Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I51 R1
|
223 |
69.9 |
1534784 |
95.1% |
1459579 |
214.4 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,260,939 |
T→G |
I114S (ATT→AGT) |
yjbM → |
uncharacterized protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,260,939 | 0 | T | G | 100.0%
| 228.1
/ NA
| 62 | I114S (ATT→AGT) | yjbM | uncharacterized protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (0/0); new base G (30/32); total (30/32) |
TGTAATCCTGGGGATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCACATCTGGTGAATGAAGGAACGCTCGATCCTGATATTTTAAG > NC_000913/4260710‑4261170
|
tGTAATCCTGGGGATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAgtt < 2:545985/232‑1 (MQ=255)
aaTCCTGGGGATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTc < 1:83150/236‑1 (MQ=255)
aaTCCTGGGGATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTc < 2:39405/236‑1 (MQ=255)
tCCTGGGGATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCa > 1:537852/1‑235 (MQ=255)
ccTGGGGATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCa > 2:609779/1‑234 (MQ=255)
gtgATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCt < 2:537852/234‑1 (MQ=255)
gggATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTc > 2:429987/1‑235 (MQ=255)
gggATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCt > 1:503720/1‑236 (MQ=255)
gggATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCt > 1:26768/1‑236 (MQ=255)
gggATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTGCACTTTCATATTCt > 2:288809/1‑236 (MQ=255)
gATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATACCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTa > 1:284759/1‑235 (MQ=255)
ataaAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGcc > 1:214888/1‑236 (MQ=255)
ataaAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGcc > 1:81547/1‑236 (MQ=255)
aGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACg < 1:609779/236‑1 (MQ=255)
aGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACg < 1:429987/236‑1 (MQ=255)
gATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGc < 1:211174/236‑1 (MQ=255)
aaTGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGAt < 1:313738/235‑1 (MQ=255)
cATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCa > 2:718947/1‑235 (MQ=255)
tGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGaaa < 2:284759/236‑1 (MQ=255)
tGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGaaa < 2:26768/236‑1 (MQ=255)
tGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGaaa < 2:214888/236‑1 (MQ=255)
tGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGaaa < 1:154939/236‑1 (MQ=255)
tGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGaaa < 1:443160/236‑1 (MQ=255)
aCAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAgtt < 1:492686/194‑1 (MQ=255)
aCAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAgtt > 2:492686/1‑194 (MQ=255)
cAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTGCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAgt < 1:288809/236‑1 (MQ=255)
gTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGa > 1:697875/1‑226 (MQ=255)
ttGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAgt < 2:697875/226‑1 (MQ=255)
aTGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACtt < 1:664664/185‑1 (MQ=255)
aTGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACtt > 2:664664/1‑185 (MQ=255)
aTGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGaa > 1:640077/1‑236 (MQ=255)
cTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATgag < 1:718947/236‑1 (MQ=255)
aGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGc < 2:503720/236‑1 (MQ=255)
tGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACtt < 2:69183/169‑1 (MQ=255)
tGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTAcc > 1:195762/1‑236 (MQ=255)
tGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGCTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACtt > 1:69183/1‑169 (MQ=255)
ttCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGaaa < 1:78843/186‑1 (MQ=255)
ttCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGaaa > 2:78843/1‑186 (MQ=255)
ttCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGaa > 2:366271/1‑236 (MQ=255)
ggAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAAc < 2:640077/235‑1 (MQ=255)
ggAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTg < 2:507313/236‑1 (MQ=255)
aaTCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGaaa < 2:141965/168‑1 (MQ=255)
aaTCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGaaa > 1:141965/1‑168 (MQ=255)
cTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGata < 2:180467/234‑1 (MQ=255)
aTGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATgaagaa > 1:198164/1‑232 (MQ=255)
aTGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATgaagaa < 2:198164/232‑1 (MQ=255)
ttAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGgaga > 1:426224/1‑236 (MQ=255)
aaGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGc < 2:426224/232‑1 (MQ=255)
gCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATgg > 2:558005/1‑236 (MQ=255)
cTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCa < 2:307740/178‑1 (MQ=255)
cTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCa > 1:307740/1‑178 (MQ=255)
tGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTAtc > 2:39808/1‑174 (MQ=255)
tGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTAtc < 1:39808/174‑1 (MQ=255)
ttAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTg > 2:221955/1‑235 (MQ=255)
ttGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTAt < 2:81547/236‑1 (MQ=255)
tGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATc < 1:558005/236‑1 (MQ=255)
tgccAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTAt < 1:743448/225‑1 (MQ=255)
aaCATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTAAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGTGAAATGAATTTTGATGGCAACTTGGGTAAGAtcagttcc > 2:743448/1‑229 (MQ=255)
aCATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCACATc > 2:11737/1‑236 (MQ=255)
atgatgACAAGAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCACAt < 1:634707/233‑1 (MQ=255)
atgatgACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCt < 2:489624/213‑1 (MQ=255)
atgatgACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCt > 1:489624/1‑213 (MQ=255)
caGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGCATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCACATCTGGTGAATGAAg > 2:83186/1‑236 (MQ=255)
cTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAAGTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCACATCTGGTGAATGAAgg > 1:386660/1‑234 (MQ=255)
ttAAGTCCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCACATCTGGTGAATGAAGGAACGCTCGATCCTGATATTTTAAg > 2:501464/1‑236 (MQ=255)
|
TGTAATCCTGGGGATAATAAAGATGCAATGCCCATTGAACAATGTACTTTTGATGTAGAAACTAAGAATGACCTTCCCTCCACGGTTCAGCTATTTTATGAGGAATCTAAGGATAATGAACCTTTAGCGAATATACATTTTCAAGCAATAGGTTCTGGTTTTTTAACGTTTGTTAATGCCTGCCAGGAACATGATGACAACAGCTTAAAATTATTTGCTTCGCTGTTAATTTCACTTTCATATTCTAGTGCCTACGCAGATTTATCAGAAACAGTGTATATTAATGAAAATAATGAGAGCTACCTGAAAGCTCAGTTTGAAAAATTATCTCAACGTGATATGAAGAAGTACCTGGGAGAGATGAAGCGTCTGGCTGATGGGGGAGAAATGAATTTTGATGGCTATCTGGATAAGATGTCACATCTGGTGAATGAAGGAACGCTCGATCCTGATATTTTAAG > NC_000913/4260710‑4261170
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 11 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 35 ≤ ATCG/ATCG < 40 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
