Sample Resequencing Stats
Note: The mutation counts shown below represent unfiltered mutation sets.
| ALE, Flask, Isolate |
Predicted Mutations |
Mean Coverage |
Total Reads |
Percent Mapped |
Mapped Reads |
Average Read Length |
|
A7 F422 I53 R1
|
229 |
158.0 |
8090706 |
91.1% |
7370633 |
100.0 |
Breseq alignment
BRESEQ :: Evidence
|
| evidence |
seq id |
position |
mutation |
annotation |
gene |
description |
| RA |
NC_000913 |
313,275 |
T→G |
intergenic (‑33/+441) |
ykgR ← / ← ykgP |
uncharacterized protein/pseudogene, oxidoreductase family |
|
| |
seq id |
position |
ref |
new |
freq |
score (cons/poly) |
reads |
annotation |
genes |
product |
| * | NC_000913 | 313,275 | 0 | T | G | 98.7%
| 515.1
/ ‑2.4
| 149 | intergenic (‑33/+441) | ykgR/ykgP | uncharacterized protein/pseudogene, oxidoreductase family |
| Reads supporting (aligned to +/- strand): ref base T (2/0); new base G (66/80); total (69/80) |
| Fisher's exact test for biased strand distribution p-value = 2.09e-01 |
| Kolmogorov-Smirnov test that lower quality scores support variant p-value = 9.54e-01 |
Only 100 of 149 total aligned reads displayed.
ATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATT > NC_000913/313178‑313371
|
aTTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCg < 2:758222/100‑1 (MQ=255)
tGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTa > 1:1528920/1‑100 (MQ=255)
tGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTa > 1:2471473/1‑100 (MQ=255)
gCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTaa > 1:938718/1‑100 (MQ=255)
cGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAg > 1:2520026/1‑100 (MQ=255)
cGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAg < 2:673623/100‑1 (MQ=255)
cGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAg < 2:129221/100‑1 (MQ=255)
cGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAg > 1:2301082/1‑100 (MQ=255)
cGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAg > 1:2301313/1‑100 (MQ=255)
aaaaaCAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGcc < 1:2955315/100‑1 (MQ=255)
aaaCAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCt < 1:790107/100‑1 (MQ=255)
aacaacGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCtt < 2:1656274/100‑1 (MQ=255)
caacGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTtat > 1:329086/1‑100 (MQ=255)
aacGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTtata > 1:3333266/1‑100 (MQ=255)
ttAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATataaataa > 1:1257340/1‑100 (MQ=255)
tAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAAc > 1:2636404/1‑100 (MQ=255)
aaTCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACg < 2:821553/100‑1 (MQ=255)
aaTCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACg < 2:3927112/100‑1 (MQ=255)
aTCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGa > 2:2313856/1‑100 (MQ=255)
tCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAg > 2:2312960/1‑100 (MQ=255)
gTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGttt > 1:3286549/1‑100 (MQ=255)
gTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGttt < 2:640716/100‑1 (MQ=255)
gTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAACTGCCCTTATATAAATAACGAGttt > 2:1440943/1‑100 (MQ=255)
ttATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTgg < 1:559599/100‑1 (MQ=255)
tATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGt < 1:1216714/100‑1 (MQ=255)
aTGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTc < 2:2495764/100‑1 (MQ=255)
tGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCa > 1:2240026/1‑100 (MQ=255)
gACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCaa > 1:416446/1‑100 (MQ=255)
cTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAAcc < 2:2057910/100‑1 (MQ=255)
cTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAAcc > 2:979016/1‑100 (MQ=255)
cTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAAcc > 2:4002916/1‑100 (MQ=255)
tGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCa > 2:2626048/1‑100 (MQ=255)
gATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCaa > 1:38695/1‑100 (MQ=255)
gATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCaa > 1:2825250/1‑100 (MQ=255)
ttGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAttt < 2:1991952/100‑1 (MQ=255)
tGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAtttt > 1:610357/1‑100 (MQ=255)
gCTGTACTTCATTATCTTTCATTGGTACTTAGTCGCTTTAAAAAAGATTGAACTGCGTAAGTGCACTTATATAGATAACGAGGTTGGTGAACGAAttttt > 2:583808/1‑100 (MQ=255)
gCTGAACTTTATTGTCTTTCATTGGTACTTACTAGAGTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGTCCTTATATTAATAACGAGGTTGGTCAACTAActtgt > 2:3405727/1‑98 (MQ=255)
ccgatcTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAAtttttt < 1:2928284/95‑1 (MQ=255)
tGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCTCTGCGTAATTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTg < 2:3804853/100‑1 (MQ=255)
tGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTg < 2:478636/100‑1 (MQ=255)
tGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTg < 1:4087024/100‑1 (MQ=255)
gTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAACAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGa < 2:3863705/100‑1 (MQ=255)
gTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGa > 2:3517756/1‑100 (MQ=255)
gTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGa < 2:850070/100‑1 (MQ=255)
gTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGa > 1:1089490/1‑100 (MQ=255)
tACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGAc < 2:3451096/100‑1 (MQ=255)
tACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGAc < 2:3883904/100‑1 (MQ=255)
aCTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACa < 2:2757385/100‑1 (MQ=255)
cTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACAt > 1:2615218/1‑100 (MQ=255)
cTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACAt > 1:1029721/1‑100 (MQ=255)
tttATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATg > 1:3493593/1‑100 (MQ=255)
ttATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGt > 1:2180087/1‑100 (MQ=255)
tATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTa < 2:2782595/100‑1 (MQ=255)
aTTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTACACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTGGACATGTAt > 1:3558303/1‑100 (MQ=255)
tctcTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAAGAACGAGTTTGGTCAGCCAATTTTTTTTCATTTATca > 2:3785745/1‑100 (MQ=255)
tctcTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGACCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATca > 1:2538005/1‑100 (MQ=255)
ctctTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATcac > 2:1359229/1‑100 (MQ=255)
ctctTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATcac < 2:3163410/100‑1 (MQ=255)
ctTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACaa > 1:1010797/1‑100 (MQ=255)
ctTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACaa < 1:2809263/100‑1 (MQ=255)
ttCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAAt > 2:3523740/1‑100 (MQ=255)
tCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAAtt < 1:2396978/100‑1 (MQ=255)
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aTTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTg < 2:1117932/100‑1 (MQ=255)
aTTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTg < 1:418009/100‑1 (MQ=255)
tGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGaa < 2:2146567/100‑1 (MQ=255)
tGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGaa < 1:1606430/100‑1 (MQ=255)
ggTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAAt < 2:42188/100‑1 (MQ=255)
ggTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAAACAATTTTTTGACATGTATAACAAATTTGAAt > 1:3980683/1‑100 (MQ=255)
gTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATa < 2:3590897/100‑1 (MQ=255)
gTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATa > 2:1582728/1‑100 (MQ=255)
gTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATa < 1:3754995/100‑1 (MQ=255)
aCTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCACTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGa < 2:989494/100‑1 (MQ=255)
cTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTTCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGAt < 2:3453868/100‑1 (MQ=255)
cTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGAt < 2:2052266/100‑1 (MQ=255)
cTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGAt > 1:3129960/1‑100 (MQ=255)
ccTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTTTCTTTTATCACAAATTTGAATAGATGTa > 2:2655842/1‑100 (MQ=255)
cTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTAt < 1:1601494/100‑1 (MQ=255)
gCTTTAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTAc > 1:612596/1‑100 (MQ=255)
ttAAAAAAGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATc < 1:774985/100‑1 (MQ=255)
aaaaaaGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCaa > 1:740884/1‑100 (MQ=255)
aaaaaaGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCaa < 1:358530/100‑1 (MQ=255)
aaaaaGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATGTAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAAc < 1:1874212/100‑1 (MQ=255)
aaaaaGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAAc < 1:1609790/100‑1 (MQ=255)
aaaaaGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAAc > 2:1483925/1‑100 (MQ=255)
aaaaGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACt < 1:3135846/100‑1 (MQ=255)
aaaGAGTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTa < 1:248509/100‑1 (MQ=255)
gTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCttt < 1:3963308/100‑1 (MQ=255)
gTGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCttt < 1:371490/100‑1 (MQ=255)
tGCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCtttt > 2:2256038/1‑100 (MQ=255)
gCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTa < 2:2481255/100‑1 (MQ=255)
gCACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACGATCTTTTa > 2:1471614/1‑100 (MQ=255)
cACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAt > 1:3349686/1‑100 (MQ=255)
cACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAt < 1:457549/100‑1 (MQ=255)
cACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAt < 1:2395627/100‑1 (MQ=255)
cACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAt > 1:2111681/1‑100 (MQ=255)
cACTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAt < 2:1537816/100‑1 (MQ=255)
aCTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAtt < 1:3479119/100‑1 (MQ=255)
aCTGCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTAtt < 2:3721799/100‑1 (MQ=255)
|
ATTGCGACAAAAACAACGATATTAATCAGTTTATGACTGATTTGCTGTACTTTATTCTCTTTCATTGGTACTTCCTCGCTTTAAAAAAGAGTGCACTTCGTAAGTGCCCTTATATAAATAACGAGTTTGGTCAACCAATTTTTTGACATGTATCACAAATTTGAATAGATGTATTACATCAACTATCTTTTATT > NC_000913/313178‑313371
|
| Alignment Legend |
|---|
Aligned base mismatch/match (shaded by quality score): ATCG/ATCG < 3 ≤ ATCG/ATCG < 22 ≤ ATCG/ATCG < 32 ≤ ATCG/ATCG < 41 ≤ ATCG/ATCG |
Unaligned base: atcg Masked matching base: atcg Alignment gap: ‑ Deleted base: ‑ |
GATK/CNVnator alignment
N/A
