Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
750,404 |
+C |
coding (1766/2448 nt) |
ybgQ ← |
putative outer membrane protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 750,400 | 1 | . | C | 96.1%
| 617.3
/ 16.0
| 178 | coding (1770/2448 nt) | ybgQ | putative outer membrane protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base . (3/4); new base C (88/83); total (91/87) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 7.16e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 198 total aligned reads displayed.
ACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑C‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCAC > NC_000913/750301‑750494
|
aCCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATg > 1:3839949/1‑100 (MQ=255)
ccAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑c > 1:2818265/1‑100 (MQ=255)
cAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑c‑c > 1:2153467/1‑100 (MQ=255)
aGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑c‑cc < 1:1695929/100‑1 (MQ=255)
aGAAATATCCCACTCACACGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGCCAGACATG‑c‑ca > 2:2978997/1‑99 (MQ=255)
taaaTATCCCGCTCACCCGCTGAACTCAGGTGGTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGTTGGGATTGTAGTCCGGCAGACATG‑c‑cc‑c < 2:4284185/99‑1 (MQ=255)
aaaTATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑c‑cc‑cc > 1:4493391/1‑99 (MQ=255)
aaaTATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑c‑cc‑cc < 2:3336892/100‑2 (MQ=255)
aaaTATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑C‑CC‑Ca < 1:1044183/100‑1 (MQ=255)
aaTATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑c‑cc‑cca > 1:2951899/1‑98 (MQ=255)
atatCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑c‑cc‑ccag > 2:2598794/1‑97 (MQ=255)
aCTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTAc < 1:1757464/100‑1 (MQ=255)
aCTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTAc < 1:3944716/100‑1 (MQ=255)
cTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACg > 2:1766611/1‑100 (MQ=255)
cTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACg > 1:3667477/1‑100 (MQ=255)
cACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTGCGtt > 2:1379180/1‑100 (MQ=255)
cACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGGTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGCATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGtt < 2:5373291/100‑1 (MQ=255)
aCCCGCTGAACTCAGGTGCGGGTAGTTACCGCTCACCTGGGCGCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTGCGtta > 1:4749764/1‑99 (MQ=255)
ccGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCAt < 2:4592490/100‑1 (MQ=255)
cGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATc < 1:1397802/100‑1 (MQ=255)
cGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATc > 2:1889896/1‑100 (MQ=255)
cTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCa > 2:3509184/1‑100 (MQ=255)
aaCTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCg < 1:2524907/100‑1 (MQ=255)
aCTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGAAATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGt > 1:2443706/1‑100 (MQ=255)
cTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTa > 2:4935460/1‑100 (MQ=255)
tCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTAt < 1:2013585/100‑1 (MQ=255)
ggTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGt > 2:4722314/1‑100 (MQ=255)
ggTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGt > 2:1362401/1‑100 (MQ=255)
gTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGtt < 1:1954822/100‑1 (MQ=255)
gCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTcc > 2:5344118/1‑100 (MQ=255)
cTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCa < 2:1934534/100‑1 (MQ=255)
cTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCa > 1:4095589/1‑100 (MQ=255)
cTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑C‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCAc < 1:32628/100‑1 (MQ=255)
tGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCAc > 1:1605463/1‑100 (MQ=255)
tGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCAc < 1:1857045/100‑1 (MQ=255)
tGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCAc > 2:4681612/1‑100 (MQ=255)
tGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑C‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACg > 1:1424199/1‑100 (MQ=255)
tAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGAc < 1:1786978/100‑1 (MQ=255)
aGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACa > 1:967421/1‑100 (MQ=255)
gTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACAt < 2:4536301/100‑1 (MQ=255)
gTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACAt > 1:4226362/1‑100 (MQ=255)
tACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGc < 1:3376267/100‑1 (MQ=255)
tACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGc > 1:3326414/1‑100 (MQ=255)
tACCGCACACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTTCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGc > 2:5071278/1‑100 (MQ=255)
naCCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTCTTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGc > 1:1907508/2‑100 (MQ=255)
aCCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCg > 1:1654517/1‑100 (MQ=255)
ccGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCgg > 2:2724230/1‑100 (MQ=255)
ccGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCgg > 1:4385811/1‑100 (MQ=255)
ccGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCgg < 2:1177885/100‑1 (MQ=255)
cGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGgt < 2:4866534/100‑1 (MQ=255)
gCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGgtg < 2:2084906/100‑1 (MQ=255)
gCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGgtg < 2:5483351/100‑1 (MQ=255)
cTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGgtgt > 2:273222/1‑100 (MQ=255)
cACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTAt > 1:4301619/1‑100 (MQ=255)
aCCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATg < 2:4087583/100‑1 (MQ=255)
ccTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATgg < 2:2272216/100‑1 (MQ=255)
ccTGGGCTCCATTGGCCGGACGATCGGAGTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATgg < 2:2473273/100‑1 (MQ=255)
cTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGt > 2:2009639/1‑100 (MQ=255)
cTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCtgt > 1:3953532/1‑100 (MQ=255)
tCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCtgtg < 1:5417003/100‑1 (MQ=255)
cATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGc > 2:1242674/1‑100 (MQ=255)
cATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGc < 2:1107025/100‑1 (MQ=255)
cATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑C‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTACTGTGGCt < 2:5268035/100‑1 (MQ=255)
tctcGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACt < 1:123618/97‑1 (MQ=255)
tctcGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACt < 1:2922559/97‑1 (MQ=255)
gTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACt > 2:2164283/1‑100 (MQ=255)
gTCCGGACGATCGAATTGCAGTCCGGCACACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTCCTGTGGCTACt > 1:4903639/1‑100 (MQ=255)
ccGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGt > 2:3932810/1‑100 (MQ=255)
ccGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGt > 1:1430591/1‑100 (MQ=255)
ccGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGt < 1:2683562/100‑1 (MQ=255)
cGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACtaga > 2:2895006/1‑97 (MQ=255)
cGATCGGATTGTAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGc > 2:1075901/1‑100 (MQ=255)
cGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGc > 1:1356024/1‑100 (MQ=255)
cGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGc < 2:3804759/100‑1 (MQ=255)
cGATCGGATTGCAGGCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGc < 1:681983/100‑1 (MQ=255)
gATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCa > 1:4622680/1‑100 (MQ=255)
gATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCa < 1:406052/100‑1 (MQ=255)
aTCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCAt > 1:3100010/1‑100 (MQ=255)
aTCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCAt < 1:2256625/100‑1 (MQ=255)
aTCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCAt < 2:4198996/100‑1 (MQ=255)
aTCGGATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCAt < 1:3977583/100‑1 (MQ=255)
ggATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTc < 2:1703551/100‑1 (MQ=255)
gATTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGGGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCa < 2:3437057/100‑1 (MQ=255)
aTTGCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTGCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCAt < 1:2903007/100‑1 (MQ=255)
gCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGc < 2:4014529/100‑1 (MQ=255)
gCAGTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGc < 1:4480413/100‑1 (MQ=255)
gactCCGGCAGACCTT‑CTCC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGCCTCGTCCCCCGACATGCGGTGTATGGTGCCGTGTCTACTGTTTTGCATGTCATAGcc > 2:3271286/4‑100 (MQ=255)
gTCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCaa > 1:794008/1‑100 (MQ=255)
tCCGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAAc < 1:762924/100‑1 (MQ=255)
ccGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCaatc > 2:1450528/1‑98 (MQ=255)
tggCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAAccc < 1:4672537/99‑1 (MQ=255)
cGGCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAAccc > 1:1539610/1‑100 (MQ=255)
ggCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAAccca > 2:4615579/1‑99 (MQ=255)
ggCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCg > 2:4437282/1‑100 (MQ=255)
ggCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCg > 1:3519805/1‑100 (MQ=255)
ggCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCg > 1:634695/1‑100 (MQ=255)
ggCAGACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCg > 1:1257707/1‑100 (MQ=255)
gACATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGacca > 1:2979021/1‑100 (MQ=255)
aCATGCC‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGaccac < 1:275869/100‑1 (MQ=255)
aCATG‑C‑CCACAGGTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTTCCCGACATGGGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGaccac < 2:4755492/100‑1 (MQ=255)
|
ACCAGAAATATCCCACTCACCCGCTGAACTCAGGTGCTGATAGTTACCGCTCACCTGGGCTCCATTGTCCGGACGATCGGATTGCAGTCCGGCAGACATG‑C‑CC‑CAGCTATTACGTTCATCCAGCGTATCGTTCCACGACATGCGGTGTATGGTGCTGTGGCTACTGTTTTGCATGTCATAGCCAACCCGACCAC > NC_000913/750301‑750494
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
