Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
142,754 |
A→C |
intergenic (‑84/‑25) |
can ← / → yadG |
carbonic anhydrase/putative ABC transporter ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 142,754 | 0 | A | C | 98.4%
| 424.7
/ ‑2.2
| 128 | intergenic (‑84/‑25) | can/yadG | carbonic anhydrase/putative ABC transporter ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (69/57); total (70/58) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.99e-01 |
Only 100 of 128 total aligned reads displayed.
TCTATGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTAAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTGGGAT > NC_000913/142657‑142849
|
tCTATGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAg < 1:1972235/100‑1 (MQ=255)
cTATGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGa > 2:2488345/1‑100 (MQ=255)
tATGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGaa > 1:3103346/1‑100 (MQ=255)
tCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgta > 1:645655/1‑100 (MQ=255)
tCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgta > 2:869216/1‑100 (MQ=255)
cTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaa > 1:2986323/1‑100 (MQ=255)
cTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaa > 2:1232839/1‑100 (MQ=255)
tttCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaag < 2:2774075/100‑1 (MQ=255)
ttCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaagg < 1:920975/100‑1 (MQ=255)
aTGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtaa > 2:2796275/1‑100 (MQ=255)
aTGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtaa > 2:3567490/1‑100 (MQ=255)
tGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtaag < 2:2861861/100‑1 (MQ=255)
tGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtaag < 1:1913299/100‑1 (MQ=255)
tGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtaag < 1:1443105/100‑1 (MQ=255)
tGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACgtaaggtaag > 1:3637400/1‑100 (MQ=255)
ggAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGACTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGgtaagt < 2:3904384/100‑1 (MQ=255)
gAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGgtaagta > 1:2122912/1‑100 (MQ=255)
ggTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAAGGAAAGGTAAGTaaa > 1:3384640/1‑100 (MQ=255)
ggTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTaaa > 2:3691976/1‑100 (MQ=255)
ggTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTaaa > 1:1467074/1‑100 (MQ=255)
tAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAAt > 2:3706486/1‑100 (MQ=255)
aaCGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAAtt < 2:2764101/100‑1 (MQ=255)
aaCGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAAtt < 2:3443123/100‑1 (MQ=255)
cGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTa < 1:2416834/100‑1 (MQ=255)
gACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTAt > 2:335545/1‑100 (MQ=255)
ccTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGa > 1:122293/1‑100 (MQ=255)
ccTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGa > 2:1118165/1‑100 (MQ=255)
cTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGAc < 1:3466134/100‑1 (MQ=255)
cTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGAc < 1:928191/100‑1 (MQ=255)
gTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCa > 2:2717108/1‑100 (MQ=255)
gTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCa > 1:3156587/1‑100 (MQ=255)
aaCCAAATAATTACGATAGGCTAAGATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATACAGTGTCAGAACGTAAAAAAAAAAAAAATTTATGACCAtt < 2:570145/100‑1 (MQ=255)
ccAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGc > 1:2224764/1‑100 (MQ=255)
ccAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGc > 2:1356522/1‑100 (MQ=255)
cAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGTACGATTTTAACCACATATAAATTGTCAGAACGTAAGGAAGGTAAAAATTTATGACCATTGCa > 2:3609527/1‑100 (MQ=255)
cAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCa > 1:214776/1‑100 (MQ=255)
cAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCa > 1:2624978/1‑100 (MQ=255)
cAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCa > 2:1022162/1‑100 (MQ=255)
cAAATAATTACGTTTGGCTAATACAGGGCACCTCCGTGACGATCTAAACCACAGATAAGGAGTCAGAACGTAAGGTACGTCAAACTTTATGACCATTGCa > 2:2847768/1‑100 (MQ=255)
aaaTAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCAc < 1:897342/100‑1 (MQ=255)
aataatTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGAGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACt < 1:3426148/100‑1 (MQ=255)
ataatTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAACATTTATGACCATTGCACTg < 2:1625131/100‑1 (MQ=255)
taatTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTgg > 1:948658/1‑100 (MQ=255)
aatTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGa < 1:1139410/100‑1 (MQ=255)
ttACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAAc > 1:2569267/1‑100 (MQ=255)
ttACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAAc < 1:1563706/100‑1 (MQ=255)
tACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACt < 1:1043819/100‑1 (MQ=255)
cGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTc < 1:3368982/100‑1 (MQ=255)
gTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATGTAAACGACAGATAGAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCa > 1:3625012/1‑100 (MQ=255)
ttGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAAc < 2:97520/100‑1 (MQ=255)
tGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACa < 1:1407180/100‑1 (MQ=255)
tGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACa < 1:814862/100‑1 (MQ=255)
ggCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAg > 1:846731/1‑100 (MQ=255)
ggCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAg > 2:532717/1‑100 (MQ=255)
ncTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGc > 1:106387/2‑100 (MQ=255)
ncTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGc > 1:3250555/2‑100 (MQ=255)
cTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCt > 2:3139899/1‑100 (MQ=255)
cTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCt > 2:3327211/1‑100 (MQ=255)
tAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCtt > 1:3771588/1‑100 (MQ=255)
tAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCtt < 2:2074448/100‑1 (MQ=255)
tAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCtt < 2:683809/100‑1 (MQ=255)
atatAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTaa > 2:604135/1‑100 (MQ=255)
gggCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTaaaaaaa > 1:2102623/1‑100 (MQ=255)
gggCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTaaaaaaa < 1:1507646/100‑1 (MQ=255)
ggCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAAc < 1:616875/100‑1 (MQ=255)
gCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAAcc < 1:1416434/100‑1 (MQ=255)
cAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCt > 2:524702/1‑100 (MQ=255)
aaCTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTa > 2:3533445/1‑100 (MQ=255)
aaCTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTa < 2:1118376/100‑1 (MQ=255)
aCTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTAt > 2:1343258/1‑100 (MQ=255)
cTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATc > 1:270911/1‑100 (MQ=255)
cGATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAggcggc > 2:3857876/1‑100 (MQ=255)
gATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGgcggcg < 2:2070031/100‑1 (MQ=255)
gATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGgcggcg < 1:1504172/100‑1 (MQ=255)
gATTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGgcggcg < 1:3188501/100‑1 (MQ=255)
aTTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGt > 2:3935647/1‑100 (MQ=255)
aTTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGt > 2:2837684/1‑100 (MQ=255)
aTTTAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGt > 2:1789775/1‑100 (MQ=255)
tttAAACCAGAGAGGAAGAGGCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCATTGGAACTAAAAAAAAAAAAAATAACCTATCCAGGCGGCGtt < 2:3662489/100‑1 (MQ=255)
tttAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGtt > 2:2018362/1‑100 (MQ=255)
ttAAACCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTc < 2:3288441/100‑1 (MQ=255)
aaaCCACAGATAAAGTATCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAg < 2:1248438/100‑1 (MQ=255)
aaCCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAgg < 1:847666/100‑1 (MQ=255)
aaCCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAgg > 2:161163/1‑100 (MQ=255)
aCCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTCAGTAAAAAATTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTACACAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGgc > 2:2033387/1‑100 (MQ=255)
aCCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGgc > 1:570794/1‑100 (MQ=255)
aCCACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGgc > 1:3317483/1‑100 (MQ=255)
ccACAGATGAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGgcg > 2:3837527/1‑100 (MQ=255)
ccACAGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTAAAAAAAAAAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGgcg < 2:655770/100‑1 (MQ=255)
cacaGGTAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATTACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGgcgc < 1:1676770/100‑1 (MQ=255)
cacaGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGgcgc > 1:2485151/1‑100 (MQ=255)
caGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAATAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCtt < 1:3548190/100‑1 (MQ=255)
caGAAAAGGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTTAGGCGCtt < 2:3835822/100‑1 (MQ=255)
aGATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCtat < 2:2314729/100‑3 (MQ=255)
gATAAAGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCg > 2:2603425/1‑100 (MQ=255)
gATAAAGTGTAAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCg > 2:9722/1‑100 (MQ=255)
aaaGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTgg < 1:2254368/100‑1 (MQ=255)
aaaGTGTCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTCCAACAGCTTAAAAAAACCTATTCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTgg < 1:3645559/100‑1 (MQ=255)
gtgtCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTGGGAt > 2:1128530/1‑100 (MQ=255)
gtgtCAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTGGGAt < 1:1805304/100‑1 (MQ=255)
|
TCTATGTCTTTCATGGAGGTTAACGACCTGTAACCAAATAATTACGTTTGGCTAATATAGGGCAACTCCGGGACGATTTAAACCACAGATAAAGTGTAAGAACGTAAGGTAAGTAAAAATTTATGACCATTGCACTGGAACTTCAACAGCTTAAAAAAACCTATCCAGGCGGCGTTCAGGCGCTTCGTGGGAT > NC_000913/142657‑142849
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
