Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A10 F418 I2 R1
|
17 |
222.3 |
11175291 |
94.5% |
10560649 |
99.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
2,628,644 |
A→T |
C99S (TGT→AGT) |
yfgF ← |
cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, anaerobic |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 2,628,644 | 0 | A | T | 98.9%
| 592.5
/ ‑4.2
| 175 | C99S (TGT→AGT) | yfgF | cyclic‑di‑GMP phosphodiesterase, anaerobic |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/2); new base T (103/69); total (104/71) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.65e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.93e-01 |
Only 100 of 178 total aligned reads displayed.
ACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCC > NC_000913/2628548‑2628739
|
acacAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACtga > 1:100523/1‑99 (MQ=255)
acaATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTgaga > 1:3919274/1‑99 (MQ=255)
caATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaa < 1:1206898/99‑1 (MQ=255)
aaTCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaat < 2:2815472/99‑1 (MQ=255)
aaTCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaat < 1:75996/99‑1 (MQ=255)
aaTCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaat < 1:1740289/99‑1 (MQ=255)
tCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatga < 1:863294/99‑1 (MQ=255)
tCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatga > 2:4013295/1‑99 (MQ=255)
tCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACACCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatga < 2:2145808/99‑1 (MQ=255)
cTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgat < 1:1443619/99‑1 (MQ=255)
tGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgata < 1:1182333/99‑1 (MQ=255)
gCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgataa > 2:4643654/1‑99 (MQ=255)
gCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgataa < 1:1970080/99‑1 (MQ=255)
gCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgataa < 1:2729000/99‑1 (MQ=255)
ccAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgataat > 2:2304099/1‑99 (MQ=255)
ccAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgataat < 1:4206784/99‑1 (MQ=255)
ccAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgataat > 2:458470/1‑99 (MQ=255)
cAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgataatg > 2:2581511/1‑99 (MQ=255)
aGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgataatga > 2:2355319/1‑99 (MQ=255)
aGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGaatgataatga < 1:2058218/99‑1 (MQ=255)
tataCGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATgataatgataat < 1:3314573/99‑1 (MQ=255)
cGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATaaaa < 1:2343215/99‑1 (MQ=255)
gCTGTGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAAt < 2:309119/99‑1 (MQ=255)
gCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAAt > 1:2504575/1‑99 (MQ=255)
gCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAAt < 2:1777951/99‑1 (MQ=255)
gCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAAt < 1:905/99‑1 (MQ=255)
gggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg < 1:1365041/99‑1 (MQ=255)
gggAAATGAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGCTACGCCGGGGAGCAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAg > 2:5299785/1‑99 (MQ=255)
ggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGc > 1:5256366/1‑99 (MQ=255)
ggAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGc < 1:4530498/99‑1 (MQ=255)
ggAAATTAAACGGGGACCACCATATGGAACTTTGTCAGGCCGGGGGGTAAAGAACCTGTAACCGCCCCAACTGAAAAGATTAAGGATAATTACATTAGc < 2:5503544/99‑1 (MQ=255)
aTTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGtt < 1:4469175/99‑1 (MQ=255)
ttAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTa > 1:3734267/1‑99 (MQ=255)
ttAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTa < 2:1768276/99‑1 (MQ=255)
tAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTaa > 1:9707/1‑99 (MQ=255)
aaaCGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAAt < 2:1195700/99‑1 (MQ=255)
aaaCGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAAt < 1:10198/99‑1 (MQ=255)
aggggTATCACCATCTAAAACGTTGTTACGCCAGGAAGTAAAGACCCTGTAACCTCCCCAACTTAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGa < 2:362162/97‑1 (MQ=255)
aCGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGa > 2:857832/1‑99 (MQ=255)
gggTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATa > 1:2933846/1‑99 (MQ=255)
cACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGttt > 1:3521094/1‑99 (MQ=255)
aCCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTc < 2:2957866/99‑1 (MQ=255)
ccATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCg > 2:1632941/1‑99 (MQ=255)
cATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGt > 2:4850901/1‑99 (MQ=255)
aTGTGAAACGTTGTTACTCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCGGTTAATGATAGCGTTTCGTa < 2:4218178/99‑1 (MQ=255)
gtgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGAAAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTaaa > 1:2803860/1‑99 (MQ=255)
tgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTaaaa > 1:1867594/1‑99 (MQ=255)
tgAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTaaaa > 1:5044456/1‑99 (MQ=255)
gAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTaaaaa < 2:3823251/99‑1 (MQ=255)
aaaCGTTGTTACGCGGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAAc > 2:4194170/1‑99 (MQ=255)
aaaCGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAAc > 1:3247321/1‑99 (MQ=255)
aaaCGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAAc > 2:1521919/1‑99 (MQ=255)
aaCGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAAcc > 1:409142/1‑99 (MQ=255)
gttgttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAg < 1:4739225/99‑1 (MQ=255)
ttgttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGc > 2:649074/1‑99 (MQ=255)
tgttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGct < 2:418768/99‑1 (MQ=255)
ttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGCGTGATAATGATAATAAAAACAGCAGTTAACGATAGCGTTTCGTAAACACCCAGcgct > 2:4495554/1‑99 (MQ=255)
ttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGctct < 2:3365047/99‑1 (MQ=255)
ttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGctct > 1:4638785/1‑99 (MQ=255)
ttACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGctct > 1:111060/1‑99 (MQ=255)
aCGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGc > 1:123835/1‑99 (MQ=255)
aCGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGc < 2:2977313/99‑1 (MQ=255)
aCGCCAGGTAGTAAAGACCCTGTAACCGCGCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGAGAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGc < 2:4317553/99‑1 (MQ=255)
cGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAACATTAGCCGTTAATGATACCGTTTCGTAAGAACCCAGCTCTGCa > 2:4828329/1‑99 (MQ=255)
gCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCat > 1:615780/1‑99 (MQ=255)
gCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCat > 1:936527/1‑99 (MQ=255)
ccGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCata < 2:137634/99‑1 (MQ=255)
cGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCatat > 1:4131897/1‑99 (MQ=255)
gggAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATAttt > 1:2865964/1‑99 (MQ=255)
gAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGCGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGc < 2:4153031/99‑1 (MQ=255)
gAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGc > 2:798230/1‑99 (MQ=255)
gAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTACCCGATAATGATAGCGTTTCGAAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGc > 2:5160521/1‑99 (MQ=255)
gAGTAAAGACCCTCTAACCGCCCCAACTGAGCATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGc < 2:4325609/99‑1 (MQ=255)
aGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCg < 2:1141522/99‑1 (MQ=255)
aGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCg > 1:569656/1‑99 (MQ=255)
aGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCg > 1:4423728/1‑99 (MQ=255)
tAAAGACCCTGTAAGCGCCCCAACTGAGACTGATAATGATAATAGAATTAGCCGTTGATGATAGCGTTTCGTAAAGACCCAGCTCTGCATATTTGCGGa > 1:4903350/1‑99 (MQ=255)
tAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGa > 2:4699803/1‑99 (MQ=255)
tAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGa > 1:3946419/1‑99 (MQ=255)
tAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGa < 2:4544646/99‑1 (MQ=255)
aaGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACa > 2:3297220/1‑99 (MQ=255)
aaGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACa > 1:3632241/1‑99 (MQ=255)
aaGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACa > 2:222726/1‑99 (MQ=255)
aGACCCTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaa > 2:2393096/1‑99 (MQ=255)
cccTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACaaaaa > 1:526117/1‑99 (MQ=255)
ccTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAAt < 2:4425337/99‑1 (MQ=255)
ccTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAAt > 2:4723616/1‑99 (MQ=255)
ccTGTAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAAt < 1:3337468/99‑1 (MQ=255)
tAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCt > 2:2555456/1‑99 (MQ=255)
tAACCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCt > 2:539100/1‑99 (MQ=255)
aaCCGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTa > 1:5202208/1‑99 (MQ=255)
ccGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAg > 1:1541206/1‑99 (MQ=255)
ccGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAg > 1:677106/1‑99 (MQ=255)
ccGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAg > 1:5481932/1‑99 (MQ=255)
cGCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAgg < 1:3063051/99‑1 (MQ=255)
gCCCCAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGAAAAAAATCCCTAAGGc > 2:588572/1‑99 (MQ=255)
cccAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCTAGCTCTGCATATTTACGGACAAAAATCCCTAAGGCGa > 1:5127330/1‑99 (MQ=255)
cccAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGa > 1:4188108/1‑99 (MQ=255)
cAACTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATc > 1:2160990/1‑99 (MQ=255)
aaCTGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATcc < 2:3187887/99‑1 (MQ=255)
|
ACACAATCTGCCAGAATATACGCTGGGAAATTAAACGGGTATCACCATGTGAAACGTTGTTACGCCGGGGAGTAAAGACCCTGTAACCGCCCCAACAGAGAATGATAATGATAATAAAATTAGCCGTTAATGATAGCGTTTCGTAAAAACCCAGCTCTGCATATTTGCGGACAAAAATCCCTAAGGCGATCC > NC_000913/2628548‑2628739
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 27 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
