Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,280,134 |
T→G |
F52C (TTT→TGT) |
yjcE → |
putative cation/proton antiporter |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,280,134 | 0 | T | G | 97.8%
| 609.7
/ 1.6
| 178 | F52C (TTT→TGT) | yjcE | putative cation/proton antiporter |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (3/1); new base G (79/95); total (82/96) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.36e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 8.40e-01 |
Only 100 of 179 total aligned reads displayed.
TCACTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAG > NC_000913/4280038‑4280229
|
tCACTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGa < 2:4628113/100‑1 (MQ=255)
tCACTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGa < 2:4627921/100‑1 (MQ=255)
cACTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGAt < 2:1933714/100‑1 (MQ=255)
cTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATcc < 1:5464842/100‑1 (MQ=255)
cTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATcc < 1:5294695/100‑1 (MQ=255)
cTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATcc < 2:1463216/100‑1 (MQ=255)
cTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATcc < 2:2308395/100‑1 (MQ=255)
cTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATcc < 2:2794848/100‑1 (MQ=255)
cGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTg > 2:2895202/1‑100 (MQ=255)
cGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTg < 1:2099200/100‑1 (MQ=255)
ntgtCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGa > 1:4438943/2‑100 (MQ=255)
gtgtCATGCCCTTTCATATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGa < 1:4590438/100‑1 (MQ=255)
gtgtCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGa < 1:785314/100‑1 (MQ=255)
tgtCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGaa < 2:5136714/100‑1 (MQ=255)
tgtCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGaa > 1:476856/1‑100 (MQ=255)
gtCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAAc < 1:5521696/100‑1 (MQ=255)
gtCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAAc < 1:355178/100‑1 (MQ=255)
aTGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGaaaggg > 1:2800946/1‑96 (MQ=255)
aTGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAActct > 2:194108/1‑100 (MQ=255)
cccTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCtttt > 1:5148115/1‑100 (MQ=255)
cccTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCtttt < 2:2989685/100‑1 (MQ=255)
cccTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCtttt > 1:4849842/1‑100 (MQ=255)
ccTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCttttt < 2:3067234/100‑1 (MQ=255)
ccTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCttttt < 1:3767115/100‑1 (MQ=255)
ccTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCttttt > 1:1534616/1‑100 (MQ=255)
cTTTCAGATCCCGCTTTCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTTATCCTGAACTCTTTTTa < 1:2259113/100‑1 (MQ=255)
tttCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAg < 1:5329914/100‑1 (MQ=255)
ttCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGt < 2:50011/100‑1 (MQ=255)
ttCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGt < 2:787337/100‑1 (MQ=255)
tCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTc < 1:3308359/100‑1 (MQ=255)
tCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTc < 1:3849376/100‑1 (MQ=255)
cAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCt < 2:3300108/100‑1 (MQ=255)
gATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGCCGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTg > 1:4348525/1‑100 (MQ=255)
gATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTg > 1:4248028/1‑100 (MQ=255)
aTCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGt < 1:4389219/100‑1 (MQ=255)
aTCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGt > 2:631098/1‑100 (MQ=255)
tCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGtt < 2:579621/100‑1 (MQ=255)
tCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGtt < 2:3679610/100‑1 (MQ=255)
tCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGtt < 2:3944840/100‑1 (MQ=255)
cccGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGttt < 2:5441584/100‑1 (MQ=255)
cgcttccgcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTAt < 2:3698922/100‑1 (MQ=255)
cgcttccgcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTAt < 1:4075366/100‑1 (MQ=255)
gcttccgcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATc > 1:970686/1‑100 (MQ=255)
gcttccgcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATc < 2:1869005/100‑1 (MQ=255)
cttccgcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATcc < 1:1606231/100‑1 (MQ=255)
ttccgcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATccc < 2:978910/100‑1 (MQ=255)
cgcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCccgcc > 2:1212805/1‑100 (MQ=255)
gcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGCGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCccgccg < 2:4164412/100‑1 (MQ=255)
gcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCccgccg > 1:3736262/1‑100 (MQ=255)
gcttATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCccgccg < 1:4476311/100‑1 (MQ=255)
aTGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTTGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGc < 2:2445755/100‑1 (MQ=255)
aTGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGc < 1:2567314/100‑1 (MQ=255)
tGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCt > 1:1976573/1‑100 (MQ=255)
tGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCt > 2:4228210/1‑100 (MQ=255)
gCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTg > 1:1022219/1‑100 (MQ=255)
gCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTg > 1:4530235/1‑100 (MQ=255)
cAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGt < 2:41387/100‑1 (MQ=255)
cAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGt > 1:3282493/1‑100 (MQ=255)
aaaTCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGtt > 2:3377150/1‑100 (MQ=255)
aaTCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTc > 1:1040681/1‑100 (MQ=255)
aaTCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTc < 1:2245374/100‑1 (MQ=255)
aTCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCg > 1:874512/1‑100 (MQ=255)
gCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTg < 1:2049482/100‑1 (MQ=255)
cATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGAt > 1:1887161/1‑100 (MQ=255)
aTCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATg > 1:1962085/1‑100 (MQ=255)
aTCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATg > 2:1842322/1‑100 (MQ=255)
cGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGc > 1:683829/1‑100 (MQ=255)
gTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTg > 2:47710/1‑100 (MQ=255)
gTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTg < 2:2244227/100‑1 (MQ=255)
tGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTgg < 2:1421232/100‑1 (MQ=255)
gcgcTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGa < 2:3983082/100‑1 (MQ=255)
cgcTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGaa > 1:1400929/1‑100 (MQ=255)
cgcTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGaa > 2:23116/1‑100 (MQ=255)
cgcTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGGGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGaa < 2:1324374/100‑1 (MQ=255)
tACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAAc > 2:4822006/1‑100 (MQ=255)
cTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGc > 1:2158753/1‑100 (MQ=255)
tGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGcc < 2:2670419/100‑1 (MQ=255)
ggCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCg < 2:863005/100‑1 (MQ=255)
ggCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCg < 2:3464986/100‑1 (MQ=255)
gCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGt > 1:5054969/1‑100 (MQ=255)
ccGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTg < 1:3481339/100‑1 (MQ=255)
ccGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTg < 1:1135731/100‑1 (MQ=255)
gACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGaa > 1:4717183/1‑100 (MQ=255)
tttggtttgCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGTAAACGCCGCCCCGTGAATTtc > 2:4352336/1‑100 (MQ=255)
ttggtttgCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTtct > 2:2540729/1‑100 (MQ=255)
tggtttgCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTtctc < 1:48223/100‑1 (MQ=255)
tggtttgCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTtctc < 2:3084286/100‑1 (MQ=255)
tggtttgCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTtctc < 2:2659465/100‑1 (MQ=255)
ggtttgCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCTTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAACCGCCGACCCGTGAATTTCTCg < 1:1449273/100‑1 (MQ=255)
ggtttgCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTATTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTCCATGTTCGCTGATGCCTGGATAACGCCGGCCCGTGAGTTTCTCg > 2:5216342/1‑100 (MQ=255)
gtttgCATGTGGAGGGTGATCATGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCCGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCgg > 2:151681/1‑99 (MQ=255)
ttgCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTTTTTTTTTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATTTCTGGAAATTGCCGACCCGTGAATTtctcttac > 2:2217423/1‑96 (MQ=255)
ttgCATGTGGAGTGGGATCCTGAACTATTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGATGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAAc > 2:5137541/1‑100 (MQ=255)
tgCATGTGGAGTGTGCTCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACa < 1:1800702/100‑1 (MQ=255)
tgCATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACa < 1:4502713/100‑1 (MQ=255)
cATGTGGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATg > 1:4884392/1‑100 (MQ=255)
tgtgGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGt > 1:3081305/1‑100 (MQ=255)
tgtgGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGt > 2:4461532/1‑100 (MQ=255)
gtgGAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTc < 2:2557756/100‑1 (MQ=255)
ggAGTGTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCga > 2:59495/1‑100 (MQ=255)
|
TCACTCGTGTCATGCCCTTTCAGATCCCGCTTCCGCTTATGCAAATCGCCATCGGTGCGCTACTGGCGTGGCCGACGTTTGGTTTGCATGTGGAGTTTGATCCTGAACTCTTTTTAGTCTTGTTTATCCCGCCGTTGCTGTTCGCTGATGGCTGGAAAACGCCGACCCGTGAATTTCTCGAACATGGTCGAG > NC_000913/4280038‑4280229
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 37 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
