Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
930,957 |
A→C |
N2K (AAT→AAG) |
cydD ← |
glutathione/cysteine ABC transporter export permease/ATPase |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 930,957 | 0 | A | C | 99.1%
| 786.3
/ ‑2.6
| 224 | N2K (AAT→AAG) | cydD | glutathione/cysteine ABC transporter export permease/ATPase |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/1); new base C (115/107); total (116/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 7.84e-01 |
Only 100 of 229 total aligned reads displayed.
GCTCACAAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTATTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCGCATGGTGTCG > NC_000913/930861‑931053
|
gCTCACAAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATttcttc < 2:3163996/100‑1 (MQ=255)
gCTCACAAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATttcttc > 1:378723/1‑100 (MQ=255)
gCTCACAAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATttcttc > 2:5086916/1‑100 (MQ=255)
gCTCACAAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATttcttc > 1:1850718/1‑100 (MQ=255)
cTCACAAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCa < 1:956187/100‑1 (MQ=255)
tCACAAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCAt < 2:4615199/100‑1 (MQ=255)
tCACAAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCAt < 2:4881583/100‑1 (MQ=255)
caaaaaGCCCAGCAGACGAGAAATATTAAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTCTTGACGAGATTTCTTTAtt > 1:819851/4‑100 (MQ=255)
acaAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTg > 1:148517/1‑100 (MQ=255)
caAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGc > 2:5332738/1‑100 (MQ=255)
caAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGc > 2:3717317/1‑100 (MQ=255)
aaaGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCa < 2:4569183/100‑1 (MQ=255)
aGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACg < 2:4160670/100‑1 (MQ=255)
gCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGc > 2:2718698/1‑100 (MQ=255)
cagcagACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTa > 2:3248402/1‑100 (MQ=255)
agcagACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAg > 1:3642148/1‑100 (MQ=255)
cagACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCa > 2:1402091/1‑100 (MQ=255)
gACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAgg > 2:4386099/1‑100 (MQ=255)
aCGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGt > 2:2941526/1‑100 (MQ=255)
cGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTg > 1:2769006/1‑100 (MQ=255)
cGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTg < 2:354372/100‑1 (MQ=255)
gagaAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGTAGGTGa > 2:102107/1‑100 (MQ=255)
gagaAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGa > 1:1238191/1‑100 (MQ=255)
ngaAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAg > 1:4449049/2‑100 (MQ=255)
gaAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGt > 1:4785535/1‑100 (MQ=255)
gaAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTATTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGt < 2:5053878/100‑1 (MQ=255)
aaaTATTCAGCCAACGTTGGGAAATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGtt > 1:4660094/1‑100 (MQ=255)
aaTATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTa > 1:3534793/1‑100 (MQ=255)
atatTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTAt > 1:452694/1‑100 (MQ=255)
atatTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTAAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTAt > 2:5410233/1‑100 (MQ=255)
tatTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATc > 2:1749511/1‑100 (MQ=255)
tatTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTGTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATc > 2:3676325/1‑100 (MQ=255)
ttCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAg > 2:1496536/1‑100 (MQ=255)
cAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGaa > 2:1581962/1‑100 (MQ=255)
cAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGaa > 2:2337384/1‑100 (MQ=255)
aGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAat > 2:4333924/1‑100 (MQ=255)
aGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAat < 1:2109757/100‑1 (MQ=255)
aaCGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAattatt > 1:1300461/1‑100 (MQ=255)
aaCGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAattatt > 2:1114282/1‑100 (MQ=255)
cGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTg < 2:1326139/100‑1 (MQ=255)
ttGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCa < 1:3701284/100‑1 (MQ=255)
ttGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCa < 1:1175439/100‑1 (MQ=255)
tGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGGTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCag < 1:4461898/100‑1 (MQ=255)
tGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCag > 1:3549594/1‑100 (MQ=255)
ggAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCagag < 1:709352/100‑1 (MQ=255)
ggAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCagag < 2:964204/100‑1 (MQ=255)
ggAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCagag > 2:3217777/1‑100 (MQ=255)
ggAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCagag < 2:1937897/100‑1 (MQ=255)
ggAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCagag > 1:3161885/1‑100 (MQ=255)
gagaTGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGc < 1:2774602/100‑1 (MQ=255)
gagaTGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGc < 1:1740655/100‑1 (MQ=255)
gagaTGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTATTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCATAATTATTTGCAGAGc < 2:4184394/100‑1 (MQ=255)
aTGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAAt < 1:5483550/100‑1 (MQ=255)
aTGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAAt > 1:3399581/1‑100 (MQ=255)
tGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGTTTATCTGTTTTTGACGAGCTTTCTTCATTGCACGCTTAGCCGGTGAGTTATTAGAATTATTTGCAGAGCAATg < 2:1277124/100‑1 (MQ=255)
tGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGTTGTTTTTTCTTGATTGCACGCTTGGCAGGTGAGTTATCAGTATTATTGGCAGAGCAATg > 2:610454/1‑100 (MQ=255)
tGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATg > 1:4043620/1‑100 (MQ=255)
tGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATg < 2:2864893/100‑1 (MQ=255)
tGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATg > 2:4292856/1‑100 (MQ=255)
gACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGt > 1:1346225/1‑100 (MQ=255)
gCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTAc < 1:1512221/100‑1 (MQ=255)
gCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTCAGCGGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTAc < 2:5160251/100‑1 (MQ=255)
cTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACa < 1:3283255/100‑1 (MQ=255)
cTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACa < 2:4103464/100‑1 (MQ=255)
cTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACa > 1:1675543/1‑100 (MQ=255)
tttGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACaa < 2:3570033/100‑1 (MQ=255)
ttGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAAc < 2:3999494/100‑1 (MQ=255)
tGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACg > 1:3951945/1‑100 (MQ=255)
gCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGGGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACgg > 1:1032602/1‑100 (MQ=255)
agagttAACCCGCTGGTTAACTCTTTTGTACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCCGGCGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATATTACAACgggg > 1:4913614/5‑100 (MQ=255)
gagttAACCCGCTGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCGTTGCACGGTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGa > 1:5290164/4‑100 (MQ=255)
gTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACTGGGa > 1:4990148/1‑100 (MQ=255)
tAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTTTTTTTTTTTCTTCATTGAACGCGTAGCAGGTGAGTTATTAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACATCGGGGaaaaa > 2:1615403/1‑100 (MQ=255)
tAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGaaaaa > 1:3103879/1‑100 (MQ=255)
aaCCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGaaaaaa > 2:5073439/1‑100 (MQ=255)
aCCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAAt > 1:4302384/1‑100 (MQ=255)
ccAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATa > 2:2235278/1‑100 (MQ=255)
aGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATaaa < 1:1967894/100‑1 (MQ=255)
gCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAg < 2:5344071/100‑1 (MQ=255)
gCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTGAGCAGGTGAGTTATCAGTATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAg < 1:1644804/100‑1 (MQ=255)
ggTTAACTCTTTTTTTCGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCg > 2:909574/1‑100 (MQ=255)
ggTTAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCg > 1:2993770/1‑100 (MQ=255)
ttAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGAc > 1:2348805/1‑100 (MQ=255)
ttAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAAAGCGGAAAAAATAAAGGCGAc > 1:5218577/1‑100 (MQ=255)
tAACTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGAcc > 2:2595508/1‑100 (MQ=255)
aaCTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCCGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGCGCAATGTTGGAACGGGGAGAAAATAACGTCGcccc > 2:3355047/1‑100 (MQ=255)
aaCTCTTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGAccc < 1:1006480/100‑1 (MQ=255)
ctctTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCAt > 1:5416825/1‑100 (MQ=255)
ctctTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCAt < 2:3920839/100‑1 (MQ=255)
ctctTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCAt > 2:3184699/1‑100 (MQ=255)
tctTTTTGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATa > 1:2903700/1‑100 (MQ=255)
ttttGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTc < 1:4130973/100‑1 (MQ=255)
tttGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCg < 1:4388488/100‑1 (MQ=255)
tGACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCGCa > 2:2065026/1‑100 (MQ=255)
gACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCGCAt > 2:1260788/1‑100 (MQ=255)
gACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCGCAt < 1:2742498/100‑1 (MQ=255)
gACGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGATGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTAAAAAAAAAAAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCGCAt < 2:2990468/100‑1 (MQ=255)
aCGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCGCATg < 2:447712/100‑1 (MQ=255)
cGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCGCATgg > 2:2154928/1‑100 (MQ=255)
cGAGATTTCTTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCGCATgg < 2:2742585/100‑1 (MQ=255)
|
GCTCACAAAGCCCAGCAGACGAGAAATATTCAGCCAACGTTGGGAGATGACGCTTTGCTGTTTTAACCAGCGGGTTAACTCTTTTTGACGAGATTTATTCATTGCACGCTTAGCAGGTGAGTTATCAGAATTATTTGCAGAGCAATGTTACAACGGGGAAAAAATAAAGGCGACCCATAGTCGCATGGTGTCG > NC_000913/930861‑931053
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
