Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
615,736 |
A→C |
E527A (GAA→GCA) |
entF → |
enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 615,736 | 0 | A | C | 98.5%
| 211.5
/ ‑6.1
| 65 | E527A (GAA→GCA) | entF | enterobactin synthase multienzyme complex component, ATP‑dependent |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); major base C (25/39); minor base G (1/0); total (26/39) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.00e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
GTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTT > NC_000913/615504‑615962
|
gTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGGCCTACCGCGCTCGGTCTTTTTGAACCCGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGc > 1:193443/1‑236 (MQ=255)
aatcccAGACACCCAGCTTAGCGCGCGTGTGGCAGACAGAGCGGCAAAATCACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTGCCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGa < 2:497385/231‑1 (MQ=255)
cAGAACCCGCGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGc < 1:179868/235‑1 (MQ=255)
cgctcTTGGCGCGCTGGTGCCACAACGAGCTGCAAAACCACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGGTCGTTCCCAGTTCGTGCT‑GCGGAAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCGGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGCCCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGc < 2:3680/229‑1 (MQ=255)
cGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCg < 1:538424/236‑1 (MQ=255)
gCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACCCCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGc < 2:220415/236‑1 (MQ=255)
ggtggCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGGCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGCTAGTTTGACATGGAGCGGCCTGGCTTCCCCTGGATACCGGc > 1:674666/1‑235 (MQ=255)
ggtggCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGCTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCCCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATTCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTTGCTTCCGCTGGGTACCgcc > 1:97238/1‑233 (MQ=255)
aaGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGGTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATAACGGCCATCCGGACGa > 1:707580/1‑235 (MQ=255)
aaGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGGCTTTTTGAACCTGGCACTCCATGCGATAGATGCACCTGGAGCGGCCTGGGTACCGCCGGGGACCGGCTAGTCGGACGa > 2:197500/1‑235 (MQ=255)
gCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGa < 2:514096/165‑1 (MQ=255)
gCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGa > 1:514096/1‑165 (MQ=255)
agtggcagtttACCTGGTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGGGAGGGCGGCGTTAAACCAGGGGGAAACGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGcgtccgt < 2:344421/227‑1 (MQ=255)
gtgTTGCCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGGGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGc < 2:547904/231‑1 (MQ=255)
gcgTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCg < 1:515309/232‑1 (MQ=255)
gTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTacca > 1:423401/1‑236 (MQ=255)
ttC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCCCTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGGCCGTCCCTGTTAATTacca > 1:614324/1‑235 (MQ=255)
gcttacGGGAAATGCGCCGTCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGGGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACcga < 2:579613/230‑1 (MQ=255)
gggAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTg > 2:221883/1‑145 (MQ=255)
gggAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTg < 1:221883/145‑1 (MQ=255)
gcgcGAGTAAGTGGTGGCGACGGCGAATCTGATGCGTGAGCGCTGCGTTAAACCGGGGGACCGCGAGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCcg < 2:360646/235‑1 (MQ=255)
gcgcGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGGTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCcg < 1:712265/235‑1 (MQ=255)
gcccaaGCAGGTGGTAGCCATGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCcg < 2:515538/230‑1 (MQ=255)
cgcgAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCCGCCATCCGGACGATCGCCTTGAAATGATTCTGGAAGCAGCGCGGCCCGCGCTGCTACTTTCCACCGACGATCAAATGcccag > 2:71184/1‑233 (MQ=255)
gtggCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCcg < 1:549580/222‑1 (MQ=255)
tggCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGCACAGCGTGGCGGTGGCACTGCCGCGATCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCg < 2:284644/231‑1 (MQ=255)
aggCGCTGGGGAATCTGCTGCTGGAGCCGGGCGTTAACCCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCCCTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCCCTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCg < 2:193443/230‑1 (MQ=255)
ggCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCCATACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGtt < 1:579150/235‑1 (MQ=255)
ggCACTGGCGAATCTGCTGCGTTAGCGGGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGGGGCACTACCGCGTTCGGTCTTTTGGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGtt < 2:614324/235‑1 (MQ=255)
