Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F236 I1 R1
|
155 |
93.2 |
2393300 |
97.8% |
2340647 |
180.9 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
605,633 |
A→C |
V85G (GTG→GGG) |
ybdF ← |
DUF419 family protein |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 605,633 | 0 | A | C | 100.0%
| 386.9
/ NA
| 102 | V85G (GTG→GGG) | ybdF | DUF419 family protein |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (0/0); new base C (50/52); total (50/52) |
Only 100 of 102 total aligned reads displayed.
CAGAAATGATATCCATAAAGACTCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACACTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACATCGAACTCCGGGCCAAAAGGCCAGCAAAGCTCGACAAAGGGTAACTCAAGGGCCAGGCGTTTCGCCGTTTCGTG > NC_000913/605409‑605868
|
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cAGAAATGATATCCATAAAGACTCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTg < 2:270940/228‑1 (MQ=255)
aaTGATATCCATAAAGACTCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCGGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAg < 1:452368/232‑1 (MQ=255)
gATATCCATAAAGACTCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTAt < 1:791408/239‑1 (MQ=255)
atCCATAAAGACCCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTg < 1:1020608/218‑1 (MQ=255)
atCCATAAAGACCCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTg > 2:1020608/1‑218 (MQ=255)
cATAAAGACTCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCAtgt > 2:794778/1‑239 (MQ=255)
aaaGACTCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGAt > 2:934708/1‑239 (MQ=255)
aGACTCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATa > 1:582278/1‑238 (MQ=255)
cTCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATAcc < 2:408736/237‑1 (MQ=255)
atCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCGCTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATTCCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATAcc < 1:468767/236‑1 (MQ=255)
tCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATAc > 2:452948/1‑235 (MQ=255)
ccATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTg < 1:1087456/215‑1 (MQ=255)
ccATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTg > 2:1087456/1‑215 (MQ=255)
ccATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATAc > 2:1039156/1‑234 (MQ=255)
tgtgAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATAccc > 1:1013987/1‑233 (MQ=255)
tgtgAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATAccc < 2:1013987/233‑1 (MQ=255)
aGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAAt > 2:1192170/1‑236 (MQ=255)
aaTTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTaa < 1:92007/232‑1 (MQ=255)
aaTTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTg < 2:70784/238‑1 (MQ=255)
cagATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGAtt > 1:26726/1‑239 (MQ=255)
ttACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAAc < 1:1069890/239‑1 (MQ=255)
ttACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAAc < 2:315561/239‑1 (MQ=255)
tACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTCTATTTGCTGATTTAACa > 1:143961/1‑239 (MQ=255)
aCAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAg < 1:1039156/239‑1 (MQ=255)
ggTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGAt > 1:940000/1‑239 (MQ=255)
gTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAgg < 1:1057968/235‑1 (MQ=255)
aaTGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGACATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCg > 2:866815/1‑239 (MQ=255)
aaTGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCg > 2:279845/1‑239 (MQ=255)
aaTGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGAACGAGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCg > 2:482052/1‑239 (MQ=255)
aaTGGTAAGCCAGAAAAATGCGCTATAAGTTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCCCCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGAGCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCg < 2:143961/239‑1 (MQ=255)
ggTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCgg > 1:545093/1‑237 (MQ=255)
tAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACt > 1:1136749/1‑238 (MQ=255)
tAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACt < 1:1196150/238‑1 (MQ=255)
aaGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATGCCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACtt < 1:1126731/238‑1 (MQ=255)
gagaAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGa < 2:1136749/238‑1 (MQ=255)
gagaAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGa < 1:794778/238‑1 (MQ=255)
aaaaTGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGAt < 1:719752/239‑1 (MQ=255)
ataGATTTCCGCTTTAGCCCGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGAcg < 2:557618/239‑1 (MQ=255)
ttCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGt > 2:260160/1‑239 (MQ=255)
tCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTa < 2:582278/239‑1 (MQ=255)
cGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTa > 2:158556/1‑237 (MQ=255)
cGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTa > 1:1121522/1‑237 (MQ=255)
aGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCcgac < 1:158556/239‑1 (MQ=255)
cTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCcgacga < 1:1192170/238‑1 (MQ=255)
cTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCgacgac < 2:161022/239‑1 (MQ=255)
cTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAAATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCcgacga < 1:1194852/238‑1 (MQ=255)
tGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCGCCGACGACa < 2:26726/239‑1 (MQ=255)
gACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGc > 2:620841/1‑239 (MQ=255)
aCGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTg > 1:32505/1‑120 (MQ=255)
aCGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTg < 2:32505/120‑1 (MQ=255)
aCTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTc > 2:656162/1‑126 (MQ=255)
aCTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTc < 1:656162/126‑1 (MQ=255)
aCTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATaaa > 1:75069/1‑239 (MQ=255)
ctctTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTc > 2:1005599/1‑125 (MQ=255)
ctctTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTc < 1:1005599/125‑1 (MQ=255)
tCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTgccgcc > 1:283246/1‑239 (MQ=255)
gcgTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCaa > 1:1099497/1‑239 (MQ=255)
gACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACa > 1:1123189/1‑239 (MQ=255)
aCCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATAccc > 2:1104211/1‑111 (MQ=255)
aCCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATAccc < 1:1104211/111‑1 (MQ=255)
aCCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGa < 2:465152/172‑1 (MQ=255)
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aCCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACa > 2:1006397/1‑238 (MQ=255)
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accaccAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACATCGAACTc < 2:1121522/239‑1 (MQ=255)
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gAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACATCGAACTCCGGGCCAAAAGGCCAGCAAAGCCCGACAAAGGGt > 2:499371/1‑239 (MQ=255)
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cGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGTCAGCCTAAAAATATTGCCGCCAATTTTAAAAACATCGAACTCCGGGCCAAAAGGCCAGCAAAGCTCGCCAAAGGGAAAGTAAAGGGCCCGGCGTTTCGcc > 2:54213/1‑239 (MQ=255)
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cGCCGGGATACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACATCGAACTCCGGGCCAAAAGGCCAGCAAAGCTCGACAAAGGGTAACTCAAGGGCCAGGCGTTTCGcc < 1:1033283/239‑1 (MQ=255)
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tACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACATCGAACTCCGGGCCAAAAGGCCAGCAAAGCTCGACAAAGGGTAACTCAAGGGCCAGGCGTTTCGCCGTTTCGTg < 1:1006397/239‑1 (MQ=255)
tACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACATCGAACTCCGGGCCAAAAGGCCAGCAAAGCTCGACAAAGGGTAACTCAAGGGCCAGGCGTTTCGCCGTTTCGTg < 1:828210/239‑1 (MQ=255)
tACCCTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACATCGAACTCCGGGCCAAAAGGCCAGCAAAGCTCGACAAAGGGTAACTCAAGGGCCAGGCGTTTCGCCGTTTCGTg < 1:452948/239‑1 (MQ=255)
|
CAGAAATGATATCCATAAAGACTCCATGTGAAAGTAATTTTGCGTGCCAGCAGATTACAAGGTTCAACGAGAAATGGTAAGCGAGAAAAATGCGCTATAGATTTCCGCTTTAGCCTGGACGCACTCTTTTTTGATCGCGTTTAGCCAGACCATCAACCACCAGATTCCACGAATCGTTGATCAGATCGCGAAGTAACGCTTCGGAGATTTCTTCGCCGGGATACACTGAAATCCAGTGCTTTTTATTCATGTGATACCCTGGCTTAATGCTTGGGTATATTTGCTGATTTAACAGGGATTTTTGTGGATCGGACTTCAGATTGATAAAGGGGACGCCGCGTAGCTCCGACGACAGCATAAAAATCTTGCCGCCAATTTTAAAAACATCGAACTCCGGGCCAAAAGGCCAGCAAAGCTCGACAAAGGGTAACTCAAGGGCCAGGCGTTTCGCCGTTTCGTG > NC_000913/605409‑605868
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 9 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 33 ≤ ATCG/ATCG < 39 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
