Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F418 I2 R1
|
17 |
222.3 |
11175291 |
94.5% |
10560649 |
99.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,533,492 |
A→T |
intergenic (+112/‑272) |
cysK → / → ptsH |
cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,533,492 | 0 | A | T | 94.9%
| 721.5
/ 19.0
| 218 | intergenic (+112/‑272) | cysK/ptsH | cysteine synthase A, O‑acetylserine sulfhydrolase A subunit/phosphohistidinoprotein‑hexose phosphotransferase component of PTS system (Hpr) |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (8/3); new base T (105/101); total (113/105) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.19e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 223 total aligned reads displayed.
AATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGG > NC_000913/2533396‑2533587
|
aaTGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGTAACTGGTATTTAAc > 1:1670408/1‑99 (MQ=255)
aaTGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTAc < 2:3412065/99‑1 (MQ=255)
aaTGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTAc < 1:505292/99‑1 (MQ=255)
aaTGCGTAAAAAAGCACCTTATTAGGCGCTTTTTTGTGGGCTGCTCCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTCATTCTGCCTGTCGGAACTGGTATTTTAc < 1:5270464/99‑1 (MQ=255)
tGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCa < 2:279696/99‑1 (MQ=255)
cGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGa > 2:4247325/1‑99 (MQ=255)
gTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGAc > 1:3871497/1‑99 (MQ=255)
tAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACt < 2:1575928/99‑1 (MQ=255)
aaaaaGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTaa < 1:3219533/99‑1 (MQ=255)
aaaGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTCGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGGATTTTACCAGCCTAatt > 2:25189/1‑99 (MQ=255)
aaGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAatta > 1:5294681/1‑99 (MQ=255)
aaGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAatta > 1:602489/1‑99 (MQ=255)
gCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAattatt < 1:2850767/99‑1 (MQ=255)
aCCTTTTTAGGTGCTTTTTTTTTTTTTTTTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTCtttt > 2:1799217/1‑99 (MQ=255)
aCCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTAtttt < 2:4774668/99‑1 (MQ=255)
aCCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTAtttt < 2:4561991/99‑1 (MQ=255)
aCCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTAtttt < 1:4426449/99‑1 (MQ=255)
ccTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTg < 2:2740040/99‑1 (MQ=255)
ccTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTg > 1:1336754/1‑99 (MQ=255)
cTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGa < 2:4453600/99‑1 (MQ=255)
tttttAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGAt < 2:843830/99‑1 (MQ=255)
aaaaaGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATg > 2:3299320/5‑99 (MQ=255)
tttAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATgc < 2:5211181/99‑1 (MQ=255)
tAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATgcgc < 1:1629097/99‑1 (MQ=255)
gTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTTATGCGCGaa > 1:1548601/1‑99 (MQ=255)
gTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGaa > 1:1404628/1‑99 (MQ=255)
tGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGaaa < 2:2598857/99‑1 (MQ=255)
gCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAAt > 1:3595285/1‑99 (MQ=255)
ttttGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAAt < 2:3948082/99‑1 (MQ=255)
ttttGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAAt < 2:1253024/99‑1 (MQ=255)
ttGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCg < 1:881287/99‑1 (MQ=255)
tgtgGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGt < 1:2292691/99‑1 (MQ=255)
tgGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTa > 1:841168/1‑99 (MQ=255)
tgGCCTGCTTCAAACGTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGTTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTa < 2:4369251/99‑1 (MQ=255)
ggCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTAc < 1:4664846/99‑1 (MQ=255)
ggCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTAc < 2:2906861/99‑1 (MQ=255)
gCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACa < 1:58020/99‑1 (MQ=255)
ccTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAg > 2:2346148/1‑99 (MQ=255)
cTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCCGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAgg > 1:3838021/1‑99 (MQ=255)
cTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGaaa > 2:5289573/1‑99 (MQ=255)
ttaaaaCTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTAAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCATACTCATTCGTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACACGaaaa > 2:1062114/4‑99 (MQ=255)
ttaaaaCTTTCGCCCCTCCCGGCATTGATTCACCCTGTCGCAACTGGAATTTAACCAGAACAATTCTTTTGTTGCGCGAAATTCATTGCTACTGGaaaa > 2:1140677/4‑99 (MQ=255)
ttCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGaaaa > 2:1180633/1‑99 (MQ=255)
ttCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGaaaa > 1:1426699/1‑99 (MQ=255)
ttCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGaaaa > 2:4844147/1‑99 (MQ=255)
ttCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTCTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGAGCGAAATTAATCGTTACAGGaaaa > 2:3785914/1‑99 (MQ=255)
aaaCTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGcc < 1:2592760/99‑1 (MQ=255)
aaaCTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGcc > 1:1911282/1‑99 (MQ=255)
aaCTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCa < 1:3541529/99‑1 (MQ=255)
aaCTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCa < 2:421726/99‑1 (MQ=255)
aaCTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCa > 2:2073610/1‑99 (MQ=255)
aCTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCACGAAAGTAATCGTTACAGGAAAAGCCaa > 1:5125313/1‑99 (MQ=255)
cTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTTTCGAACCTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAGATTAATCGTTACAGGAAAAGCCaaa > 2:5383505/1‑99 (MQ=255)
tttCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAg > 2:3224032/1‑99 (MQ=255)
tttCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAg > 1:3493562/1‑99 (MQ=255)
tttCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAg < 1:1220451/99‑1 (MQ=255)
tCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCt < 1:4891455/99‑1 (MQ=255)
cccTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAGATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAAt > 1:5172101/1‑99 (MQ=255)
cccTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAAt < 1:1977850/99‑1 (MQ=255)
cccTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAAt > 1:4235218/1‑99 (MQ=255)
cccGCCTGGCATTAATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATATTGATGCGCGAAATTAATCTTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAAt > 2:3522939/1‑99 (MQ=255)
cctcctGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATc > 2:2690133/1‑99 (MQ=255)
cctcctGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATc < 2:946158/99‑1 (MQ=255)
ctcctGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCg > 1:3483300/1‑99 (MQ=255)
cctGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGAt < 1:4313813/99‑1 (MQ=255)
ctGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGAtt < 1:5645752/99‑1 (MQ=255)
tGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGAttt > 1:1047467/1‑99 (MQ=255)
ggCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGAtttt > 1:4993350/1‑99 (MQ=255)
gCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTa < 1:1158553/99‑1 (MQ=255)
gCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTa < 2:3079378/99‑1 (MQ=255)
gCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTa > 2:5050815/1‑99 (MQ=255)
cATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTAt > 2:3853682/1‑99 (MQ=255)
ttGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGa < 1:3755892/99‑1 (MQ=255)
gATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGAtt < 1:2231305/99‑1 (MQ=255)
gATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGAtt > 2:4638903/1‑99 (MQ=255)
aTTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGAttt > 2:3213397/1‑99 (MQ=255)
aTTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGAttt > 2:4926412/1‑99 (MQ=255)
aTTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGAttt > 1:203159/1‑99 (MQ=255)
ttCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTg < 1:4583248/99‑1 (MQ=255)
cAGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGt < 1:4367242/99‑1 (MQ=255)
aGCCTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGtt < 2:5085140/99‑1 (MQ=255)
ccTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAATCCAAAGCTGTATCGATTTTATGATTTGGTTCa > 2:3608277/1‑99 (MQ=255)
cTGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCaa > 1:388334/1‑99 (MQ=255)
tGTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAAt < 1:1942199/99‑1 (MQ=255)
gTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAAtt > 2:3701799/1‑99 (MQ=255)
gTCGGAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAAtt > 1:1243052/1‑99 (MQ=255)
cGGAACTCGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAAttct < 1:4745756/99‑1 (MQ=255)
gAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAAttcttc < 2:675053/99‑1 (MQ=255)
gAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAAttcttc > 1:1770728/1‑99 (MQ=255)
gAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAAttcttc > 1:4132449/1‑99 (MQ=255)
gAACTGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAAttcttc < 2:34353/99‑1 (MQ=255)
tGGTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCTTCCttt > 2:76855/1‑99 (MQ=255)
ggTAATTTACCAGACTAATTATCTAGAGGCACGAAATTAATCGTTACAGGAACAGCCAAAGCCGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCGTCCTTTa < 2:3561107/99‑1 (MQ=255)
gTATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAg < 1:1854376/99‑1 (MQ=255)
tATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGc > 1:2981936/1‑99 (MQ=255)
tATTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGc > 1:3386576/1‑99 (MQ=255)
aTTTTACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCg > 1:5448864/1‑99 (MQ=255)
aTTTTACCAGACTAATTATTTGGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCg < 2:3750237/99‑1 (MQ=255)
ttttACCAGACTGATTATTTTGATGCACGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCAGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCGTCCTTTAGCgg > 1:4967084/1‑99 (MQ=255)
ttttACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCGAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCgg > 2:5194413/1‑99 (MQ=255)
|
AATGCGTAAAAAAGCACCTTTTTAGGTGCTTTTTTGTGGCCTGCTTCAAACTTTCGCCCCTCCTGGCATTGATTCAGCCTGTCGGAACTGGTATTTAACCAGACTAATTATTTTGATGCGCGAAATTAATCGTTACAGGAAAAGCCAAAGCTGAATCGATTTTATGATTTGGTTCAATTCTTCCTTTAGCGG > NC_000913/2533396‑2533587
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
