Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
142,754 |
A→C |
intergenic (‑84/‑25) |
can ← / → yadG |
carbonic anhydrase/putative ABC transporter ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 142,754 | 0 | A | C | 99.1%
| 785.2
/ ‑2.2
| 222 | intergenic (‑84/‑25) | can/yadG | carbonic anhydrase/putative ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/0); new base C (121/99); total (123/99) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 5.04e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.22e-01 |
Only 100 of 222 total aligned reads displayed.
TCTATGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTAAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTGGGAT > NC_000913/142657‑142849
|
tCTATGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAg > 2:4046091/1‑100 (MQ=255)
tGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACg < 2:2487834/100‑1 (MQ=255)
tGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACg > 2:835299/1‑100 (MQ=255)
tCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgta < 2:1738960/100‑1 (MQ=255)
cTTTGATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaa > 2:4648993/1‑100 (MQ=255)
cTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaa < 1:3130603/100‑1 (MQ=255)
cTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaa > 2:1527312/1‑100 (MQ=255)
tttCATGGAGGTTAACGAGCCGTAACGAAATAATTACGTTTGGCTCATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaag < 1:5210066/100‑1 (MQ=255)
tttCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaag < 2:186903/100‑1 (MQ=255)
cATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggta < 2:3405154/100‑1 (MQ=255)
cATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggta > 2:1422604/1‑100 (MQ=255)
aTGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtaa > 1:4818064/1‑100 (MQ=255)
aTGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtaa > 1:4878717/1‑100 (MQ=255)
tGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtaag < 2:4872465/100‑1 (MQ=255)
aGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtagatcg > 1:2156071/1‑95 (MQ=255)
ggTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTaaa > 2:2365710/1‑100 (MQ=255)
ttAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTaaaaa < 2:3257413/100‑1 (MQ=255)
tAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAAt > 1:3265757/1‑100 (MQ=255)
aaCGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAGCGTAAGGTAAGTAAAAAtt > 2:18152/1‑100 (MQ=255)
aaCGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAAtt > 1:2314815/1‑100 (MQ=255)
aaCGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGAGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAAtt < 2:1461963/100‑1 (MQ=255)
aCGACCTGTAACCAAATAATTACGTGTGGCTAAGAGAGGGCAACTCCGGGACGAGTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAAgtt > 2:809078/1‑100 (MQ=255)
cGACCTGTAACCAAATAATTACGTGTGGCCAATATAGAGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTa < 1:5564206/100‑1 (MQ=255)
aCCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTTCGGGACGATTTAAACCACATATAAATTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATg > 2:115000/1‑100 (MQ=255)
aCCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATg < 2:3840855/100‑1 (MQ=255)
aCCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATg > 1:111541/1‑100 (MQ=255)
ccTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGa > 1:1803953/1‑100 (MQ=255)
ccTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGa > 1:3366244/1‑100 (MQ=255)
cTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGAc < 1:1251335/100‑1 (MQ=255)
tGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGAcc < 1:373515/100‑1 (MQ=255)
tGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGAcc > 2:5100363/1‑100 (MQ=255)
gTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCa > 2:3740514/1‑100 (MQ=255)
gTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCa < 1:2064742/100‑1 (MQ=255)
tAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCAt < 2:2046979/100‑1 (MQ=255)
tAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCAt > 2:120848/1‑100 (MQ=255)
aCCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTg > 1:1273643/1‑100 (MQ=255)
aCCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTg > 1:1407018/1‑100 (MQ=255)
ccAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGc > 2:4064410/1‑100 (MQ=255)
cAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCa > 2:5243053/1‑100 (MQ=255)
aaaTAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCAc < 2:2262858/100‑1 (MQ=255)
taatTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTgg > 1:2620126/1‑100 (MQ=255)
aatTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGa < 2:4612298/100‑1 (MQ=255)
atTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGaa > 1:4609688/1‑100 (MQ=255)
atTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGaa > 1:2671840/1‑100 (MQ=255)
ttACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTGCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAAc < 2:739130/100‑1 (MQ=255)
cGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTc < 1:5171356/100‑1 (MQ=255)
cGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTc > 2:319394/1‑100 (MQ=255)
cGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTc < 1:544193/100‑1 (MQ=255)
gTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCa > 1:1546974/1‑100 (MQ=255)
gTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCa < 2:2328275/100‑1 (MQ=255)
gTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCa < 1:2853979/100‑1 (MQ=255)
ttGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAAc < 2:5282890/100‑1 (MQ=255)
ttGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAAc < 1:4241005/100‑1 (MQ=255)
ttGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAAc < 1:846410/100‑1 (MQ=255)
tGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACa < 1:3427517/100‑1 (MQ=255)
tGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACa > 1:1996103/1‑100 (MQ=255)
tGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACa < 2:4986562/100‑1 (MQ=255)
gggCTAATATAGGGCAACTCCGGGACCAGTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGCAACTTCAACa > 2:5224982/2‑100 (MQ=255)
ggCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAg > 2:3822695/1‑100 (MQ=255)
ggCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAg < 1:3031348/100‑1 (MQ=255)
ggCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAg < 1:4008981/100‑1 (MQ=255)
gCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGc > 2:3531061/1‑100 (MQ=255)
cTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCt > 1:370721/1‑100 (MQ=255)
cTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCt < 2:4517753/100‑1 (MQ=255)
cTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCt < 2:2671575/100‑1 (MQ=255)
aaTATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTa > 1:4369839/1‑100 (MQ=255)
tataGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTaaa > 1:5361617/1‑100 (MQ=255)
tataGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTaaa > 1:5048411/1‑100 (MQ=255)
ataGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTaaaa < 2:3354673/100‑1 (MQ=255)
taGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTaaaaa < 1:417573/100‑1 (MQ=255)
taGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTaaaaa > 2:4438343/1‑100 (MQ=255)
gggCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTaaaaaaa > 2:10321/1‑100 (MQ=255)
ggCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAGGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAAc > 2:4821313/1‑100 (MQ=255)
ggCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAAc > 1:2480384/1‑100 (MQ=255)
ggCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATGTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAAc > 1:1876164/1‑100 (MQ=255)
gCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAAcc < 2:84636/100‑1 (MQ=255)
aCTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTAt > 2:1770229/1‑100 (MQ=255)
tCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATcc > 1:439934/1‑100 (MQ=255)
tCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTAAAAAAAAAAAAAAAAACCTATcc < 2:2641066/100‑1 (MQ=255)
ggACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAggn < 1:1146198/100‑2 (MQ=255)
ggACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAggc < 1:2367090/100‑1 (MQ=255)
ggACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAggc > 1:2744108/1‑100 (MQ=255)
ggACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAggc > 1:577152/1‑100 (MQ=255)
ggACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAggc < 2:1658798/100‑1 (MQ=255)
cGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAggcggc < 2:2984272/100‑1 (MQ=255)
cGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAggcggc < 2:2776201/100‑1 (MQ=255)
aTTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAATAAACCTATCCAGGCGGCGt > 2:4914778/1‑100 (MQ=255)
aTTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGt < 1:1740305/100‑1 (MQ=255)
ttcaaCCACAGATAAAGACACAGAAGGTAAAGTAAGTAAAAATTTATGACCATTTTACTTTAACGTCAACAGCTTAAAAAAACCTATTCATGCGGCGTTc < 2:329754/97‑1 (MQ=255)
aaaCCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAg < 2:429153/100‑1 (MQ=255)
ccACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGgcg > 1:3395518/1‑100 (MQ=255)
cacaGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCCGGCGGCGTTCAGgcgc > 2:3089110/1‑100 (MQ=255)
cacaGATAAAGTGTCAGAACATAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGgcgc > 1:4342746/1‑100 (MQ=255)
aGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAATATTTATGTCCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAGAACCTTTCCGGGCGGCGTTCAGGCGCTTc < 2:541757/100‑1 (MQ=255)
aGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTc < 2:1255351/100‑1 (MQ=255)
gATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCg < 1:4095572/100‑1 (MQ=255)
aTAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGt < 1:3106467/100‑1 (MQ=255)
aaGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTggg > 2:2832467/1‑100 (MQ=255)
aaGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTggg < 1:3852589/100‑1 (MQ=255)
aGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTGGGa < 2:2594555/100‑1 (MQ=255)
|
TCTATGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTAAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTGGGAT > NC_000913/142657‑142849
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
