Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
467,350 |
A→C |
intergenic (‑38/‑62) |
ybaE ← / → cof |
putative ABC transporter periplasmic binding protein/thiamine pyrimidine pyrophosphate hydrolase; HMP‑PP phosphatase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 467,350 | 0 | A | C | 99.4%
| 640.9
/ ‑5.4
| 178 | intergenic (‑38/‑62) | ybaE/cof | putative ABC transporter periplasmic binding protein/thiamine pyrimidine pyrophosphate hydrolase; HMP‑PP phosphatase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (99/78); total (99/79) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.44e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.98e-01 |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
TTTCCGGCGGAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTACTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAC > NC_000913/467254‑467446
|
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ttCCGGCGGAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTc < 1:1701764/100‑1 (MQ=255)
tCCGGCGGAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTAttccttcc < 2:3735961/100‑1 (MQ=255)
ccGGCGGAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCg < 1:2902676/100‑1 (MQ=255)
ccGGCGGAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCg < 2:480026/100‑1 (MQ=255)
cggcggAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGt < 2:2200618/100‑1 (MQ=255)
ggcggAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGTATATAAACCCGGAGCAATATTATTTAACTAGTCACTATTCCTTCCGta < 2:3340222/100‑1 (MQ=255)
cggAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGtata < 1:74637/100‑1 (MQ=255)
gAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGtatata > 1:4322966/1‑100 (MQ=255)
gAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGtatata > 1:3244810/1‑100 (MQ=255)
aGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATc > 1:5555657/1‑100 (MQ=255)
ggTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCa < 1:3294847/100‑1 (MQ=255)
ggTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCa > 2:32125/1‑100 (MQ=255)
gTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAg < 2:1798521/100‑1 (MQ=255)
tGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGt < 1:4001378/100‑1 (MQ=255)
gCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTg > 2:3112714/1‑100 (MQ=255)
cacaGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGAt < 1:3679733/100‑1 (MQ=255)
caGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATAc > 2:3461796/1‑100 (MQ=255)
aGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACt < 1:1104824/100‑1 (MQ=255)
aGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACt > 2:2512851/1‑100 (MQ=255)
gACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGTGAAATCGCATATAATCCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCACGTGATACTc < 2:4734760/100‑1 (MQ=255)
gACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTc < 2:4806201/100‑1 (MQ=255)
cGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCaa > 1:2183221/1‑100 (MQ=255)
gTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAAt > 1:3355425/1‑100 (MQ=255)
ttGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATc > 1:3876733/1‑100 (MQ=255)
ttGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATc < 1:2268368/100‑1 (MQ=255)
ttGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAAGCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATc < 1:3041262/100‑1 (MQ=255)
gATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCAc > 2:3635469/1‑100 (MQ=255)
tACTGGTTAAGACGGTTGAGCGATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCa > 1:5393595/1‑100 (MQ=255)
tACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCa > 2:1452945/1‑100 (MQ=255)
aCTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCAt > 2:2777347/1‑100 (MQ=255)
cTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCAtt > 1:479214/1‑100 (MQ=255)
tGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGACACTCAATCACCATTa < 2:4174415/100‑1 (MQ=255)
ggTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTaa > 1:3722557/1‑100 (MQ=255)
ggTTAAGACGGTTGAGCAATCACATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATCCACTATTCCTTGCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACTATTaa > 2:1325511/1‑100 (MQ=255)
gTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAAGCACCATTAAc > 2:770124/1‑100 (MQ=255)
ttAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAAcc < 2:3368803/100‑1 (MQ=255)
ttAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAAcc < 2:2105556/100‑1 (MQ=255)
ttAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAAcc < 2:2896672/100‑1 (MQ=255)
ttAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAAcc < 2:2763846/100‑1 (MQ=255)
tAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCg > 2:2053327/1‑100 (MQ=255)
aaGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCgt > 2:4861529/1‑100 (MQ=255)
ngACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCgtg > 1:4421469/2‑100 (MQ=255)
aGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCgtg > 1:5003591/1‑100 (MQ=255)
aGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCgtg > 1:1135533/1‑100 (MQ=255)
gACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCgtgt > 1:4139159/1‑100 (MQ=255)
aCGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTc < 1:2663023/100‑1 (MQ=255)
nggTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTca > 1:1507554/2‑100 (MQ=255)
ggTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTcac > 1:4852436/1‑100 (MQ=255)
ttGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACag > 2:44844/1‑100 (MQ=255)
aGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGt < 1:4574803/100‑1 (MQ=255)
gCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTg < 2:3942791/100‑1 (MQ=255)
gCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTg > 2:545223/1‑100 (MQ=255)
cAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTgg < 1:887829/100‑1 (MQ=255)
cAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTgg < 1:3553408/100‑1 (MQ=255)
aaTCGCATATAAACCCGTAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGga < 1:3140787/100‑1 (MQ=255)
aTCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGgag > 1:1759310/1‑100 (MQ=255)
aTCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGgag > 1:1558270/1‑100 (MQ=255)
aTCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGgag > 2:3148472/1‑100 (MQ=255)
tCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGgaga > 2:4340952/1‑100 (MQ=255)
tCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGgaga < 2:4283180/100‑1 (MQ=255)
cGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGCGTGGacaa > 2:1228173/1‑100 (MQ=255)
cGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaa < 2:4347804/100‑1 (MQ=255)
cGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATCCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaa > 2:5372448/1‑100 (MQ=255)
gCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaaa > 1:49075/1‑100 (MQ=255)
gCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaaa > 2:2295251/1‑100 (MQ=255)
gCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaaa < 1:338416/100‑1 (MQ=255)
gCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaaa > 1:1339522/1‑100 (MQ=255)
cATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaaag < 2:5192092/100‑1 (MQ=255)
cATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaaag > 2:4194276/1‑100 (MQ=255)
tataAGCCCGGAACAATATTATTTAACTACTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaaagaa < 1:5082915/100‑1 (MQ=255)
tataAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaaagaa > 2:2413214/1‑100 (MQ=255)
tataAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGagaaagaa > 1:2034615/1‑100 (MQ=255)
ataAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTATCACAGAGTGGAgaaagaaa < 2:1120175/100‑1 (MQ=255)
taAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAAt < 2:1514322/100‑1 (MQ=255)
taAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAAt > 1:1783218/1‑100 (MQ=255)
taAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAAt > 1:2030962/1‑100 (MQ=255)
aaaCCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATg > 2:3618204/1‑100 (MQ=255)
aaaCCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATg < 2:3795354/100‑1 (MQ=255)
aCCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGc > 1:5235391/1‑100 (MQ=255)
cccGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCt > 1:2981928/1‑100 (MQ=255)
cGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCg < 2:878461/100‑1 (MQ=255)
cAATATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTgg > 2:1315359/1‑100 (MQ=255)
aaTATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGgc < 2:1538954/100‑1 (MQ=255)
aaTATTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGgc < 1:3494191/100‑1 (MQ=255)
atatTATTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGgca < 1:3914115/100‑1 (MQ=255)
tattatTTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGgcag > 2:1917733/1‑100 (MQ=255)
attTAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCAtt < 1:3218315/100‑1 (MQ=255)
tttAACTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCAttt < 2:1120441/100‑1 (MQ=255)
aaCTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGat < 2:1902050/100‑1 (MQ=255)
aaCTATTCACTATTCCGTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGat < 1:1669232/100‑1 (MQ=255)
cTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGatat > 1:2365701/1‑100 (MQ=255)
cTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGatat > 2:3580766/1‑100 (MQ=255)
cTATTCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGatat > 2:5342572/1‑100 (MQ=255)
ttCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATatgga < 1:973138/100‑1 (MQ=255)
tCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATatggat < 1:3213123/100‑1 (MQ=255)
tCACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATatggat < 2:2701638/100‑1 (MQ=255)
cACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGTAAGAAATGGCGCGTCTGGCAGCATTTGACatggatg > 2:5350909/1‑100 (MQ=255)
cACTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATatggatg > 2:1653561/1‑100 (MQ=255)
cTATTCCTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGc < 2:4574357/100‑1 (MQ=255)
|
TTTCCGGCGGAAGGTTGCCACAGACGTTGATACTGGTTAAGACGGTTGAGCAATCGCATATAAACCCGGAACAATATTATTTAACTATTCACTATTACTTCCGTATATATCAGGTGATACTCAATCACCATTAACCGTGTCACAGAGTGGAGAAAGAAATGGCTCGTCTGGCAGCATTTGATATGGATGGCAC > NC_000913/467254‑467446
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
