGCAGTAACATCATGCGAAGACGCGGCGCGGCCAACCTCCGGCGCtttt > 2:406153/1‑232 (MQ=255)
aTCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACCTCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTAttt > 1:367277/1‑235 (MQ=255)
aTCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGGGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCCTGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTTGCAGAAACATCATGCGATGCGGCGCGGCGTCAAACCCGGGGCGATTTTGCTTAttt > 2:515520/1‑235 (MQ=255)
tAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACg < 2:517253/236‑1 (MQ=255)
tAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGATGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCATGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACg < 1:1885/236‑1 (MQ=255)
ctcgttGGCTGGCTTGCGGTACGGCGGGGTACGCGGGGCGTGGTATTACCGGTATTCCCGACGCCGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGc < 2:242349/232‑1 (MQ=255)
atTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGCAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCCCGGGCGATTTTGCTTATTTTGTTCCCGTTTGCCa > 1:348442/1‑235 (MQ=255)
ttGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCAtt < 2:595851/236‑1 (MQ=255)
gctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCAt > 1:725342/1‑232 (MQ=255)
ctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGc < 2:547577/218‑1 (MQ=255)
ctggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGc > 1:547577/1‑218 (MQ=255)
ggctggcGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCtg > 1:327234/1‑236 (MQ=255)
gcgttaagacagggTTCGCTTGGCATCGGATTACCGGTATTGCCAACGAGGCCGTTTTGCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGt < 2:762618/224‑1 (MQ=255)
gTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTTCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCa > 1:417641/1‑236 (MQ=255)
tGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCa < 1:127249/235‑1 (MQ=255)
gTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCa < 2:597978/236‑1 (MQ=255)
tACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTtct > 2:243405/1‑214 (MQ=255)
tACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTtct < 1:243405/214‑1 (MQ=255)
tACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGGCGAACCGCGGGCGGTTTTGCTTATTTTTGTCACGGTTGCCATTTCTTTCTGGGTCGTCCAgcgtggct > 2:444753/1‑229 (MQ=255)
gCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGCGAAATCGCGGGCTGTTTTGCTTATTTTGCTCACGATTGCCATTGCTCTGCGGTTCTTCCAGATGcc > 2:437239/1‑231 (MQ=255)
gtGGGCTTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATggg < 1:398601/234‑1 (MQ=255)
cTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATggg < 2:478362/235‑1 (MQ=255)
cTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGt < 2:725342/236‑1 (MQ=255)
tGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTg < 1:161515/236‑1 (MQ=255)
gCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATggg < 2:265826/231‑1 (MQ=255)
gCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTgcgc > 1:494419/1‑236 (MQ=255)
cGTGGTATTGCCGGTATTACCGACGGCGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTCCCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGca < 1:690930/236‑1 (MQ=255)
gtattaccggtattaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTTCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTc > 2:28949/1‑186 (MQ=255)
gtattaccggtattaccgACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTc < 1:28949/186‑1 (MQ=255)
cgacgaCGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATtctc < 1:405858/236‑1 (MQ=255)
gacgacGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGGATCATGTTGCTGGCAAtttttc > 2:295445/1‑232 (MQ=255)
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gacgCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCTATGGTGCGCATCATGTTGCTGGGAATTCTCGcca > 2:49720/1‑235 (MQ=255)
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gTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTg < 1:129517/235‑1 (MQ=255)
ggcCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCTCCTGTTTGCTTTTCTATATGTTGc > 1:243725/1‑236 (MQ=255)
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ttGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGtg > 1:270484/1‑236 (MQ=255)
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ccccGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCa < 2:210511/158‑1 (MQ=255)
cccGCGCTTTCAAGCCGGGTTGCTGGACCACTCATGGTGGGGCAGCTATCTACGTTTCGGGCAGAACAATCATGCGATGCCGGGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGc < 2:367277/236‑1 (MQ=255)
cgcgCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTTTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTTCGGTGATTGATGCACAGCaa > 2:660625/1‑236 (MQ=255)
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cgcTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAAGTCCGGTGATTGAGGAGAAGCAAGa > 2:197578/1‑236 (MQ=255)
tcTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGaa < 1:474360/235‑1 (MQ=255)
gcTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGaa < 1:232874/236‑1 (MQ=255)
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ttCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAg < 2:270484/236‑1 (MQ=255)
aCGTCTGGTGGCTGTACCGCTAATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGCAc < 2:510576/236‑1 (MQ=255)
aCGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGCAc < 1:515520/236‑1 (MQ=255)
gcttGGTTGCTGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCGACGTTTCTTGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCTTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTTTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGCACTg < 2:497611/233‑1 (MQ=255)
gCCTGGTTGCTGTACCGTTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAACCCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGCACTg < 2:548700/236‑1 (MQ=255)
gTTGCTTTCCCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAACCATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGCACTGAAGc < 1:197578/235‑1 (MQ=255)
tGTACCGCTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGACATGAAGCacaac > 2:389322/1‑235 (MQ=255)
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cTCATGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGAACTGAAGCACAAAAAttccac > 2:256765/1‑231 (MQ=255)
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aTGGTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTGTTCTTTATGTGTGGAATTCCGGGGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGCACTGAAGCACAACCATAGCAGTTg > 2:435706/1‑236 (MQ=255)
ggTGTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGCTGCCATTGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCACGAAAAGCACTGAAG‑GCAACAAttcgcatctgca > 2:258375/1‑225 (MQ=255)
|
AAGACCTCAATGAAAATGATAATTGTTATGCTAAAGTAGCCACTCTGTAAGCTGACAACACTCAATATGCAACGAATCATTTTAATCATCATTGGCTGGCTGGCGGTAGTGCTGGGTACGCTGGGCGTGGTATTACCGGTATTACCGACGACGCCGTTTATCCTGCTGGCGGCCTGGTGCTTTGCCCGTTCTTCCCCGCGCTTTCACGCCTGGTTGCTGTACCGCTCATGGTTTGGCAGCTATCTACGTTTCTGGCAGAAACATCATGCGATGCCGCGCGGCGTCAAACCGCGGGCGATTTTGCTTATTTTGCTCACGTTTGCCATTTCTCTGTGGTTCGTCCAGATGCCATGGGTGCGCATCATGTTGCTGGTAATTCTCGCCTGTTTGCTTTTCTATATGTGGCGAATTCCGGTGATTGATGAAAAGCAAGAAAAGCACTGAAGCACAACAATCGCAGTTGCAA > NC_000913/490816‑491281
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 8 ≤ ATCG/ATCG < 10 ≤ ATCG/ATCG < 30 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
