Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
299,214 |
A→C |
F574C (TTC→TGC) |
paoC ← |
PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 299,214 | 0 | A | C | 98.0%
| 505.7
/ 0.8
| 148 | F574C (TTC→TGC) | paoC | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (2/1); new base C (80/65); total (82/66) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 1.00e+00 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 6.96e-01 |
Only 100 of 148 total aligned reads displayed.
CGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACT > NC_000913/299118‑299310
|
cGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCAtt > 1:173482/1‑100 (MQ=255)
ccGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCa > 1:1414018/1‑100 (MQ=255)
ggACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAAt < 1:2918930/100‑1 (MQ=255)
ccGAGCTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctc < 1:4065370/100‑1 (MQ=255)
ccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctn < 1:3260452/100‑2 (MQ=255)
cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct > 1:477075/1‑100 (MQ=255)
cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct < 2:1774358/100‑1 (MQ=255)
cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct > 2:2508772/1‑100 (MQ=255)
cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct > 1:2232264/1‑100 (MQ=255)
cTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTc > 2:736951/1‑100 (MQ=255)
ttCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTcc < 2:2653683/100‑1 (MQ=255)
tctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCg > 1:1325787/1‑100 (MQ=255)
tcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCt > 2:3380268/1‑100 (MQ=255)
cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTg < 1:856871/100‑1 (MQ=255)
cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTg < 2:2896443/100‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTc > 2:3729279/1‑100 (MQ=255)
gTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCa > 1:2661408/1‑100 (MQ=255)
tCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAg < 1:3920088/100‑1 (MQ=255)
gcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTg > 2:1899886/1‑100 (MQ=255)
tATGCACGCCGACCTACACAAAATGCTCGGCAAAGCTCGACTGCTGGTACTATCTGCTAAGTCTTCCGCATTCACAGCTCGCTTCCGCTCCCAGtgttcc > 2:3625167/1‑95 (MQ=255)
tGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgc > 2:3536740/1‑100 (MQ=255)
gCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgcc > 2:1582635/1‑100 (MQ=255)
aCGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTg > 1:3709645/1‑100 (MQ=255)
cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGc > 1:1670107/1‑100 (MQ=255)
cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGc > 2:1490974/1‑100 (MQ=255)
cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGc < 1:143918/100‑1 (MQ=255)
cGCCGACCTCCACAAAAGGCCCGGCAAAGTTGGACGGCGGGTCCTTTTTTCGCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCTGCTGTCAGTCTGCCGCCTGc < 2:3991885/100‑1 (MQ=255)
gCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCg < 1:801962/100‑1 (MQ=255)
gACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTg < 2:1642338/100‑1 (MQ=255)
gACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTg < 1:1706248/100‑1 (MQ=255)
ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGTCGCCTGCGGTGGc < 1:760488/100‑1 (MQ=255)
ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGc > 2:3138385/1‑100 (MQ=255)
ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGc > 1:2360423/1‑100 (MQ=255)
cTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCt > 1:3442921/1‑100 (MQ=255)
cTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCt < 1:3990623/100‑1 (MQ=255)
tCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCtt > 2:1358266/1‑100 (MQ=255)
ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTGCGCATTCAATGCTCTCTTCCACTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc > 2:3936599/1‑100 (MQ=255)
cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 2:1342942/100‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 2:915599/100‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 1:2373144/100‑1 (MQ=255)
caAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCTCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg < 2:72827/100‑1 (MQ=255)
caAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg > 1:3118604/1‑100 (MQ=255)
caAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg > 1:253203/1‑100 (MQ=255)
caAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTACTGCTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCCTTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATg < 2:2609658/100‑1 (MQ=255)
aaaTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTa > 2:347001/1‑100 (MQ=255)
cccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTg > 1:3572143/1‑100 (MQ=255)
ccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTgg < 2:2378722/100‑1 (MQ=255)
cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 2:2620871/100‑1 (MQ=255)
cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc > 2:1309653/1‑100 (MQ=255)
cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc > 2:1101685/1‑100 (MQ=255)
cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 1:2290237/100‑1 (MQ=255)
cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc > 2:558392/1‑100 (MQ=255)
cGGCAAAGGCCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCATCCGCTGGCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 2:3048460/100‑1 (MQ=255)
cAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCt > 2:1715171/1‑100 (MQ=255)
aaaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGCCTTCATGTAGCGTGGCGCtt < 2:1018896/100‑1 (MQ=255)
aaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTc > 2:3362120/1‑100 (MQ=255)
ggTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCgg < 2:2884150/100‑1 (MQ=255)
gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg < 1:3483714/100‑1 (MQ=255)
gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg < 1:1554163/100‑1 (MQ=255)
gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg > 1:3070105/1‑100 (MQ=255)
gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg > 1:1201654/1‑100 (MQ=255)
gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg < 2:2052449/100‑1 (MQ=255)
cGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTa < 1:3798447/100‑1 (MQ=255)
aCTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTAcc < 1:1248469/100‑1 (MQ=255)
aCTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTAcc < 2:1669012/100‑1 (MQ=255)
gctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGtt > 1:2432580/1‑100 (MQ=255)
gctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTCCGGGTACCGtt > 2:3191674/1‑100 (MQ=255)
ctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTg < 2:22410/100‑1 (MQ=255)
ctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTg < 1:1953444/100‑1 (MQ=255)
tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg > 2:872021/1‑100 (MQ=255)
tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 1:1050398/100‑1 (MQ=255)
tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg > 1:3442988/1‑100 (MQ=255)
tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 2:338141/100‑1 (MQ=255)
ggTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGt > 1:2173735/1‑100 (MQ=255)
ggTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGt < 2:3063688/100‑1 (MQ=255)
gTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTa < 2:2951326/100‑1 (MQ=255)
aCTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAAt > 1:3955935/1‑100 (MQ=255)
aCTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAAt < 1:3463225/100‑1 (MQ=255)
ctctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATc > 1:4008200/1‑100 (MQ=255)
cgctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATc < 1:3690203/98‑1 (MQ=255)
tctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCt > 2:3794291/1‑100 (MQ=255)
tctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCt > 1:4019944/1‑100 (MQ=255)
ctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCtt > 2:2333002/1‑100 (MQ=255)
tttGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTg < 1:3165736/100‑1 (MQ=255)
tttGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTg > 2:2005936/1‑100 (MQ=255)
tttGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTg > 2:2716039/1‑100 (MQ=255)
cTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGt > 2:670022/1‑100 (MQ=255)
cTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGt > 1:355649/1‑100 (MQ=255)
cTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGt > 1:907306/1‑100 (MQ=255)
cAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCg < 1:2852779/100‑1 (MQ=255)
cAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCg > 1:331476/1‑100 (MQ=255)
aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 1:1347564/100‑1 (MQ=255)
aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 2:3357945/100‑1 (MQ=255)
aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 1:3906698/100‑1 (MQ=255)
tgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCa < 1:1034106/100‑1 (MQ=255)
gtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCaa > 1:1004901/1‑100 (MQ=255)
tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc > 1:4019362/1‑100 (MQ=255)
tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc > 2:473744/1‑100 (MQ=255)
tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc > 1:2078678/1‑100 (MQ=255)
ccGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACt > 2:1608732/1‑100 (MQ=255)
|
CGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACT > NC_000913/299118‑299310
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 12 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
