Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
4,403,148 |
A→C |
N371H (AAC→CAC) |
hflK → |
modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 4,403,148 | 0 | A | C | 99.6%
| 850.5
/ NA
| 238 | N371H (AAC→CAC) | hflK | modulator for HflB protease specific for phage lambda cII repressor |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/1); new base C (130/107); total (130/108) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 4.54e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 239 total aligned reads displayed.
CCCGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATAACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATGG > NC_000913/4403050‑4403244
|
cccGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATaa > 2:2974361/1‑100 (MQ=255)
cGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACg > 1:2229725/1‑100 (MQ=255)
gCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACgg > 2:690232/1‑100 (MQ=255)
gCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACgg > 2:2918904/1‑100 (MQ=255)
gCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGAAACCTGATGGTTCTGACGTTAGACCAGATGATGAAAGGTGGTCACGCCCCTGCGGCGAAAAGCGATCACgg > 1:1380622/1‑100 (MQ=255)
aaaGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTg < 1:4922373/100‑1 (MQ=255)
aaaGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTg < 1:2641874/100‑1 (MQ=255)
gTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCa > 1:591842/1‑100 (MQ=255)
gTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCa > 1:133538/1‑100 (MQ=255)
ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAAt > 2:583599/1‑100 (MQ=255)
ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAAt > 1:238843/1‑100 (MQ=255)
ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAAt > 2:4715020/1‑100 (MQ=255)
ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAAt > 1:373378/1‑100 (MQ=255)
ggTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGCTTCTGCCGTTAGACCAGAGGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGCCGAAGAGCGGTCACGGTGCCAGCAAt > 2:4067944/1‑100 (MQ=255)
ttAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATct > 1:4087751/1‑100 (MQ=255)
naaCGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctg > 1:309788/2‑100 (MQ=255)
aaCGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgc < 2:62996/100‑1 (MQ=255)
cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGCGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 2:4479554/1‑100 (MQ=255)
cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg < 2:4994899/100‑1 (MQ=255)
cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 1:3826199/1‑100 (MQ=255)
cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 1:3776975/1‑100 (MQ=255)
cGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATctgctg > 2:3738010/1‑100 (MQ=255)
aTAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCg > 1:1603978/1‑100 (MQ=255)
aaaGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTc > 1:713264/1‑100 (MQ=255)
ggTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgc > 1:152664/1‑100 (MQ=255)
ggTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgc > 1:881359/1‑100 (MQ=255)
ggTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgc > 1:800323/1‑100 (MQ=255)
ggTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgc > 1:5512721/1‑100 (MQ=255)
gTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGTCCAGATGCTGAACGGTGGTAGCGCCTATGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgac > 2:5478080/1‑98 (MQ=255)
gTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTgcc > 2:3159023/1‑100 (MQ=255)
ggCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAACCTGCTGCGTCTgccgc > 1:65104/1‑100 (MQ=255)
ggCAACCAAAAGGATCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTTCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCCGCAATCTGCTGCGTCTgccgc > 2:1637663/1‑100 (MQ=255)
cAAGCTGATGGTTCCGCCGATAGCGCAGATGCTGAAAGGTTGCAGCGCCTCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTACCAGCAACCTGCTGCGTCTACCGCCa < 2:1015022/100‑1 (MQ=255)
cAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCa > 1:1418243/1‑100 (MQ=255)
aCCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGc > 2:5066129/1‑100 (MQ=255)
ccTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGcc < 2:4965818/100‑1 (MQ=255)
cTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCct > 2:760465/1‑100 (MQ=255)
cTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCct > 1:1862630/1‑100 (MQ=255)
tGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCctc > 2:5387392/1‑100 (MQ=255)
tGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCctc < 2:3954976/100‑1 (MQ=255)
gATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGACCCTGCGACGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCctct > 1:5286764/1‑100 (MQ=255)
aTGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCtt < 1:3961686/100‑1 (MQ=255)
tGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtc > 1:3551398/1‑100 (MQ=255)
ggTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtcc < 1:4859130/100‑1 (MQ=255)
tCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTtcctcc < 1:2767568/100‑1 (MQ=255)
cTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCca > 2:5203498/1‑100 (MQ=255)
cTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCca < 2:1180255/100‑1 (MQ=255)
cTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGCTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCca < 1:5057808/100‑1 (MQ=255)
tGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCCGCAATCTGCAGCGTCTGCTGCCAGCACCTtccccacc > 2:4594464/1‑95 (MQ=255)
tGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCcan < 1:1749431/100‑2 (MQ=255)
tGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCcac < 1:3565555/100‑1 (MQ=255)
tGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCcac < 2:2392345/100‑1 (MQ=255)
gCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCcaca < 1:205788/100‑1 (MQ=255)
gTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAAcc < 1:473608/100‑1 (MQ=255)
aGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGt > 2:96783/1‑100 (MQ=255)
aGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGt > 2:4861798/1‑100 (MQ=255)
aGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGt > 2:2792842/1‑100 (MQ=255)
gACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTg > 1:5226394/1‑100 (MQ=255)
ccAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGa < 2:2623800/100‑1 (MQ=255)
cAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGag < 2:5437363/100‑1 (MQ=255)
aGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagc > 2:3691859/1‑100 (MQ=255)
tGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaag < 2:2181328/100‑1 (MQ=255)
tGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaag < 1:5275276/100‑1 (MQ=255)
tGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaag < 1:2996117/100‑1 (MQ=255)
gCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagc < 2:2508348/100‑1 (MQ=255)
gCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagc < 1:584166/100‑1 (MQ=255)
cTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGagcaagca > 2:2003865/1‑100 (MQ=255)
cTGAAAGCTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCTAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTACTCCACAACCAGTGGagcaagta < 2:164270/100‑3 (MQ=255)
tGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGAGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAgcaagcaa > 1:4467962/1‑100 (MQ=255)
gAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac < 1:97847/100‑1 (MQ=255)
gAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac < 2:869782/100‑1 (MQ=255)
gAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac < 2:526848/100‑1 (MQ=255)
gAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac < 2:1408409/100‑1 (MQ=255)
gAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac < 1:2898203/100‑1 (MQ=255)
gAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAac > 2:3221035/1‑100 (MQ=255)
aaaGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAaca < 2:2284958/100‑1 (MQ=255)
aaaGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAaca < 2:3113695/100‑1 (MQ=255)
aaGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAacac > 1:4651323/1‑100 (MQ=255)
aGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAacacn < 2:4178703/100‑2 (MQ=255)
aGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcg < 1:937634/100‑1 (MQ=255)
ggtggtAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcgt > 2:678750/1‑100 (MQ=255)
ggtggtAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcgt < 1:4272125/100‑1 (MQ=255)
ggtAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACAcgtcgt < 1:3182336/100‑1 (MQ=255)
gtAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACgtcgtc < 2:3884126/100‑1 (MQ=255)
tAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTcc < 2:1249720/100‑1 (MQ=255)
aaCGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTcca < 1:5399770/100‑1 (MQ=255)
cgcgCCTGCGGCGAAGATTGGTAGCTGTTCCAGCAATCTGCTGCTTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTccacc < 1:5563516/100‑1 (MQ=255)
ccTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTc < 1:1899510/100‑1 (MQ=255)
ccTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTc > 2:1933207/1‑100 (MQ=255)
cTGCGGCGAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCa > 2:3454029/1‑100 (MQ=255)
ggggcgAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTACTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACATGTCGTCCACGAGTCAgg > 1:5115246/3‑100 (MQ=255)
cggcgAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAggg < 1:4255132/100‑1 (MQ=255)
gAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGat < 2:3552171/100‑1 (MQ=255)
gAAGAGCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGat > 1:4174583/1‑100 (MQ=255)
gagCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGAtatt > 2:3614233/1‑100 (MQ=255)
agCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGAtatta < 1:3346315/100‑1 (MQ=255)
gCGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGAtattat < 2:3335783/100‑1 (MQ=255)
cGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACCACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATg > 2:1653384/1‑100 (MQ=255)
cGATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATg < 2:4852479/100‑1 (MQ=255)
gATCACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGCCGATATTATgg > 1:4916785/1‑100 (MQ=255)
|
CCCGCAAAGTGCTGGTTAACGATAAAGGTGGCAACCTGATGGTTCTGCCGTTAGACCAGATGCTGAAAGGTGGTAACGCCCCTGCGGCGAAGAGCGATAACGGTGCCAGCAATCTGCTGCGTCTGCCGCCAGCCTCTTCCTCCACAACCAGTGGAGCAAGCAACACGTCGTCCACCAGTCAGGGCGATATTATGG > NC_000913/4403050‑4403244
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