tgggaaaTCTGCTGCGAGCGCACGGCGTTAAACCAGGGGACTGAGTGGCGTTGGCTCTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCaa < 2:199645/230‑1 (MQ=255)
tGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGcgtccgt > 1:320715/1‑183 (MQ=255)
tGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGcgtccgt < 2:320715/183‑1 (MQ=255)
taagctgctgCGTGAGCGTGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTaa < 1:753536/232‑1 (MQ=255)
gcgTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACCACCGCGCTCGGGCTTTTTTACCCCGGCACTCCCTGCGATAGTTGCAGCTGGGGCGGCCTGGCTCCCGCCGGGTACCGGCTATCCGGACGAACGCCCGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGCCGCCGTTAAATTCCACCGACTATCAACAGCCGCGCTTTTGCGCGGTTCCCAATTTATAAAGCCTCTGCtctacatc > 2:474770/1‑231 (MQ=255)
gccAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTTCCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTa < 1:250939/235‑1 (MQ=255)
acgaGGGGAAAGCATAGCGGTGGCCCTACCGCGCTCGTTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTa < 2:488204/233‑1 (MQ=255)
ccAGGGGACAGGGTGGGGGTGGCACTACCGCGGTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTa < 1:199529/235‑1 (MQ=255)
aGCGTGGCGGTGGCACTACCCCGCTCGGTCTTTTTTACCCTGGCACTCCCTGCGGTAGTTGCCGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGCTACCGGCCATCCGGACGAACGCCTGAAAATGATGCTTGAAGATTCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCCTTTGCGATGTTTCCCATTTAACAAGCCCTTGGTATAACACCCCGCGTTCACCGcctgg > 2:69659/1‑232 (MQ=255)
gCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGaa > 2:638409/1‑115 (MQ=255)
gCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGaa < 1:638409/115‑1 (MQ=255)
cGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGa < 2:738249/126‑1 (MQ=255)
cGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGa > 1:738249/1‑126 (MQ=255)
gCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCCTGCGATAGTTGCCGCTGGAGCGGCCTGGCTACCCCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGGAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTCATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATTTGCCCCATTTTACAAGCCCTTGCTCTCACGGCCCGCTTACACCTCCGGGCAGTGcgccgc > 2:494812/1‑235 (MQ=255)
gCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGc < 1:648147/206‑1 (MQ=255)
gCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGc > 2:648147/1‑206 (MQ=255)
tACCGCGTTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCa < 1:71184/235‑1 (MQ=255)
tACCGCGTGCGGTCTGTGTGACCCTGGCACACAGTGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCa < 2:36785/235‑1 (MQ=255)
ccGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAAc < 2:21659/198‑1 (MQ=255)
ccGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAAc > 1:21659/1‑198 (MQ=255)
cTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTca > 1:279252/1‑235 (MQ=255)
ggTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAAc > 1:112365/1‑236 (MQ=255)
tCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTAACAAcc > 1:627544/1‑235 (MQ=255)
gACACTGGCACTCCAGGCGATGGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATcaca < 2:391633/236‑1 (MQ=255)
aCCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCacac < 1:197500/236‑1 (MQ=255)
gCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTTCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCtt > 1:257257/1‑235 (MQ=255)
gCACTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCtt > 2:157182/1‑235 (MQ=255)
aCTCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTtata < 1:496669/236‑1 (MQ=255)
tCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTatat < 1:489708/235‑1 (MQ=255)
tCCATGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTatat < 1:69659/235‑1 (MQ=255)
tGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATcac < 2:550039/220‑1 (MQ=255)
tGCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATcac > 1:550039/1‑220 (MQ=255)
gCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCa > 2:719108/1‑182 (MQ=255)
gCGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCa < 1:719108/182‑1 (MQ=255)
cGATAGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCttt < 1:474770/236‑1 (MQ=255)
aGTTGCAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCCCACGGCTTATATCATCttt > 1:263978/1‑232 (MQ=255)
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GTTGAGATTCCAGAAACCACGCTTAGCGCGCTGGTGGCAGAACAAGCGGCAAAAACACCGGATGCTCCGGCGCTGGCAGATGCGCGTTACCTGTTC‑AGCTATCGGGAAATGCGCGAGCAGGTGGTGGCGCTGGCGAATCTGCTGCGTGAGCGCGGCGTTAAACCAGGGGACAGCGTGGCGGTGGCACTACCGCGCTCGGTCTTTTTGACCCTGGCACTCCATGCGATAGTTGAAGCTGGAGCGGCCTGGCTACCGCTGGATACCGGCTATCCGGACGATCGCCTGAAAATGATGCTGGAAGATGCGCGTCCGTCGCTGTTAATTACCACCGACGATCAACTGCCGCGCTTTAGCGATGTTCCCAATTTAACAAGCCTTTGCTATAACGCCCCGCTTACACCGCAGGGCAGTGCGCCGCTGCAACTTTCACAACCGCATCACACGGCTTATATCATCTTT > NC_000913/615504‑615962
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 6 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 26 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
