Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I52 R1
|
239 |
220.4 |
11079197 |
93.2% |
10325811 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
299,214 |
A→C |
F574C (TTC→TGC) |
paoC ← |
PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 299,214 | 0 | A | C | 98.0%
| 697.9
/ 0.6
| 197 | F574C (TTC→TGC) | paoC | PaoABC aldehyde oxidoreductase, Moco‑containing subunit |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base A (1/3); new base C (113/80); total (114/83) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 3.12e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 1.00e+00 |
Only 100 of 197 total aligned reads displayed.
ACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACT > NC_000913/299117‑299310
|
cGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTCCTCTTTGCTCAGTGTTCCGCAtt > 2:1582475/1‑100 (MQ=255)
gCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTc > 1:3377879/1‑100 (MQ=255)
ccGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCa < 1:3722879/100‑1 (MQ=255)
ccGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCa < 2:2934565/100‑1 (MQ=255)
ggACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAAt < 2:3939980/100‑1 (MQ=255)
gcccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACACAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGc < 1:4609253/99‑1 (MQ=255)
aCCCGCACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGc < 2:2465812/100‑1 (MQ=255)
aCCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGc < 1:5497560/100‑1 (MQ=255)
aCCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGc < 1:3213961/100‑1 (MQ=255)
cccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGct > 2:876259/1‑100 (MQ=255)
cccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGct > 1:5061615/1‑100 (MQ=255)
ccGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctc > 1:2105132/1‑100 (MQ=255)
cGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGctct > 1:3065643/1‑100 (MQ=255)
ttCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTcc > 2:4362387/1‑100 (MQ=255)
ttCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTcc < 2:1763746/100‑1 (MQ=255)
tctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCg < 1:2841487/100‑1 (MQ=255)
ctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCga > 2:2814437/1‑99 (MQ=255)
ctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGc < 1:4967114/100‑1 (MQ=255)
ctcCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGc < 1:4074437/100‑1 (MQ=255)
cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCgaga > 1:1624681/1‑97 (MQ=255)
cccGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTg < 2:3553351/100‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGTCAAAGGTCGACTCCTGCTACTCTTTGCTCATTGTTTCGCATTCAATGCTCGCTTCCGCTGTc > 2:1090375/1‑100 (MQ=255)
cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTc < 2:596316/100‑1 (MQ=255)
cGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTc < 2:170373/100‑1 (MQ=255)
tCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAg < 1:5567251/100‑1 (MQ=255)
cgcgCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGt > 1:1845500/1‑100 (MQ=255)
gcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTg < 2:2917738/100‑1 (MQ=255)
gcTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTg > 1:2674510/1‑100 (MQ=255)
tGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgc > 2:2226228/1‑100 (MQ=255)
gCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgcc > 2:4844028/1‑100 (MQ=255)
gCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTgccgcc < 2:3844054/100‑1 (MQ=255)
cACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCt > 2:2650743/1‑100 (MQ=255)
cGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTgn < 1:1497140/100‑2 (MQ=255)
aCCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTgg > 1:514696/1‑100 (MQ=255)
ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGc > 2:1190208/1‑100 (MQ=255)
ccTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGc < 1:2249357/100‑1 (MQ=255)
cTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCt < 1:314619/100‑1 (MQ=255)
cTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCt < 1:4565627/100‑1 (MQ=255)
tCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCtt > 1:48833/1‑100 (MQ=255)
tCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCtt > 1:2652883/1‑100 (MQ=255)
ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc > 2:3086874/1‑100 (MQ=255)
ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc > 1:1121367/1‑100 (MQ=255)
ccACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTc > 1:2977278/1‑100 (MQ=255)
cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 2:1483590/100‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 1:2529323/100‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 2:2072025/100‑1 (MQ=255)
cacaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCa < 1:278940/100‑1 (MQ=255)
acaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCAt > 1:494240/1‑100 (MQ=255)
acaAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCAt < 1:4163289/100‑1 (MQ=255)
aaaaTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGGTCAGTGTTACGCATTCAATGCTCTCTTACGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGt < 1:5180484/100‑1 (MQ=255)
aaTGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAg < 1:1320095/100‑1 (MQ=255)
gCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGt > 1:3189573/1‑100 (MQ=255)
ccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCCTGTAGCGTgg > 2:3010163/1‑100 (MQ=255)
ccGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTgg < 2:428455/100‑1 (MQ=255)
cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 2:48311/100‑1 (MQ=255)
cGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgc < 2:3144778/100‑1 (MQ=255)
ggCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgcg > 1:2433334/1‑100 (MQ=255)
ggCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgcg < 2:3414950/100‑1 (MQ=255)
gCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGgcgc > 1:1214552/1‑100 (MQ=255)
cAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCt > 1:3294833/1‑100 (MQ=255)
aaaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt > 1:3236002/1‑100 (MQ=255)
aaaGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCtt > 2:504999/1‑100 (MQ=255)
tctgTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTc < 1:5272815/97‑1 (MQ=255)
aGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCg < 1:238938/100‑1 (MQ=255)
aGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCg < 1:520981/100‑1 (MQ=255)
ggTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCgg < 1:3509990/100‑1 (MQ=255)
ggTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCgg < 2:4722619/100‑1 (MQ=255)
gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg < 1:6479/100‑1 (MQ=255)
gTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCggg > 1:4801794/1‑100 (MQ=255)
tCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGt < 1:1044501/100‑1 (MQ=255)
gACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTAc > 2:2017659/1‑100 (MQ=255)
ctgctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCCATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCg < 2:1435745/100‑1 (MQ=255)
gctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGtt > 1:3737316/1‑100 (MQ=255)
gctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGtt > 1:191970/1‑100 (MQ=255)
ctgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTg > 2:4823844/1‑100 (MQ=255)
tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 1:2711743/100‑1 (MQ=255)
tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 2:1802015/100‑1 (MQ=255)
tgGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTgg < 2:3346497/100‑1 (MQ=255)
ggTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGt > 2:2311515/1‑100 (MQ=255)
ggTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGt < 2:3681985/100‑1 (MQ=255)
tACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTaa > 1:2912115/1‑100 (MQ=255)
tACTCTTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTaa > 1:355983/1‑100 (MQ=255)
ctctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATc > 1:847864/1‑100 (MQ=255)
ctctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATc > 2:1632681/1‑100 (MQ=255)
tctTTGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCt < 2:3833703/100‑1 (MQ=255)
tttGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTg < 2:2728119/100‑1 (MQ=255)
tGCTCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGcg < 1:2039509/100‑2 (MQ=255)
gCTCGGTGTTCCGCCTTCCCTGCTCTCTTACGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCg < 2:251867/100‑1 (MQ=255)
tCAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTc < 1:2649819/100‑1 (MQ=255)
cAGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCg > 1:3948873/1‑100 (MQ=255)
aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 2:4043802/100‑1 (MQ=255)
aGTGTTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCgg < 1:4933278/100‑1 (MQ=255)
gtgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCTGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGc > 2:5115879/1‑100 (MQ=255)
gtgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGc > 2:201957/1‑100 (MQ=255)
gtgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGc > 1:3727444/1‑100 (MQ=255)
gtgtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGc > 2:659521/1‑100 (MQ=255)
gtTCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCaa > 1:2008051/1‑100 (MQ=255)
tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc > 1:1903741/1‑100 (MQ=255)
tCCGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAAc < 1:763987/100‑1 (MQ=255)
ccGCATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGTGTGGCGCTTCGGGTACGGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAACCt > 2:1103011/1‑100 (MQ=255)
|
ACGCCGGACCCGAACTTCTCCCGTCGCGCTATGCACGCCGACCTCCACAAAATGCCCGGCAAAGGTCGACTGCTGGTACTCTTTGCTCAGTGTTCCGAATTCAATGCTCTCTTCCGCTGTCAGTCTGCCGCCTGCGGTGGCTTCATGTAGCGTGGCGCTTCGGGTACCGTTGGTAATCTTGCCGTCGGCAAACT > NC_000913/299117‑299310
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
